[发明专利]一种检测病原微生物的方法及试剂盒在审
申请号: | 202110550261.0 | 申请日: | 2021-05-20 |
公开(公告)号: | CN113136420A | 公开(公告)日: | 2021-07-20 |
发明(设计)人: | 郭文浒;薛怡婷;杨露;浦世珺 | 申请(专利权)人: | 阿吉安(福州)基因医学检验实验室有限公司 |
主分类号: | C12Q1/686 | 分类号: | C12Q1/686 |
代理公司: | 福州市博深专利事务所(普通合伙) 35214 | 代理人: | 董晗 |
地址: | 350108 福建省福州市*** | 国省代码: | 福建;35 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 检测 病原微生物 方法 试剂盒 | ||
1.一种检测病原微生物的试剂盒,其特征在于,包括逆转录酶和Tn5转座酶;
所述逆转录酶为突变型逆转录酶,所述突变型逆转录酶的突变位点为:P55I、D204E、T334S、E566Q、D587N和L607I;
所述Tn5转座酶为突变型Tn5转座酶,所述突变型Tn5转座酶的突变位点为:K54E、I64Y、K160R、K200R和S303G。
2.根据权利要求1所述的检测病原微生物的试剂盒,其特征在于,所述逆转录酶的氨基酸序列如SEQ ID NO.1所示,所述逆转录酶的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示。
3.根据权利要求1所述的检测病原微生物的试剂盒,其特征在于,所述Tn5转座酶的氨基酸序列如SEQ ID NO.3所示,所述Tn5转座酶的核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示。
4.根据权利要求1所述的检测病原微生物的试剂盒,其特征在于,还包括逆转录反应液、Tn5转座酶反应液、引物、混合引物反应液、高保真扩增反应液和高保真扩增酶。
5.根据权利要求1所述的检测病原微生物的试剂盒,其特征在于,还包括高保真扩增反应液,所述高保真扩增反应液包括0.1-5mmol/L的5-碘-2'-脱氧尿苷、0.05-10mol/L三羟甲基氨基甲烷盐酸盐、0.01-0.05%的二甲基亚砜、0.005-0.01%的聚乙二醇和0.1-50mmol/L的柠檬酸二钠。
6.一种检测病原微生物的方法,其特征在于,包括以下步骤:
步骤1、提取样本的DNA和RNA,然后加入无核酸酶水进行孵育;
步骤2、在步骤1所得孵育后的核酸中加入逆转录酶,使RNA逆转录,然后加入Tn5转座酶进行片段化,片段化结束加入终止液停止片段化反应;
步骤3、对步骤2所得产物进行链置换、文库富集、文库纯化和质检后进行测序;
所述逆转录酶为突变型逆转录酶,所述突变型逆转录酶的突变位点为:P55I、D204E、T334S、E566Q、D587N和L607I;
所述Tn5转座酶为突变型Tn5转座酶,所述突变型Tn5转座酶的突变位点为:K54E、I64Y、K160R、K200R和S303G。
7.根据权利要求6所述的检测病原微生物的方法,其特征在于,所述链置换为:在步骤3所得产物中加入引物、高保真扩增反应液和高保真扩增酶进行链置换,替换RNA链。
8.根据权利要求6所述的检测病原微生物的方法,其特征在于,所述样本为血浆、脑脊液、骨髓液、房水、胸腹水、关节积液、组织、尿液、脓肿抽液、肺泡灌洗液、痰液或鼻咽拭子。
9.根据权利要求6所述的检测病原微生物的方法,其特征在于,所述步骤2中取1-5ng步骤1所得孵育后的核酸。
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