[发明专利]与苦瓜白粉病抗性主效QTL Pm3.1紧密连锁的InDel分子标记与应用在审
申请号: | 202110579872.8 | 申请日: | 2021-05-26 |
公开(公告)号: | CN113151572A | 公开(公告)日: | 2021-07-23 |
发明(设计)人: | 冯诚诚;黄如葵;琚茜茜;梁家作;陈小凤;黄熊娟;黄玉辉;刘杏连 | 申请(专利权)人: | 广西壮族自治区农业科学院 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12N15/11 |
代理公司: | 广西南宁公平知识产权代理有限公司 45104 | 代理人: | 黄宗全 |
地址: | 530007 广西壮族*** | 国省代码: | 广西;45 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 苦瓜 白粉病 抗性 qtl pm3 紧密 连锁 indel 分子 标记 应用 | ||
1.一种苦瓜白粉病抗性主效QTL Pm3.1紧密连锁的InDel分子标记,其特征在于该分子标记为InDel0362,它具有序列表中SEQ.ID.NO.1的碱基序列。
2.根据权利要求1所述的InDel分子标记,其特征在于该分子标记由引物InDel0362 F和InDel0362 R扩增而得,引物InDel0362 F和InDel0362 R分别具有序列表中SEQ.ID.NO.2和SEQ.ID.NO.3的碱基序列。
3.用于扩增权利要求1所述InDel分子标记的引物对,其特征在于:所述引物对包括引物InDel0362 F和InDel0362 R,它们分别具有序列表中SEQ.ID.NO.2和SEQ.ID.NO.3的碱基序列。
4.权利要求3所述的引物对在扩增权利要求1所述InDel分子标记中的应用。
5.根据权利要求4所述的的应用,其特征在于所述扩增中的退火温度为52℃。
6.根据权利要求5所述的的应用,其特征在于所述扩增的反应体系和反应程序为:
反应体系共10μL:1.0μL浓度50ng/μL的模板DNA;10μmol.L-1的上游外引物1.0μL;10μmol.L-1的下游外引物1.0μL;10×buffer 2.0μL;2m mol.L-1的dNTP 2.0μL;50μmol.L-1的MgCl2 0.8μL;Taq酶0.2μL;ddH2O 2.0μL;
PCR反应程序为:94℃预变性5min;94℃变性45s,52℃退火45s,72℃延伸1min;共32个循环;72℃延伸7min;15℃保存备用。
7.一种苦瓜白粉病抗性鉴定的PCR检测试剂盒,其特征在于该试剂盒中包括权利要求3所述的引物对。
8.根据权利要1求7所述的PCR检测试剂盒,其特征在于包括:10μmol.L-1的上游外引物、10μmol.L-1的下游外引物、10×buffer、2m mol.L-1的dNTP、50μmol.L-1的MgCl2、Taq酶。
9.权利要求1所述的InDel分子标记、权利要求3所述的引物对、权利要求7所述的PCR检测试剂盒在苦瓜抗白粉病育种、苦瓜白粉病抗性筛选中的应用。
10.一种苦瓜白粉病抗性的判断方法,其特征在于:通过PCR法检测苦瓜3号染色体上权利要求要求1所述与苦瓜白粉病主效QTL Pm3.1紧密连锁的InDel分子标记的插入缺失情况进行判断;如扩增出仅有277bp片段,则鉴定为高感或感病苦瓜;如扩增出500bp和300bp的特异片段,则鉴定为高抗和抗病苦瓜。
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