[发明专利]一种利用qPCR技术检测绵羊FecB基因多态性的引物组及其方法在审
| 申请号: | 202110446733.8 | 申请日: | 2021-04-25 |
| 公开(公告)号: | CN113373237A | 公开(公告)日: | 2021-09-10 |
| 发明(设计)人: | 王小龙;陈玉林;周世卫;寇启芳 | 申请(专利权)人: | 西北农林科技大学 |
| 主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12Q1/6858;C12N15/11 |
| 代理公司: | 北京科领智诚知识产权代理事务所(普通合伙) 11782 | 代理人: | 陈士骞 |
| 地址: | 712100 陕*** | 国省代码: | 陕西;61 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 利用 qpcr 技术 检测 绵羊 fecb 基因 多态性 引物 及其 方法 | ||
1.用于检测绵羊FecB基因多态性的引物组,其特征在于,所述的引物组由引物对1和引物对2组成,其中,引物对1的下游引物3’端和++型的基因位点相匹配;引物对2的下游引物的3’端和BB型的基因位点相匹配;BB型代表FecB基因的编码区第746位碱基发生A-G的突变(g.A746G),导致第249位氨基酸由谷氨酰胺转变为精氨酸(p.Q249R);++型代表FecB基因的编码区第746位碱基未发生改变,仍为A;
所述引物对的核苷酸序列如下:
引物对1:
上游引物:5’-ATTGGAAAAGGTCGCTATGGG-3’
下游引物:5’-TGCCTCATCAACACCGTCt-3’
引物对2:
上游引物:5’-ATTGGAAAAGGTCGCTATGGG-3’
下游引物:5’-TGCCTCATCAACACCGTCc-3’。
2.含有权利要求1所述引物组的用于检测绵羊FecB基因多态性的试剂盒。
3.根据权利要求2所述的试剂盒,其特征在于,所述的试剂盒还包括荧光染料。
4.根据权利要求3所述的试剂盒,其特征在于,所述的荧光染料为SYBR Green I荧光染料。
5.根据权利要求3所述的试剂盒,其特征在于,所述的试剂盒还包括dNTPs、Taq DNA聚合酶、Mg2+以及PCR反应缓冲液中的一种或多种。
6.一种利用qPCR技术检测绵羊FecB基因多态性的方法,其特征在于,包括以下步骤:
1)提取待测绵羊的基因组DNA;
2)以待测绵羊的基因组DNA为模板,分别进行两个体系的qPCR扩增,体系1采用权利要求1中所述的引物对1,体系2采用权利要求1中所述的引物对2,扩增后待测样品在体系1和体系2中分别产生一个荧光信号强度变化曲线;
3)根据体系1和体系2中检测到的荧光阈值出现的顺序辨别出待测样品的FecB基因型,当体系1先达到荧光阈值时,即可判定待测样品的FecB基因型为++型;当体系2先达到荧光阈值时,即可判定待测样品的FecB基因型为BB型;当体系1和体系2的荧光信号同时达到阈值时,即可判定待测样品的FecB基因型为B+型。
7.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,步骤2)中实时荧光定量PCR反应使用的扩增体系以10μl计为:5-1000ng/μL基因组DNA 1μL,2×SYBR FAST qPCR Master Mix 5μL,10μmol/L上游引物0.3μL,10μmol/L下游引物0.3μL,去离子水3.4μL,总体系为10μL。
8.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,步骤2)中实时荧光定量PCR反应的扩增程序为:95℃预变性10min;95℃变性30sec,60℃退火1min,40个循环。
9.权利要求1所述的引物组在绵羊分子标记辅助育种中的应用。
10.权利要求2-5任一项所述的试剂盒在绵羊分子标记辅助育种中的应用。
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