[发明专利]一种水稻抗纹枯病基因SBR11及其分子标记和应用有效
申请号: | 202110241489.1 | 申请日: | 2021-03-04 |
公开(公告)号: | CN112831503B | 公开(公告)日: | 2022-11-18 |
发明(设计)人: | 王雨;左示敏;薛芗;陈宗祥;冯志明;胡珂鸣;潘学彪 | 申请(专利权)人: | 扬州大学 |
主分类号: | C12N15/29 | 分类号: | C12N15/29;C07K14/415;C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12N15/11 |
代理公司: | 南京纵横知识产权代理有限公司 32224 | 代理人: | 王玉 |
地址: | 225009 *** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 水稻 抗纹枯病 基因 sbr11 及其 分子 标记 应用 | ||
1.水稻抗纹枯病基因SBR11,其特征在于,其为以下任一:
(1)所述SBR11的全长序列如SEQ ID NO.1所示;或
(2)SEQ ID NO.1所示核苷酸序列经取代、缺失和/或增加一个或几个核苷酸编码相同功能蛋白的基因;或
(3)所述SBR11的全长序列为SEQ ID NO.1所示序列的第190位碱基由T变为A;或
(4)所述SBR11的全长序列为SEQ ID NO.1所示序列的第926位碱基由G变为A;或
(5)所述SBR11的全长序列为SEQ ID NO.1所示序列的第1492位碱基由A变为G。
2.权利要求1所述的水稻抗纹枯病基因SBR11编码的蛋白质,其特征在于,所述蛋白质的氨基酸序列具有:
(1)如SEQ ID NO.2所示的氨基酸序列;或
(2)SEQ ID NO.2所示的氨基酸序列经取代、缺失和/或增加一个或多个氨基酸且具有同等活性的由2)衍生的蛋白质。
3.含有权利要求1所述水稻抗纹枯病基因SBR11的生物材料,其特征在于,所述生物材料为载体、转基因细胞系、工程菌、宿主细胞或表达盒。
4.权利要求1所述的水稻抗纹枯病基因SBR11、权利要求2所述的蛋白质或权利要求3所述的生物材料在水稻抗纹枯病育种中的应用。
5.用于检测水稻抗纹枯病基因SBR11的分子标记,其特征在于,所述分子标记包括SNP位点190和SNP位点926,所述SNP位点190位于SBR11编码区第190位碱基,该碱基SNP变异,其多态性为T/A;所述SNP位点926位于SBR11编码区第926位碱基,该碱基SNP变异,其多态性为G/A。
6.根据权利要求5所述的分子标记,其特征在于,所述SNP位点190位于水稻第11号染色体第4851244位碱基,该SNP位点190前后共176bp的序列如SEQ ID No.3所示,第154bp的碱基即为SNP位点19;所述SNP位点926位于水稻第11号染色体第4851980位碱基,该SNP位点926前后共262bp的序列如SEQ ID No.4所示,第125bp的碱基即为SNP位点926。
7.用于检测权利要求5或6所述分子标记的引物组合,其特征在于,包括检测SNP位点190和检测SNP位点926的引物组;检测SNP位点190的引物为Primer190F、Primer190R,所述Primer190F的序列如SEQ ID NO.5所示,所述Primer190R的序列如SEQ ID NO.6所示;检测SNP位点926的引物为Primer926F、Primer926R,所述Primer926F的序列如SEQ ID NO.7所示,所述Primer926R的序列如SEQ ID NO.8所示。
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