[发明专利]基于体外转录和G4-ThT的荧光传感器及其制备与在HBV DNA检测上的应用有效
申请号: | 202110456847.0 | 申请日: | 2021-04-26 |
公开(公告)号: | CN113234798B | 公开(公告)日: | 2023-04-11 |
发明(设计)人: | 丁世家;康李娜;师炜程 | 申请(专利权)人: | 重庆医科大学 |
主分类号: | C12Q1/6825 | 分类号: | C12Q1/6825;C12Q1/70;C12N15/11 |
代理公司: | 上海光华专利事务所(普通合伙) 31219 | 代理人: | 张博 |
地址: | 400016*** | 国省代码: | 重庆;50 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 基于 体外 转录 g4 tht 荧光 传感器 及其 制备 hbv dna 检测 应用 | ||
本发明公开了一种基于体外转录和G4‑ThT的荧光传感器及其制备与在HBV DNA检测上的应用,包括引物1、引物2、两种酶和硫黄素ThT;在逆转录酶作用下靶链与引物1杂交生成第一种DNA双链中间体,该中间体在T7 RNA聚合酶催化作用下体外转录扩增产生短单链RNA;引物2与RNA单链杂交形成RNA‑cDNA,然后在AMV反转录酶的作用下逆转录形成cDNA,得带有富C链的DNA;之后引物1又与带有富C链的DNA杂交生成第二种DNA双链中间体,然后在T7 RNA聚合酶作用下转录出带有RNAG4链的RNA,以此循环反应;RNAG4与硫黄素结合,增强荧光信号,收集荧光信号实现对HBV DNA的检测。本传感器灵敏度高、稳定性强、重现性好。
技术领域
本发明涉及生物技术领域,特别是涉及一种基于体外转录和G4-ThT的荧光传感器及其制备与在HBV DNA检测上的应用。
背景技术
乙型肝炎是肝脏的一种病毒性感染,是一个世界性的公共卫生问题,具有急性和慢性的临床后果。感染乙肝病毒(HBV)的人患肝癌和肝衰竭的风险很高。这种疾病通过血液和体液传播。为了筛选这种病毒,主要使用乙型肝炎表面抗原(HBsAg)和可溶性抗原乙型肝炎e抗原(HBeAg。有时在感染的第一阶段,HBsAg不存在或检测不到。因此,发展超灵敏的方法对早期检测病毒是必要的。对于这种病毒的检测,HBV基因组DNA的检测比HBsAg更可靠。目前,临床上基于这种病毒的DNA分析主要使用荧光定量聚合酶链反应(qPCR)。然而,这种方法费时费力,因此促使研究人员开发快速和高灵敏度的新方法来准确检测HBV DNA。
发明内容
鉴于以上所述现有技术的缺点,本发明的目的在于提供一种基于体外转录和G4-ThT的荧光传感器及其制备与在HBV DNA检测上的应用,用于解决现有技术中HBV DNA检测方法qPCR法费时费力、成本高等问题。
为实现上述目的及其他相关目的,本发明第一方面提供一种基于体外转录和G4-ThT的荧光传感器,包括一对引物链、T7 RNA聚合酶、AMV反转录酶和硫黄素ThT,所述引物链包括DNA单链引物1和引物2,所述引物1包括T7序列部分和与靶链互补序列部分,所述引物2包括富C序列部分和与靶链相同序列部分;
所述靶链可与引物1的互补序列部分杂交,在逆转录酶作用下在引物1和靶链的两端延伸出第一种DNA双链中间体,所述第一种DNA双链中间体包含T7 RNA聚合酶识别位点,可在T7 RNA聚合酶催化作用下体外转录扩增产生大量短单链RNA;所述引物2与RNA单链杂交形成RNA-cDNA,RNA-cDNA在AMV反转录酶的作用下逆转录形成cDNA(互补DNA),得到带有富C链的DNA;之后引物1又能与带有富C链的DNA杂交两边同时延伸成第二种DNA双链中间体,然后在T7 RNA聚合酶作用下转录出带有RNAG4链的RNA产物,以此循环反应,产生大量的RNAG4;RNAG4可与硫黄素ThT结合,使本身荧光量子产率很低的ThT荧光量子产率急剧增高,通过收集荧光信号实现对HBV DNA的检测。
进一步,所述引物1的核苷酸序列为:
5'-AATTCTAATACGACTCACTATAGGGAACGGGGTAAAGGTTCAGATATTG-3'(SEQ ID NO.1)。
进一步,所述引物2的核苷酸序列为:
5'-TCCCAACCCGCCCTACCCAAGCAGGCTTTCACTTTCTCGCCAACT-3'(SEQ IDNO.2)。
进一步,所述靶链的核苷酸序列为:
5'-AAGCAGGCTTTCACTTTCTCGCCAACTTACAAGGCCTTTCTGCGTAAACAATATCTGAACCTTTACCCCGTT-3'(SEQ ID NO.3)。
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