[发明专利]一种基于转录组中相邻微卫星序列的植物鉴别方法

权利要求书

1.一种基于转录组中相邻微卫星序列的植物鉴别方法，其特征在于，包括以下步骤：

提取待鉴定植物组织样本的RNA，使用高通量测序的方法对转录组进行测序，将测得的原始序列Raw data经过去掉接头序列，过滤掉不合格的序列后得到有效数据Clean data序列，由有效数据Clean data序列根据重复序列进行拼接，由有效数据Clean data序列根据已知基因组进行拼接或根据重复序列拼接Unigene，使用MISA软件对拼接除重后得到的序列进行微卫星序列进行分析，得到微卫星序列统计数据，包括微卫星序列的类型和微卫星序列的具体序列；对不同样本中进行相似度比对，采用两两对比的方式，在微卫星序列的类型中选择相邻微卫星序列类型，统计其中序列相同的微卫星序列，以相同微卫星序列个数除以除重后总的微卫星序列数得出相似度，利用相似度构建聚类图；从而实现不同植物样本的区分。