[发明专利]籼粳杂交水稻的分子标记、引物组及应用

权利要求书

1.籼粳杂交水稻的分子标记扩增引物组的筛选方法，其特征在于，包括以下步骤：

从SSR引物库中，初步筛选出在染色体上均匀分布、条带相对分散的第一组引物对；

从所述第一组引物对中，去除无扩增条带和无多态性的引物对，进一步复筛出多态性好和扩增效果好的第二组引物对；

对所述第二组引物对进行有效性验证，得到第三组引物对；

再对所述第三组引物对进行籼粳杂交水稻特异性筛选，得到引物对A5、引物对B47、引物对D25和引物对I21；

其中，籼粳杂交水稻的分子标记与籼粳杂交水稻的杂交种纯度及特异性相关；

所述引物对A5为SEQ ID NO.5和SEQ ID NO.6所示的两条单链DNA；所述引物对B47为SEQ ID NO.7和SEQ ID NO.8所示的两条单链DNA；所述引物对D25为SEQ ID NO.9和SEQ IDNO.10所示的两条单链DNA；所述引物对I21为SEQ ID NO.11和SEQ ID NO.12所示的两条单链DNA。

2.根据权利要求1所述的筛选方法，其特征在于，与籼粳杂交水稻的杂交种纯度及特异性相关的分子标记为如下（a1）至（a4）中至少一项：

（a1）分子标记SSR1，核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示的DNA分子；

（a2）分子标记SSR2，核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示的DNA分子；

（a3）分子标记SSR3，核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示的DNA分子；

（a4）分子标记SSR4，核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示的DNA分子；

所述分子标记与籼粳杂交水稻的杂交种纯度及特异性相关。

3.根据权利要求2所述的筛选方法，其特征在于，所述引物对A5根据SEQ ID NO.1设计得到；所述引物对B47根据SEQ ID NO.2设计得到；所述引物对D25根据SEQ ID NO.3设计得到；所述引物对I21根据SEQ ID NO.4设计得到。

4.根据权利要求3所述的筛选方法，其特征在于，在对所述第一组引物对和所述第二组引物对进行筛选中，均包括提取水稻幼苗DNA作为模板，以第一组引物对或第二组引物对进行扩增，根据扩增条带在亲本之间是否有差异作为筛选标准的步骤。

5.根据权利要求4所述的筛选方法，其特征在于，对所述第三组引物对特异性筛选的方法包括以籼粳杂交水稻相关品种的DNA为模板进行扩增的步骤。

6.权利要求1~5任一项所述的筛选方法在鉴定籼粳杂交水稻种纯中的应用。

7.权利要求1~5任一项所述的筛选方法在筛选或辅助鉴定高纯度籼粳杂交水稻中的应用。