[发明专利]靶向敲除ATG5基因的gRNA引物、表达系统、细胞株、构建方法有效

专利信息
申请号: 202110479782.1 申请日: 2021-04-30
公开(公告)号: CN113005124B 公开(公告)日: 2023-05-16
发明(设计)人: 白义春;李宁;姚三巧;任文杰;安珍;姜碧杰;李玉春;赵英政;李海斌;董新文 申请(专利权)人: 新乡医学院
主分类号: C12N15/113 分类号: C12N15/113;C12N15/85;C12N5/10;C12N5/071
代理公司: 新乡市挺立众创知识产权代理事务所(普通合伙) 41192 代理人: 林海
地址: 453000*** 国省代码: 河南;41
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摘要:
搜索关键词: 靶向 atg5 基因 grna 引物 表达 系统 细胞株 构建 方法
【权利要求书】:

1.一种ATG5基因敲除用表达系统,其特征在于,由表达载体和报告载体组成;其中表达载体由以第一gRNA引物为拟合引物构建的的第一载体和以第二gRNA引物为拟合引物构建的的第二载体组成;第一载体和第二载体均为CRISPR/Cas9;报告载体为以含有第二靶点的Tar引物为拟合引物构建的SSA-RPG;其中第一gRNA引物靶向第一靶点T1,第一靶点T1序列为AGTGGATAATCTTTATGGCATGG,如SEQ ID NO:1所示;第二gRNA引物靶向第二靶点T2,第二靶点T2序列为TCATGACAACATGCTGACAGTGG,如SEQ ID NO:2所示;

第一gRNA引物的序列为:ATG5-gF1:CACCG AGTGGATAATCTTTATGGCA,如SEQ ID NO:3所示;ATG5-gR1:AAACTGCCATAAAGATTATCCACTC,如SEQ ID NO:4所示;

第二gRNA引物的序列为ATG5-gF2:CACCGTCATGACAACATGCTGACAG,如SEQ ID NO:5所示;ATG5-gR2:AAACCTGTCAGCATGTTGTCATGAC,如SEQ ID NO:6所示;

Tar引物的序列为:ATG5-TF:

GGCCGCCTCGAGCCTCTAATGCTACCACTCAGAGGTCATGACAACATGCTGACAG TGGTGATGAG,如SEQID NO:7所示;

ATG5-TR:

GATCCTCATCACCACTGTCAGCATGTTGTCATGACCTCTGAGTGGTAGCATTAGAG GCTCGAGGC,如SEQID NO:8。

2.一种ATG5基因敲除的人血管内皮细胞株,其特征在于,由如权利要求1所述的表达系统中的第一载体、第二载体和报告载体同时转染HUVEC构建而成。

3.一种如权利要求2所述的ATG5基因敲除的人血管内皮细胞株的构建方法,其特征在于,包括以下操作步骤:

1)构建表达载体和报告载体:

A:构建第一表达载体:

a:合成靶向ATG5的第一靶点T1的第一gRNA引物;

b:将第一gRNA引物拟合,得拟合产物;

c:用BsaⅠ酶切质粒pX330-U6-Chimeric_BB-CBh-hSpCas9即CRISPR/Cas9表达载体,将酶切回收的骨架和拟合产物连接,然后将连接产物转化感受态细菌DH5α,涂含氨苄青霉素的LB固体培养基的平板上,培养后挑取单克隆,接种在含氨苄青霉素LB液体培养基中,培养后离心收集菌体,提取质粒,获得靶向ATG5基因的第一载体,记为ATG5-1.CRISPR/Cas9;

B:合成靶向ATG5的第二靶点T2的第二gRNA引物,按照构建第一表达载体同样的构建方法构建第二表达载体,记为ATG5-2.CRISPR/Cas9;

C:合成含有第二靶点T2的Tar引物,以SSA-RPG为骨架,按照构建第二表达载体同样的构建方法构建报告载体,记为ATG5.SSA-RPG;

2)转染与筛选:

将步骤1)构建的ATG5-1.CRISPR/Cas9、ATG5-2.CRISPR/Cas9和ATG5.SSA-RPG同时转染到HUVEC细胞中,嘌呤霉素筛选后,挑取单克隆,即构建获得ATG5基因敲除的人血管内皮细胞株。

4.如权利要求3所述的ATG5基因敲除的人血管内皮细胞株的构建方法,其特征在于,步骤b中拟合体系是上下游引物各5ul,拟合程序是100℃10分钟,然后放置常温后再放至4℃。

5.如权利要求4所述的ATG5基因敲除的人血管内皮细胞株的构建方法,其特征在于,步骤c中酶切反应体系为:pX330-U6-Chimeric_BB-CBh-hSpCas9 4μL,BsaⅠ0.8μL,CutSmart 4μL,H2O 31.2μL,37℃酶切4小时。

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