[发明专利]一种硫代寡核苷酸的制备方法有效

专利信息
申请号: 202110351683.5 申请日: 2021-03-31
公开(公告)号: CN113150041B 公开(公告)日: 2022-10-25
发明(设计)人: 宋更申;陈玺朝;姚鹏 申请(专利权)人: 北京悦康科创医药科技股份有限公司
主分类号: C07H1/00 分类号: C07H1/00;C07H21/00;C12N15/10
代理公司: 北京路浩知识产权代理有限公司 11002 代理人: 陈征
地址: 北京市大兴区经济技术开发*** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 一种 寡核苷酸 制备 方法
【权利要求书】:

1.一种硫代寡核苷酸的制备方法,其特征在于,采用固相亚磷酸酰胺三酯法将核苷酸单体按设定的碱基序列,从3′端到5′端的顺序依次进行连接,最后形成以3′,5′-硫代磷酸二酯键连接的寡核苷酸片段,其中,以交联聚苯乙烯珠为固相载体;

所述固相亚磷酸酰胺三酯法包括:

将核苷酸单体在使用前先用乙腈配制成核苷酸溶液;

脱除初始核苷酸C5′-羟基的DMT保护基,所述初始核苷酸预先连接负载在固相载体上;

重复加入C3′-羟基经亚磷酰胺修饰,C5′-羟基被DMT保护的核苷酸单体进行偶联,氧化,羟基保护,脱除DMT保护基的步骤,将核苷酸单体依次连接到所述固相载体的核苷酸上;在所述脱除DMT保护基、偶联、氧化、羟基保护的每一步骤结束后,用乙腈进行冲洗;所述乙腈的水分限量为0-50ppm;

对上述合成产物进行氨解,得到序列长度为15~30个碱基的所述硫代寡核苷酸;

所述氨解的氨解试剂为浓度25~28%的氨水,所述氨水的用量为核苷酸单体总重量的0.8~1.6倍,氨解温度为58~90℃。

2.根据权利要求1所述的硫代寡核苷酸的制备方法,其特征在于,所述氨水的用量为核苷酸单体总重量的0.8~1.6倍,反应温度为60~75℃。

3.根据权利要求1所述的硫代寡核苷酸的制备方法,其特征在于,所述硫代寡核苷酸的序列长度为20个碱基。

4.根据权利要求3所述的硫代寡核苷酸的制备方法,其特征在于,所述硫代寡核苷酸的碱基序列为:

5′-TCCTCCGGAGCCAGACTTCA-3′。

5.根据权利要求1所述的硫代寡核苷酸的制备方法,其特征在于,所述乙腈的水分限量为5-25ppm。

6.根据权利要求1所述的硫代寡核苷酸的制备方法,其特征在于,所述核苷酸单体包括DMT-dA(bz)亚磷酰胺单体、DMT-dC(bz)亚磷酰胺单体、DMT-dG(ib)亚磷酰胺单体和DMT-dT亚磷酰胺单体。

7.根据权利要求6所述的硫代寡核苷酸的制备方法,其特征在于,所述脱除DMT保护基的步骤中使用的脱保护试剂为1~5w/v%的二氯乙酸的甲苯溶液、二氯乙酸的二氯甲烷溶液或二氯乙酸的甲醇溶液。

8.根据权利要求7所述的硫代寡核苷酸的制备方法,其特征在于,所述脱除DMT保护基的步骤中使用的脱保护试剂为3w/v%的二氯乙酸的甲苯溶液。

9.根据权利要求6所述的硫代寡核苷酸的制备方法,其特征在于,所述偶联的步骤中使用5-乙硫基四氮唑作为活化剂;

或所述氧化的步骤中使用氢化黄原素作为氧化剂;

或所述羟基保护的步骤中使用乙酸酐作为保护剂。

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