[发明专利]一种基于三维MRI图像的多平面乳腺肿瘤分割方法在审
申请号: | 202110489066.1 | 申请日: | 2021-04-30 |
公开(公告)号: | CN113192036A | 公开(公告)日: | 2021-07-30 |
发明(设计)人: | 王波;范红宾;童守迪;袁鹏;王狄 | 申请(专利权)人: | 哈尔滨理工大学 |
主分类号: | G06T7/00 | 分类号: | G06T7/00;G06T7/11;G06N3/04;G06N3/08 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 150080 黑龙江省哈*** | 国省代码: | 黑龙江;23 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 三维 mri 图像 平面 乳腺 肿瘤 分割 方法 | ||
1.基于三维MRI图像的多平面乳腺肿瘤分割方法,包括以下步骤:
A,分别从三个投影面(横切面、矢状面和冠状面)的方向对3D-MRI图像切片成若干个2D图像,并进行预处理;
B,将每组2D图像送入其对应所属投影面的深度网络模型进行分割;
C,将每个投影面分割得到的2D切片堆叠成一个三维体,对3个不同的三维体采用合适的组合规则融合在一起,作为最终3D分割结果。
2.根据权利要求1所述的基于三维MRI图像的多平面乳腺肿瘤分割方法,其特征在于,所述的步骤A中将3D-MRI图像分别从横切面、矢状面和冠状面三个方向进行切片,根据肿瘤标签把原图中含有肿瘤信息的切面输出为2D图像;并对得到的2D切片进行归一化、二值化预处理。
3.根据权利要求1所述的基于三维MRI图像的多平面乳腺肿瘤分割方法,其特征在于,所述的步骤B中2D图像分割包括以下内容:
A,从每个投影面中分割图像的内部模型是2D U-net,对分别对来自横切面、矢状面和冠状面的2D切片进行分割;
B,对训练集图像做旋转、镜像等数据增强处理,训练网络,调整网络参数,选择的优化器是自适应矩估计优化器(Adam),损失函数使用Dice函数和二进制交叉熵损失(BCELoss)混合函数,通过不断减少loss来优化网络模型。Loss定义为:
其中,G表示训练数据的真实标签值,P表示当前模型的预测值,NP为P中的像素数。
C,利用测试集在2D U-net模型进行测试,保留最佳分割模型。
4.根据权利要求1所述的基于三维MRI图像的多平面乳腺肿瘤分割方法,其特征在于,所述的步骤C中对三个三维体通过组合规则融合成一个3D分割结果,包括以下内容:
A,每个投影面的分割模型都提供一个由2D切片堆叠在一起的三维体;
B,对来自不同投影面的3个三维体,采用合适的组合规则融合成一个3D体积的分割结果;
C,有多种组合规则,例如:
Q1.“与”:一个体素的类别是由相同体素位置的3个分类器的输出做逻辑“与”操作,即3个相同位置体素全为肿瘤组织时,输出为肿瘤组织;
Q2.“或”:一个体素的类别是由相同体素位置的3个分类器的输出做逻辑“或”操作,即3个相同位置体素中有一个为肿瘤组织时,输出为肿瘤组织;
Q3.“多数票策略”:一个体素的类别是由相同体素位置的3个分类器的输出做投票操作,即3个相同位置体素中有两个及两个以上为肿瘤组织时,输出为肿瘤组织。
5.根据权利要求3所述的2D图像分割的深度网络模型是改进2D U-net,在主干的编码器和解码器之间加入注意力模块,增强重要的特征(如肿瘤组织特征),抑制不重要的特征,从而提高网络的表征能力。
6.根据权利要求5所述的注意力模块,采用空间注意力模块,中间特征图(F)作为模块的输入,分别进行平均池化和最大池化,再进行7*7的卷积,并接着使用sigmod激活函数生成空间注意特征图,最后与输入特征图做乘法得到输出特征图。空间注意模块的输出特征图Fs∈RH×W×C计算如下:
Fs=F×σ(f7×7([MaxPool(F);AvgPool(F)]))
其中,f表示输入特征图,Fs表示输出特征图,f7×7表示内核大小为7的卷积运算,σ表示Sigmoid函数。
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