[发明专利]基于体外转录和G4-ThT的荧光传感器及其制备与在HBV DNA检测上的应用有效

专利信息
申请号: 202110456847.0 申请日: 2021-04-26
公开(公告)号: CN113234798B 公开(公告)日: 2023-04-11
发明(设计)人: 丁世家;康李娜;师炜程 申请(专利权)人: 重庆医科大学
主分类号: C12Q1/6825 分类号: C12Q1/6825;C12Q1/70;C12N15/11
代理公司: 上海光华专利事务所(普通合伙) 31219 代理人: 张博
地址: 400016*** 国省代码: 重庆;50
权利要求书: 查看更多 说明书: 查看更多
摘要:
搜索关键词: 基于 体外 转录 g4 tht 荧光 传感器 及其 制备 hbv dna 检测 应用
【权利要求书】:

1.一种基于体外转录和G4-ThT的荧光传感器,其特征在于,包括一对引物链、T7 RNA聚合酶、AMV反转录酶和硫黄素ThT,所述引物链包括DNA单链引物1和引物2,所述引物1包括T7序列部分和与靶链互补序列部分,所述引物2包括富C序列部分和与靶链相同序列部分;

所述引物1的核苷酸序列为:

所述引物2的核苷酸序列为:

所述靶链可与引物1的互补序列部分杂交,在AMV反转录酶作用下在引物1和靶链的两端延伸出第一种DNA双链中间体,所述第一种DNA双链中间体包含T7 RNA聚合酶识别位点,可在T7 RNA聚合酶催化作用下体外转录扩增产生大量短单链RNA;所述引物2与RNA单链杂交形成RNA-cDNA,RNA-cDNA在AMV反转录酶的作用下逆转录形成cDNA,得到带有富C链的DNA;之后引物1又能与带有富C链的DNA杂交两边同时延伸成第二种DNA双链中间体,然后在T7 RNA聚合酶作用下转录出带有RNAG4链的RNA产物,以此循环反应,产生大量的RNAG4;RNAG4可与硫黄素ThT结合,使本身荧光量子产率很低的ThT荧光量子产率急剧增高,通过收集荧光信号实现对HBV DNA的检测。

2.根据权利要求1所述的荧光传感器,其特征在于:所述靶链的核苷酸序列为:

3.一对引物链,用于构建HBV DNA的荧光检测体系,其特征在于:所述引物链包括DNA单链引物1和引物2,所述引物1包括T7序列部分和与靶链互补序列部分,所述引物2包括富C序列部分和与靶链相同序列部分;

所述引物1的核苷酸序列为:

所述引物2的核苷酸序列为:

4.根据权利要求1所述的荧光传感器的制备方法,其特征在于:包括如下步骤:

(1)将DNA单链引物1、引物2、靶链混合,进行预反应,使靶标和引物1预先结合;

(2)加入T7 RNA聚合酶、AMV反转录酶、硫黄素ThT,孵育,进行扩增反应,得荧光检测体系。

5.根据权利要求4所述的制备方法,其特征在于:所述步骤(1)中,所述引物1、引物2的摩尔浓度比为1:(0.25-4);

和/或,所述步骤(1)中,所述靶链的终浓度≥5aM;

和/或,所述步骤(1)中,预反应温度为40-43℃,预反应时间为5-10min。

6.根据权利要求4所述的制备方法,其特征在于:所述步骤(1)中,还需加入预反应缓冲液、dNTP、NTP,所述预反应缓冲液包括:80mM Tris缓冲液,12mM MgCl2,70mMKCl,10mM DTT,10%DMSO,pH为8.5。

7.根据权利要求4所述的制备方法,其特征在于:所述步骤(1)中,用缓冲液将引物1、引物2、靶链分别稀释后,经变性退火后,再混合反应。

8.根据权利要求6所述的制备方法,其特征在于:所述步骤(1)中,缓冲液选自TE缓冲液、TBS缓冲液中的至少一种。

9.根据权利要求7所述的制备方法,其特征在于:所述步骤(1)中,变性温度为90-100℃,变性时间为5-10min;

和/或,所述步骤(1)中,退火温度为0-5℃,退火时间为8-12min。

10.根据权利要求4所述的制备方法,其特征在于:所述步骤(2)中,ThT的终浓度为5-50μM;

和/或,所述步骤(2)中,T7 RNA聚合酶的终浓度为2-4U/μL;

和/或,所述步骤(2)中,AMV反转录酶的终浓度为0.20-0.40U/μL;

和/或,所述步骤(2)中,还需加入核糖核酸酶抑制剂、10×反转录酶缓冲液;

和/或,所述步骤(2)中,孵育温度为40-43℃,孵育时间为80-100min。

下载完整专利技术内容需要扣除积分,VIP会员可以免费下载。

该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息,商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于重庆医科大学,未经重庆医科大学许可,擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作,请联系【客服

本文链接:http://www.vipzhuanli.com/pat/books/202110456847.0/1.html,转载请声明来源钻瓜专利网。

×

专利文献下载

说明:

1、专利原文基于中国国家知识产权局专利说明书;

2、支持发明专利 、实用新型专利、外观设计专利(升级中);

3、专利数据每周两次同步更新,支持Adobe PDF格式;

4、内容包括专利技术的结构示意图流程工艺图技术构造图

5、已全新升级为极速版,下载速度显著提升!欢迎使用!

请您登陆后,进行下载,点击【登陆】 【注册】

关于我们 寻求报道 投稿须知 广告合作 版权声明 网站地图 友情链接 企业标识 联系我们

钻瓜专利网在线咨询

周一至周五 9:00-18:00

咨询在线客服咨询在线客服
tel code back_top