[发明专利]外周血全血长链非编码RNA作为诊断抑郁症的用途有效
申请号: | 202110448352.3 | 申请日: | 2021-04-25 |
公开(公告)号: | CN112921084B | 公开(公告)日: | 2022-07-05 |
发明(设计)人: | 张志珺;张高嘉;孔岩;宋睿泽;师亚晨 | 申请(专利权)人: | 东南大学 |
主分类号: | C12Q1/6883 | 分类号: | C12Q1/6883 |
代理公司: | 北京同辉知识产权代理事务所(普通合伙) 11357 | 代理人: | 张恩慧 |
地址: | 210024 江苏省*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 外周血全血长链非 编码 rna 作为 诊断 抑郁症 用途 | ||
1.外周血全血长链非编码RNA作为标志物在制备抑郁症诊断试剂中的应用,其特征在于,发现四条LncRNA作为特异性诊断抑郁症的生物标志物的新用途,通过对抑郁症及健康受试者外周血全血进行全转录组测序,分析抑郁症及健康受试者差异表达LncRNA,然后再通过qRT-PCR进行扩大样本验证;
所述LncRNA包括AL355075.4-201、AC136475.8-201、AC012076.1-201和SPATA13-AS1-201。
2.根据权利要求1所述的外周血全血长链非编码RNA作为标志物在制备抑郁症诊断试剂中的应用,其特征在于,所述抑郁症的诊断价值试验操作包括以下步骤:
S1、血样采集、全转录组测序、靶基因预测和富集分析;
S2、根据全转录测序结果,筛选出MDD组和健康受试者外周血全血差异表达LncRNA;
S3、设计引物,用于扩增LncRNA的引物序列;
S4、收集全血样品,设置对照试验组;
S5、空腹抽取全血并收集;
S6、全血RNA提取并分析
操作步骤如下:
S61、全血样本采集提取;
S62、测定样本的RNA纯度,电泳检测RNA的完整性;
S7、扩大样本验证,进行RNA反转录
操作步骤如下:
S71、基因组DNA去除
离心管中配置如下混合液,用移液器轻轻吹打混匀;
S72、配置逆转录反应体系
在步骤S71的反应管中直接加入5x HiScript III qRT SuperMix,用移液器轻轻吹打混匀;
S73、进行逆转录反应;
S8、qRT-PCR反应验证
操作步骤如下;
S81、在qPCR管中配置混合液;
S82、进行qPCR反应验证。
3.根据权利要求2所述的外周血全血长链非编码RNA作为标志物在制备抑郁症诊断试剂中的应用,其特征在于,所述步骤S1中血样采集需受试者空腹抽取全血,并在冷冻条件下保存。
4.根据权利要求2所述的外周血全血长链非编码RNA作为标志物在制备抑郁症诊断试剂中的应用,其特征在于,所述步骤S2中差异表达lncRNA,满足pvalues0.05且|log2FC|1为差异基因,其中log21标记为上调基因;log2-1标记为下调基因。
5.根据权利要求2所述的外周血全血长链非编码RNA作为标志物在制备抑郁症诊断试剂中的应用,其特征在于,所述步骤S5中采血后立即混匀,在室温下直立存储2h,后转移至-20℃冷冻24h,保存于-80℃。
6.根据权利要求2所述的外周血全血长链非编码RNA作为标志物在制备抑郁症诊断试剂中的应用,其特征在于,所述步骤S6中RNA样本电泳结果要求具有清晰的5s,18s,28s条带,无明显降解。
7.根据权利要求2所述的外周血全血长链非编码RNA作为标志物在制备抑郁症诊断试剂中的应用,其特征在于,所述步骤S6中RNA样本浓度≥50ng/μL,总量≥1μg,A260/280介于1.8-2.2之间。
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