[发明专利]基于心源性休克大鼠模型的代谢组学分析方法在审
申请号: | 202110561216.5 | 申请日: | 2021-05-22 |
公开(公告)号: | CN113281448A | 公开(公告)日: | 2021-08-20 |
发明(设计)人: | 姜丽;徐国良;李冰涛;张启云;严小军 | 申请(专利权)人: | 江西中医药大学 |
主分类号: | G01N30/86 | 分类号: | G01N30/86;G16B15/30 |
代理公司: | 南昌丰择知识产权代理事务所(普通合伙) 36137 | 代理人: | 吴称生 |
地址: | 330000 江西*** | 国省代码: | 江西;36 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 基于 心源性 休克 大鼠 模型 代谢 分析 方法 | ||
1.基于心源性休克大鼠模型的代谢组学分析方法,其特征在于,步骤如下:
步骤一、采用左冠状动脉前降支近心尖端、远心尖端结扎法复制早、中期心源性休克大鼠模型;
步骤二、基于超高效液相色谱-四级杆飞行时间串联质谱仪,采集大鼠心源性休克早、中期血浆样品的代谢图谱信息;
步骤三、数据预处理;
步骤四、进行多变量统计分析,筛选出有显著性差异的生物标志物群;
步骤五、分析其参与的代谢通路,探讨参附注射液治疗心源性休克早、中期的作用机制。
2.如权利要求1所述的基于心源性休克大鼠模型的代谢组学分析方法,其特征在于,步骤二具体过程如下:
1、血浆样品制备:将冻存大鼠血浆室温解冻,取100ul血浆于1.5mlEP管,加甲醇300ul,涡旋混匀1min,4℃恒温静置3h,离心后取上清液于1.5mlEP管,30℃水浴氮气吹干,保存至-80℃;复溶:加水-甲醇溶液200ul定容,涡旋混匀1min,离心,取上清液于样品瓶,既得;
2、血浆样品测定条件:
(1)质谱条件:电离源温度100℃,锥孔气为氮气,流速50L/h;去溶剂气为氮气,温度400℃,流速800L/h;正离子模式下毛细管电压为3.0kV,锥孔电压为40V,提取锥孔电压为80V,采集时间为0~25min,质量数范围为50~1000Da;负离子模式下毛细管电压为2.5kV,锥孔电压为40V,补偿电压为80V;采用甲酸钠建立质量轴标准曲线,亮氨酸脑啡肽进行实时质量校正;串联质谱碰撞气为氩气,低碰撞能为4eV,高碰撞能为20~40eV;
使用质控样品进行方法验证,质控样品由每个正常样品各取5μL混合而得;样品的检测过程中,每检测7个正常样品后运行1次QC样品以衡量系统的稳定性,样品的检测顺序为随机进行;
(2)色谱条件:其中正离子模式色谱条件:水相A:超纯水(0.1%甲酸),有机相B:乙腈;水相A:超纯水(0.1%甲酸),有机相B:乙腈;梯度洗脱:0~2min,0.1%B;2~6.4min,0.1%~22%B;6.4~9min,22%~35%B;9~22min,35%~100%B;22~24min,100%B;24~32min,100%~90%B;32~34min,90%~0.1%B;34~36min,0.1%B;柱温40℃,样品室温度10℃,流速为0.4ml/min,进样量为1ul。负离子模式色谱条件:水相A:超纯水,0.1%甲酸;有机相B:乙腈;梯度洗脱:0~20min,5%~95%B;20~23min,95%~5%B;柱温40℃;样品室温度10℃;流速为0.3ml/min;进样量为1ul;
(3)测定仪器、色谱柱和图谱采集软件
WatersAcquity UPLC液相色谱系统、Q-TOF SYNAPT G2 HDMS质谱仪和Waters ACQUITYUPLC BEH C18色谱柱,通过MarkerLynx软件采集大鼠心源性休克早、中期血浆样品的代谢图谱。
3.如权利要求1所述的基于心源性休克大鼠模型的代谢组学分析方法,其特征在于,步骤三中,基于ProgenesisQi软件对采集得到的谱图进行峰提取、峰对齐、峰匹配和峰强度校正等,获得包含化合物保留时间和质荷比信息的csv格式文件。
4.如权利要求1所述的基于心源性休克大鼠模型的代谢组学分析方法,其特征在于,步骤四中,利用EZinfo 2.0统计软件进行多变量统计分析,筛选出有显著性差异的生物标志物群。
5.如权利要求4所述的基于心源性休克大鼠模型的代谢组学分析方法,其特征在于,步骤四中,设计好实验分组,将处理后的数据矩阵导入EZinfo 2.0统计软件进行多变量统计分析,进行有监督的偏最小二乘判别分析,对组别进行分类并判别组间差异,选择显著性差异P小于0.05、投影变量大于1的变量作为生物标记物,此时得到其保留时间和质核比信息;基于生物学数据库筛选出大鼠内源性生物标记物并对其进行鉴定。
6.如权利要求1所述的基于心源性休克大鼠模型的代谢组学分析方法,其特征在于,步骤五中,通过Metaboanalyst.ca网站分析其参与的代谢通路,探讨参附注射液治疗心源性休克早、中期的作用机制。
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