[发明专利]载体生产周期的预估方法、计算机存储介质及电子设备有效
申请号: | 202110271778.6 | 申请日: | 2021-03-12 |
公开(公告)号: | CN113096731B | 公开(公告)日: | 2022-01-11 |
发明(设计)人: | 胡杨俊;韩永红;丘佳倩;蓝田 | 申请(专利权)人: | 云舟生物科技(广州)有限公司 |
主分类号: | G16B30/00 | 分类号: | G16B30/00 |
代理公司: | 广州国鹏知识产权代理事务所(普通合伙) 44511 | 代理人: | 葛红 |
地址: | 510663 广东省广州市黄埔区科*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 载体 生产 周期 预估 方法 计算机 存储 介质 电子设备 | ||
1.一种载体生产周期的预估方法,其特征在于,包括以下步骤:
S1、获取需要插入载体的基因序列的序列信息;
S2、判断所述基因序列的长度是否大于第一设定值,当所述基因序列的长度小于等于所述第一设定值时,所述载体的生产周期为第一时间,当所述基因序列的长度大于所述第一设定值时,执行步骤S3;
S3、计算所述基因序列的长度与所述第一设定值的差值,所述差值n为大于0的整数,所述差值n每增加1KB,所述载体的生产周期在所述第一时间的基础上增加第一时间段,所述载体的生产周期为第二时间,所述第二时间为所述第一时间与n个所述第一时间段之和;
S4、判断所述基因序列的长度是否大于第二设定值,所述第二设定值大于所述第一设定值,当所述基因序列的长度小于等于所述第二设定值时,所述载体的生产周期为第二时间,当所述基因序列的长度大于所述第二设定值时,执行步骤S5;
S5、判断所述基因序列是否符合第一条件和第二条件,当所述基因序列不符合所述第一条件和所述第二条件时,所述载体的生产周期为第三时间,所述第三时间为在所述第二时间的基础上增加一个第二时间段;当所述基因序列符合所述第一条件和所述第二条件中的任何一个时,所述载体的生产周期为在所述第二时间的基础上增加两个第二时间段;当所述基因序列同时符合第一条件和第二条件时,所述载体的生产周期为在第二时间的基础上,最多增加两个所述第二时间段;
其中,所述第一条件为所述基因序列中GC含量大于设定比例,所述第二条件为所述基因序列中存在重复序列。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述重复序列包括:连续超过15个单一碱基的序列。
3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述重复序列还包括:多个碱基段连续重复8次以上的序列,每个所述碱基段包括2-10个碱基。
4.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述重复序列还包括:连续30个以上的不同碱基出现两次以上的序列。
5.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,还包括以下步骤:
S6、判断所述载体的培养温度是否处于设定温度范围,若所述培养温度处于所述设定温度范围,则所述载体的生产周期为所述第一时间、所述第二时间或所述第三时间,若所述培养温度低于所述设定温度范围,则所述载体的生产周期在所述第一时间、所述第二时间和所述第三时间的基础上增加第三时间段。
6.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,还包括以下步骤:
S7、判断所述基因序列是否具有毒性,若所述基因序列没有毒性,则所述载体的生产周期为所述第一时间、所述第二时间或所述第三时间,若所述基因序列具有毒性,则所述载体的生产周期在所述第一时间、所述第二时间和所述第三时间的基础上增加第四时间段。
7.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述第一设定值为3KB,所述第一时间为15天-16天,所述第一时间段为2天。
8.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述第二设定值为7KB,所述第二时间段为10天。
9.一种计算机存储介质,其特征在于,包括一条或多条计算机指令,所述一条或多条计算机指令在执行时实现如权利要求1-8中任一项所述的方法。
10.一种电子设备,包括存储器和处理器,其特征在于,
所述存储器用于存储一条或多条计算机指令;
所述处理器用于调用并执行所述一条或多条计算机指令,从而实现如权利要求1-8中任一项所述的方法。
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