[发明专利]评估肝谱系细胞成熟度的标志物、双组学试剂盒及构建方法有效
申请号: | 202110391145.9 | 申请日: | 2021-04-12 |
公开(公告)号: | CN113106160B | 公开(公告)日: | 2022-11-01 |
发明(设计)人: | 何志颖;刘中民;王喜城;张文成 | 申请(专利权)人: | 上海市东方医院(同济大学附属东方医院) |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12N15/113 |
代理公司: | 上海专利商标事务所有限公司 31100 | 代理人: | 陈静 |
地址: | 200120 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 评估 谱系 细胞 成熟度 标志 双组学 试剂盒 构建 方法 | ||
1.microRNA标签或基因标签或其组合的检测试剂在制备用于评估肝谱系细胞成熟度的试剂盒或检测装置中的应用,所述评估肝谱系细胞成熟度为区分肝祖细胞和成熟肝细胞,所述microRNA标签包括选自下组的10~17个microRNA:
hsa-let-7a-5p,hsa-let-7e-5p,hsa-let-7i-5p,hsa-mir-7-5p,hsa-let-7f-2-3p,
hsa-mir-181d-5p,hsa-mir-25-3p,hsa-mir-200c-3p,hsa-mir-181c-5p,hsa-mir-181a-5p,
hsa-mir-221-3p,hsa-mir-502-3p,hsa-mir-222-3p,hsa-mir-181b-5p,hsa-mir-590-3p,
hsa-mir-34a-5p,hsa-mir-26a-5p;
所述基因标签包括选自下组的10~23个基因:
PIK3R1,PTEN,ACSL1,ANKRD46,CPEB3,CRY2,
CSF1R,HAND2,HECW2,MEGF9,NHLRC3,NTF3,
PAIP2,PDE4D,PGRMC1,PNRC1,RORA,SLC10A7,
SLC8A1,SPRYD4,TIMP3,TMEM135,TMEM64。
2.如权利要求1所述的应用,其特征在于,所述10~17个microRNA标签中,包括:hsa-let-7a-5p、hsa-let-7e-5p、hsa-let-7i-5p、hsa-mir-7-5p和hsa-let-7f-2-3p中的1~5个。
3.如权利要求2所述的应用,其特征在于,所述10~17个microRNA标签中,包括:hsa-let-7a-5p、hsa-let-7e-5p、hsa-let-7i-5p、hsa-mir-7-5p和hsa-let-7f-2-3p中的2~5个。
4.如权利要求1所述的应用,其特征在于,所述10~23个基因标签中,包括PIK3R1或PTEN。
5.如权利要求1~4任一所述的应用,其特征在于,所述的评估肝谱系细胞成熟度通过检测细胞内所述microRNA标签或基因标签或其组合的表达来进行;所述的microRNA标签表达水平显著高则表明细胞为肝祖细胞,表达水平显著低则表明细胞为成熟肝细胞;所述基因标签表达水平显著高则表明细胞为成熟肝细胞,表达水平显著低则表明细胞为肝祖细胞。
6.如权利要求1所述的应用,其特征在于,所述检测试剂包括:针对所述microRNA标签或所述基因标签的PCR检测试剂、原位杂交试剂或免疫检测试剂。
7.如权利要求6所述的应用,其特征在于,所述检测试剂包括:特异性扩增所述microRNA标签或所述基因标签的引物,特异性识别所述microRNA标签或所述基因标签的探针或特异性结合所述基因标签编码的蛋白的抗体。
8. 如权利要求7所述的应用,其特征在于,所述检测试剂为引物,检测microRNA标签的上游引物的核苷酸序列选自如SEQ ID NO: 18~34所示,检测基因标签的引物的核苷酸序列选自如SEQ ID NO: 35~80所示。
9.如权利要求1所述的应用,其特征在于,所述的检测装置包括:芯片、电泳装置或基因测序仪器。
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