[发明专利]一种水稻抗纹枯病基因SBR11及其分子标记和应用

说明书

本发明公开了一种水稻抗纹枯病基因SBR11及其分子标记和应用，属于作物分子生物学技术领域。本发明通过遗传转化证实了SBR11基因正调控水稻对纹枯病的抗性，通过等位基因功能和单倍型分析，证实了该基因编码区190，926位点SNP导致基因功能变异，进而本发明也开发了两个分子标记用于检测这两个位点基因型，所述分子标记包括SNP位点190和SNP位点926，利用该分子标记可以检测SBR11等位基因并进行选择，为水稻抗病分子设计育种提供更多的资源，加快育种进程。

技术领域

本发明属于作物分子生物学技术领域，涉及一种水稻抗纹枯病基因SBR11及其分子标记和应用。

背景技术

水稻(Oryza sativa L.)是我国最重要的粮食作物。由强腐生性真菌立枯丝核菌(Rhizoctonia solani Kühn)引起的水稻纹枯病是我国水稻三大病害之一。纹枯病由于其发生面积广、防治难度大，造成的产量损失位于水稻各病害之首。长期以来，对纹枯病的防治主要依赖于化学药剂，但效果一直不佳。推广和培育抗病品种是控制病害最经济有效的措施。水稻对纹枯病的抗性属于数量性状抗性，受多基因或QTL(Quantitative traitlocus)控制，克隆抗纹枯病相关基因具有重要的理论价值和实际意义。

发明内容

本发明所要解决的技术问题是克服现有技术的缺陷，提供一种稻抗纹枯病基因SBR11及其分子标记和应用，本发明通过遗传转化证实了SBR11基因正调控水稻对纹枯病的抗性。通过等位基因功能和单倍型分析，证实了该基因编码区190，926位点SNP导致基因功能变异，进而本发明也开发了两个分子标记用于检测这两个位点基因型。

本发明的技术方案为：

本发明的目的之一为提供一种水稻抗纹枯病基因SBR11，其为以下任一：

(1)所述SBR11的全长序列如SEQ ID NO.1所示；或

(2)SEQ ID NO.1所示核苷酸序列经取代、缺失和/或增加一个或几个核苷酸编码相同功能蛋白的基因；或

(3)所述SBR11的全长序列为SEQ ID NO.1所示序列的第190位碱基由T变为A；或

(4)所述SBR11的全长序列为SEQ ID NO.1所示序列的第926位碱基由G变为A；或

(5)所述SBR11的全长序列为SEQ ID NO.1所示序列的第1492位碱基由A变为G。

本发明的目的之二为提供上述的水稻抗纹枯病基因SBR11编码的蛋白质，所述蛋白质的氨基酸序列具有：

(1)如SEQ ID NO.2所示的氨基酸序列；或

(2)SEQ ID NO.2所示的氨基酸序列经取代、缺失和/或增加一个或多个氨基酸且具有同等活性的由2)衍生的蛋白质。

本发明的目的之三为提供含有上述水稻抗纹枯病基因SBR11的生物材料，所述生物材料为载体、转基因细胞系、工程菌、宿主细胞或表达盒。

本发明的目的之四为提供上述的水稻抗纹枯病基因SBR11、蛋白质或生物材料在水稻抗纹枯病育种中的应用。

本发明的目的之五为提供用于检测水稻抗纹枯病基因SBR11的分子标记，所述分子标记包括SNP位点190和SNP位点926，所述SNP位点190位于SBR11编码区第190位碱基，该碱基SNP变异，其多态性为T/A；所述SNP位点926位于SBR11编码区第926位碱基，该碱SNP变异，其多态性为G/A。