[发明专利]一种基于三维MRI图像的多平面乳腺肿瘤分割方法在审
申请号: | 202110489066.1 | 申请日: | 2021-04-30 |
公开(公告)号: | CN113192036A | 公开(公告)日: | 2021-07-30 |
发明(设计)人: | 王波;范红宾;童守迪;袁鹏;王狄 | 申请(专利权)人: | 哈尔滨理工大学 |
主分类号: | G06T7/00 | 分类号: | G06T7/00;G06T7/11;G06N3/04;G06N3/08 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 150080 黑龙江省哈*** | 国省代码: | 黑龙江;23 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 三维 mri 图像 平面 乳腺 肿瘤 分割 方法 | ||
一种基于三维MRI图像的多平面乳腺肿瘤分割方法,计算机图像处理技术领域;其具体步骤是首先将3D‑MRI图像从不同的投影面切片成2D图像,利用3个改进2D U‑Net网络对每个投影面得到的2D图像进行肿瘤分割,将每个投影面的分割结果按照顺序再堆叠为3D体积,再通过一定的组合规则把每个投影面堆得到的三维体融合成一个,作为最终的3D分割结果。其中改进的2D U‑net网络是在编码器和解码器之间加入了注意力模块,来增强重要的特征(如肿瘤组织特征),从而提高网络的表征能力。基于三维MRI图像的多平面乳腺肿瘤分割方法实现了肿瘤的精准分割,是乳腺肿瘤计算机辅助诊断中重要的临床需求,并且对后续有效分类、选择合适的治疗方案和预测效果具有重要意义。
技术领域
本发明属于计算机图像处理技术领域,涉及一种基于三维MRI图像的乳腺肿瘤分割方法。
背景技术
乳腺癌是目前女性发病率最高的癌症。近年来,磁共振成像(MRI)已被证明是一种有效的乳腺癌筛查方式。特别是对于乳房软组织,它是非侵入性的,提供了扫描身体部位的多视角可视化。最重要的是,它产生了比乳房X光检查和超声检查更高质量的图像。目前,主要的分割方法可分为五大类:基于阈值的,基于区域的,基于轮廓的,基于机器学习的和基于深度学习的方法。随着深度学习的发展,尤其是卷积神经网络的成熟,基于深度学习的方法在医学图像分割方面取得了显著的成就。
分割又根据维度分为两类:二维(2D)方法和三维(3D)方法。事实上,对比这两类方法,3D方法耗时更多,但更具代表性。因此,它更方便和有用的指定所分析的肿瘤的特征。尽管如此,现有的最先进的3D方法仍存在几个缺点。例如,精度低和运行时间长。所以,本发明提出了一种多平面分割方法来实现乳腺肿瘤DCE-MRI的精准分割,是乳腺肿瘤计算机辅助诊断中重要的临床需求,并且对后续有效分类、选择合适的治疗方案和预测效果具有重要意义。
发明内容
针对上述背景内容中现有技术存在的不足,本发明提供一种基于三维MRI图像的多平面乳腺肿瘤分割方法,其特征在于,包括以下步骤:
A,分别从三个投影面(横切面、矢状面和冠状面)的方向对3D-MRI图像切片成若干个2D图像,并进行预处理;
B,将每组2D图像送入其对应所属投影面的深度网络模型进行分割;
C,将每个投影面分割得到的2D切片堆叠成一个三维体,对3个不同的三维体采用合适的组合规则融合在一起,作为最终3D分割结果。
2.根据权利要求1所述的基于三维MRI图像的多平面乳腺肿瘤分割方法,其特征在于,所述的步骤A 中将3D-MRI图像分别从横切面、矢状面和冠状面三个方向进行切片,根据肿瘤标签把原图中含有肿瘤信息的切面输出为2D图像;并对得到的2D切片进行归一化、二值化预处理。
3.根据权利要求1所述的基于三维MRI图像的多平面乳腺肿瘤分割方法,其特征在于,所述的步骤B 中2D图像分割包括以下内容:
A,从每个投影面中分割图像的内部模型为2D-U-net,对分别来自横切面、矢状面和冠状面的2D 切片进行分割;
B,对训练集图像做旋转、镜像等数据增强处理,训练网络,调整网络参数,选择的优化器是自适应矩估计优化器(Adam),损失函数使用Dice函数和二进制交叉熵损失(BCELoss)混合函数,通过不断减少loss来优化网络模型。Loss定义为:
其中,G表示训练数据的真实标签值,P表示当前模型的预测值,Np为P中的像素数。
C,利用测试集在2D-U-net模型进行测试,保留最佳分割模型。
4.根据权利要求1所述的基于三维MRI图像的多平面乳腺肿瘤分割方法,其特征在于,所述的步骤C 中对3个三维体通过组合规则融合成一个3D分割结果,包括以下内容:
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