[发明专利]PRDM9转座子融合作为先天性巨结肠疾病标志物的应用

说明书

本发明涉及生物医学领域，具体而言，涉及一种PRDM9转座子融合作为先天性巨结肠疾病标志物的应用。所述PRDM9转座子融合的融合位点选自位于chr5:23299411的PRDM9‑type I；位于chr5:23262356的PRDM9‑type II‑1；以及位于chr5:23245181的PRDM9‑type II‑2。相对于传统诊断方法（钡灌肠等），本方法具有操作简单快速、无介入、通量高、成本低等众多综合优势。

技术领域

本发明涉及生物医学领域，具体而言，涉及一种PRDM9转座子融合作为先天性巨结肠疾病标志物的应用。

背景技术

先天性巨结肠（Hirschsprung disease，HSCR）是一种儿童肠神经发育异常的出生缺陷疾病，病理机制为肠神经嵴细胞迁移和分化成肠神经元发生障碍，导致肠神经缺乏而发生持续性痉挛，是小儿常见的先天性肠道疾病之一。先天性巨结肠的早期表现为呕吐、腹胀、腹泻等，临床上会造成新生儿死亡或手术后反复肠炎、难治性便秘等并发症，严重影响患儿的生长发育和生活质量。

先天性巨结肠的及时诊治可以减少先天性巨结肠肠炎发生的危险，获得良好的预后。该疾病确诊需要术后病变组织的病理切片。术前诊断方法主要为钡剂灌肠，直肠活检、直肠测压，以判断是否要实施“巨结肠根治术”。目前，钡灌肠为最重要的诊断方法，原理为先天性巨结肠患儿的肠道存在无神经节段的狭窄、近端的扩张，钡灌肠后可见扩张和狭窄段而诊断为巨结肠，但该方法只能诊断出有典型肠道形态改变的患儿，灵敏度需要提高，诊断的准确度80%左右。直肠活检是直接取直肠组织，检测是否有神经节细胞的缺失，准确率高，但取样部位对结果有影响，但该方法为介入有创型，且价格非常高，一般情况下该方法应用于钡灌肠不明显，或不适用的患儿，比如当患儿有坏死性小肠结肠炎（NEC）这种可能的时候，钡灌肠会导致肠穿孔，这种时候不适合用钡灌肠去诊断，才考虑用直肠活检。直肠测压是通过检测肛门内括约肌的松弛缺乏判定肠神经的支配异常，仅为辅助诊断方法，假阳性和假阴性都较多，不能用于单独检测。

有鉴于此，特提出本发明。

发明内容

为克服上述现有技术的缺点，本发明的目的在于提供一种先天性巨结肠诊断标记物及其应用，为先天性巨结肠的诊断提供了一种新的准确、灵敏的检测途径。

为了达到上述目的，本发明采用以下技术方案予以实现：

本发明的第一方面涉及PRDM9转座子融合的定量检测剂在制备先天性巨结肠诊断试剂或试剂盒中的应用；

所述PRDM9转座子融合的融合位点选自：

位于chr5: 23299411的PRDM9-type I；

位于chr5:23262356的PRDM9-type II-1；以及

位于chr5: 23245181的PRDM9-type II-2。

可选的，如上所述的应用，所述定量检测剂用于执行以下任一种方法：

聚合酶链反应、变性梯度凝胶电泳、核酸分型芯片检测、变性高效液相色谱法、原位杂交、生物质谱法以及HRM法。

可选的，如上所述的应用，所述定量检测剂为引物。

可选的，如上所述的应用，所述引物包括a~c中的至少一种：

a. 用于检测PRDM9-type I的SEQ ID NO：1~2；

b. 用于检测PRDM9-type II-1的SEQ ID NO：3~4；以及

c. 用于检测PRDM9-type II-2的SEQ ID NO：5~6。