[发明专利]外周血全血长链非编码RNA作为诊断抑郁症的用途有效

专利信息
申请号: 202110448352.3 申请日: 2021-04-25
公开(公告)号: CN112921084B 公开(公告)日: 2022-07-05
发明(设计)人: 张志珺;张高嘉;孔岩;宋睿泽;师亚晨 申请(专利权)人: 东南大学
主分类号: C12Q1/6883 分类号: C12Q1/6883
代理公司: 北京同辉知识产权代理事务所(普通合伙) 11357 代理人: 张恩慧
地址: 210024 江苏省*** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: 外周血全血长链非 编码 rna 作为 诊断 抑郁症 用途
【权利要求书】:

1.外周血全血长链非编码RNA作为标志物在制备抑郁症诊断试剂中的应用,其特征在于,发现四条LncRNA作为特异性诊断抑郁症的生物标志物的新用途,通过对抑郁症及健康受试者外周血全血进行全转录组测序,分析抑郁症及健康受试者差异表达LncRNA,然后再通过qRT-PCR进行扩大样本验证;

所述LncRNA包括AL355075.4-201、AC136475.8-201、AC012076.1-201和SPATA13-AS1-201。

2.根据权利要求1所述的外周血全血长链非编码RNA作为标志物在制备抑郁症诊断试剂中的应用,其特征在于,所述抑郁症的诊断价值试验操作包括以下步骤:

S1、血样采集、全转录组测序、靶基因预测和富集分析;

S2、根据全转录测序结果,筛选出MDD组和健康受试者外周血全血差异表达LncRNA;

S3、设计引物,用于扩增LncRNA的引物序列;

S4、收集全血样品,设置对照试验组;

S5、空腹抽取全血并收集;

S6、全血RNA提取并分析

操作步骤如下:

S61、全血样本采集提取;

S62、测定样本的RNA纯度,电泳检测RNA的完整性;

S7、扩大样本验证,进行RNA反转录

操作步骤如下:

S71、基因组DNA去除

离心管中配置如下混合液,用移液器轻轻吹打混匀;

S72、配置逆转录反应体系

在步骤S71的反应管中直接加入5x HiScript III qRT SuperMix,用移液器轻轻吹打混匀;

S73、进行逆转录反应;

S8、qRT-PCR反应验证

操作步骤如下;

S81、在qPCR管中配置混合液;

S82、进行qPCR反应验证。

3.根据权利要求2所述的外周血全血长链非编码RNA作为标志物在制备抑郁症诊断试剂中的应用,其特征在于,所述步骤S1中血样采集需受试者空腹抽取全血,并在冷冻条件下保存。

4.根据权利要求2所述的外周血全血长链非编码RNA作为标志物在制备抑郁症诊断试剂中的应用,其特征在于,所述步骤S2中差异表达lncRNA,满足pvalues0.05且|log2FC|1为差异基因,其中log21标记为上调基因;log2-1标记为下调基因。

5.根据权利要求2所述的外周血全血长链非编码RNA作为标志物在制备抑郁症诊断试剂中的应用,其特征在于,所述步骤S5中采血后立即混匀,在室温下直立存储2h,后转移至-20℃冷冻24h,保存于-80℃。

6.根据权利要求2所述的外周血全血长链非编码RNA作为标志物在制备抑郁症诊断试剂中的应用,其特征在于,所述步骤S6中RNA样本电泳结果要求具有清晰的5s,18s,28s条带,无明显降解。

7.根据权利要求2所述的外周血全血长链非编码RNA作为标志物在制备抑郁症诊断试剂中的应用,其特征在于,所述步骤S6中RNA样本浓度≥50ng/μL,总量≥1μg,A260/280介于1.8-2.2之间。

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