[发明专利]一种绵羊PDGFD基因插入/缺失多态性的检测方法、试剂盒和应用在审
| 申请号: | 202110576979.7 | 申请日: | 2021-05-26 |
| 公开(公告)号: | CN113278708A | 公开(公告)日: | 2021-08-20 |
| 发明(设计)人: | 张清峰;苏鹏;蓝贤勇;潘传英;黄洋铭;雒云云;林春建 | 申请(专利权)人: | 天津奥群牧业有限公司 |
| 主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12Q1/6858 |
| 代理公司: | 天津盛理知识产权代理有限公司 12209 | 代理人: | 李晶 |
| 地址: | 301600 天津市静*** | 国省代码: | 天津;12 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 绵羊 pdgfd 基因 插入 缺失 多态性 检测 方法 试剂盒 应用 | ||
1.一种绵羊PDGFD基因插入/缺失多态性的检测方法,其特征在于:包括以下步骤:
以待测绵羊基因组DNA为模板,利用PCR扩增包含绵羊PDGFD基因内含子区插入/缺失多态性位点,将扩增产物进行电泳分型,根据电泳结果鉴定对应插入/缺失多态性位点的基因型;所述插入/缺失多态性位点选自绵羊PDGFD基因NC_040266.1:g.3876993-3877010位18-bp indel多态性位点。
2.根据权利要求1所述的绵羊PDGFD基因插入/缺失多态性的检测方法,其特征在于:所述插入/缺失多态性位点PDGFD采用的PCR扩增引物对为:
上游引物:SEQ NO.1 5’-TCTAACACAAGGCCCTGTCAAT-3’(22nt);
下游引物:SEQ NO.2 5’-TGATGTACGATTGCAAGATCAGTG-3’(24nt)。
3.根据权利要求1所述的绵羊PDGFD基因插入/缺失多态性的检测方法,其特征在于:所述PCR采用的反应程序为:95℃预变性5min;94℃变性30s,68℃退火30s,72℃延伸20s,18个循环,每循环后退火温度减1℃;94℃变性30s,50℃退火30s,72℃延伸20s,25个循环;72℃延伸10min;所述电泳采用质量浓度为3.5%的琼脂糖凝胶。
4.根据权利要求1所述的绵羊PDGFD基因插入/缺失多态性的检测方法,其特征在于:根据电泳结果,插入/缺失多态性位点有三个基因型II、ID和DD,其中插入/插入基因型II表现为252bp一条带纹,插入/缺失基因型ID表现为252bp和234bp两条带纹,缺失/缺失基因型DD表现为234bp一条带纹。
5.根据权利要求1至4任一项所述的绵羊PDGFD基因插入/缺失多态性的检测方法,其特征在于:所述绵羊为澳洲白绵羊。
6.如权利要求1至5任一项所述的绵羊PDGFD基因插入/缺失多态性的检测方法在绵羊育种的分子标记辅助方面中的应用。
7.绵羊PDGFD基因NC_040266.1:g.3876993-3877010位18-bp插入/缺失多态性位点在绵羊育种的分子标记辅助方面中的应用。
8.一种绵羊PDGFD基因插入/缺失多态性的检测试剂盒,其特征在于:所述试剂盒包含用于PCR扩增绵羊PDGFD基因NC_040266.1:g.3876993-3877010位18-bp插入/缺失多态性位点的引物对。
9.根据权利要求8所述的绵羊PDGFD基因插入/缺失多态性的检测试剂盒,其特征在于:所述引物对为:
上游引物:SEQ NO.1 5’-TCTAACACAAGGCCCTGTCAAT-3’(22nt);
下游引物:SEQ NO.2 5’-TGATGTACGATTGCAAGATCAGTG-3’(24nt)。
10.如权利要求8或9所述的检测试剂盒在绵羊育种的分子标记辅助方面中的应用。
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