[发明专利]黄牛CHRDL1基因CNV标记快速辅助检测生长性状的方法及其应用

权利要求书

1.一种检测牛CHRDL1基因拷贝数变异的方法，其特征在于：包括以下步骤：

以牛基因组DNA为模板，以引物对P1以及引物对P2为引物，分别通过实时荧光定量PCR扩增CHRDL1基因的拷贝数变异区域以及作为内参的BTF3基因的部分片段，然后根据定量结果鉴定牛CHRDL1基因的拷贝数变异类型；

所述引物对P1为：

上游引物F1：5’-GCAGCCCATCTTCCACTTTT-3’

下游引物R1：5’-AGCCTGAGATAAGAGGTCTCCA-3’

所述引物对P2为：

上游引物F2：5’-AACCAGGAGAAACTCGCCAA-3’

下游引物R2：5’-TTCGGTGAAATGCCCTCTCG-3’；

所述拷贝数变异类型是根据2*2^-ΔΔCt将定量结果分为的三类：多拷贝型，2*2^-ΔΔCt2；缺失型，2*2^-ΔΔCt2；正常型，2*2^-ΔΔCt＝2；

在皮南牛中，拷贝数变异类型为缺失型的个体在尻长这个生长性状上显著优于正常型及多拷贝型的个体；在秦川牛中，拷贝数变异类型为缺失型的个体在胸深这个生长性状上显著优于多拷贝型的个体；在夏南牛中，拷贝数变异类型为正常型的个体在体重这个生长性状上显著优于缺失型及多拷贝型的个体；在云岭牛中，拷贝数变异类型为缺失型的个体在腰角宽这个生长性状上显著优于多拷贝型的个体。

2.根据权利要求1所述一种检测牛CHRDL1基因拷贝数变异的方法，其特征在于：所述引物对P1的扩增产物片段大小为153bp，引物对P2的扩增产物片段大小为166bp。

3.根据权利要求1所述一种检测牛CHRDL1基因拷贝数变异的方法，其特征在于：所述实时荧光定量PCR的扩增体系包括10ng/μL模板DNA 1μL以及10μmol/L的引物对P1或引物对P2所对应的上、下游引物各0.5μL。

4.根据权利要求1所述一种检测牛CHRDL1基因拷贝数变异的方法，其特征在于：所述实时荧光定量PCR的反应程序为：95℃预变性2min；95℃变性10s，60℃退火20s，39个循环。

5.如权利要求1-4中任意一项权利要求所述的方法在黄牛分子标记辅助选择育种中的应用。