[发明专利]生物信息分析工作流多用户云端访问方法、管理系统有效
申请号: | 202110539383.X | 申请日: | 2021-05-17 |
公开(公告)号: | CN113158113B | 公开(公告)日: | 2023-05-12 |
发明(设计)人: | 吕晖;任永永;程志伟;李磊杰;张悦宁 | 申请(专利权)人: | 上海交通大学 |
主分类号: | G06F16/957 | 分类号: | G06F16/957;G06F16/906;G06Q10/0631;G06Q10/10 |
代理公司: | 上海科盛知识产权代理有限公司 31225 | 代理人: | 宣慧兰 |
地址: | 200240 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 生物 信息 分析 工作流 多用户 云端 访问 方法 管理 系统 | ||
1.一种生物信息分析工作流管理系统,其特征在于,基于生物信息分析工作流多用户云端访问方法实现,所述生物信息分析工作流多用户云端访问方法包括:
开发用户根据本地的生物信息分析工作流所需计算参数,建立生物信息分析工作流的参数配置控件,将生物信息分析工作流及参数配置控件上传至云端工作流库中存储,所述参数配置控件用于传递生物信息分析工作流所需计算参数的取值,所述云端工作流库中存储有多个生物信息分析工作流及参数配置控件;
云端访问用户自云端工作流库中选择一个生物信息分析工作流,基于该生物信息分析工作流的参数配置控件,输入生物信息分析工作流所需计算参数的取值,再输入生物医学数据;
通过Web服务器将生物医学数据和所需计算参数的取值传递给计算服务器,计算服务器为生物信息分析工作流分配计算资源,得到生物信息分析工作流对生物医学数据的分析结果,并将分析结果回传给Web服务器;
具体的,所述生物信息分析工作流管理系统包括:计算服务器、Web服务器、云端工作流库、工作流发布模块和分析操作模块;
所述工作流发布模块用于实现工作流发布,在工作流发布模块中,开发用户根据本地的生物信息分析工作流所需计算参数,建立生物信息分析工作流的参数配置控件,并将生物信息分析工作流及参数配置控件上传至云端工作流库中存储;
所述分析操作模块用于实现工作流的选择和数据配置,在分析操作模块中,云端访问用户自云端工作流库中选择一个生物信息分析工作流,基于参数配置控件确定生物信息分析工作流所需计算参数的取值,并输入生物医学数据;
所述Web服务器将生物医学数据和所需计算参数的取值传递给计算服务器,所述计算服务器为生物信息分析工作流分配计算资源,得到生物信息分析工作流对生物医学数据的分析结果,并将分析结果回传给Web服务器;
所述工作流发布模块为可视化的工作流发布模块,在所述工作流发布模块中,开发用户还分别为每个生物信息分析工作流配置了所需计算资源、工作流简介信息和云端用户访问权限;
所述分析操作模块为可视化的分析操作模块,在所述分析操作模块中,对于选定的生物信息分析工作流,基于参数配置控件可视化显示待输入的所需计算参数,包括参数名称和参数可选缺省值,Web服务器以json格式将所需计算参数的取值传递给计算服务器;
还包括可视化的结果管理模块,在所述结果管理模块中,Web服务器将分析结果按照开发用户预设置的结果可视化排版规则进行排版和可视化展示。
2.根据权利要求1所述的生物信息分析工作流管理系统,其特征在于,本地的生物信息分析工作流是开发用户在本地将多个软件串并联建立的分析工作流,生物信息分析工作流按所属类别在云端工作流库中存储。
3.根据权利要求1所述的生物信息分析工作流管理系统,其特征在于,还包括可视化的分类管理模块,所述分类管理模块为工作流发布模块和分析操作模块提供可视化的生物信息分析工作流分类管理,在工作流发布模块上传生物信息分析工作流时可视化的选择生物信息分析工作流所属类别,将生物信息分析工作流按所属类别在云端工作流库中存储,在分析操作模块选择生物信息分析工作流时可视化的展示不同类别的生物信息分析工作流。
4.根据权利要求1所述的生物信息分析工作流管理系统,其特征在于,还包括客户端和用户管理模块,开发用户和云端访问用户通过所述客户端登录Web服务器,所述用户管理模块用于进行用户信息管理和用户权限管理,用户信息包括注册信息、历史上传生物信息分析工作流信息和历史分析结果信息,用户权限包括开发用户权限和云端访问用户权限。
5.根据权利要求4所述的生物信息分析工作流管理系统,其特征在于,所述用户管理模块还设有专家审核单元,所述专家审核单元对开发用户上传的生物信息分析工作流的安全性及参数配置控件的合法性进行审核,通过审核的生物信息分析工作流及参数配置控件存储至云端工作流库,云端用户根据自身的权限对云端工作流库中的生物信息分析工作流进行云端访问和使用。
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