[发明专利]检测T4多聚核苷酸激酶去磷酸化活性的方法、试剂盒在审
申请号: | 202011542000.6 | 申请日: | 2020-12-24 |
公开(公告)号: | CN114672539A | 公开(公告)日: | 2022-06-28 |
发明(设计)人: | 魏喜换;娄双颜;赵瑞雪 | 申请(专利权)人: | 郑州思昆生物工程有限公司 |
主分类号: | C12Q1/48 | 分类号: | C12Q1/48;G01N30/02;G01N30/34;G01N30/86 |
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地址: | 450001 河南省郑州市自贸试验区郑*** | 国省代码: | 河南;41 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 检测 t4 核苷酸 激酶 磷酸化 活性 方法 试剂盒 | ||
本发明涉及酶活分析技术领域,具体涉及一种检测T4多聚核苷酸激酶去磷酸化活性的方法、试剂盒。本发明通过设计5’端和3’端均为磷酸修饰的核酸链作为反应底物,由于5’端已提前设置磷酸修饰结构,阻止待测T4多聚核苷酸激酶的5’磷酸化活性,使整个检测过程中仅发生3’去磷酸化反应,获得5’端为磷酸修饰、3’端为羟基的核酸链反应产物,通过检测反应一定时间后,反应混合液中反应产物和反应底物的含量关系,以单位时间内反应底物转化为反应产物的转化率定义T4多聚核苷酸激酶的去磷酸化活性。整个检测方法,操作简便,易于控制。
技术领域
本发明涉及酶活分析技术领域,具体涉及一种检测T4多聚核苷酸激酶去磷酸化活性的方法、试剂盒。
背景技术
T4多聚核苷酸激酶,简称T4PNK,是由T4噬菌体的pseT基因编码的一种蛋白质,最初是从T4噬菌体感染的大肠杆菌细胞中分离出来的,因此又叫做T4多核苷酸激酶。该酶可以催化ATP的γ-磷酸向单链或双链DNA、RNA、寡核苷酸或带有3’磷酸基团的单核苷酸的5’羟基转移。该酶还具有3’磷酸酶活性,将3’-磷酸基团从寡核苷酸的3’磷酸末端、脱氧3’-单磷酸核苷和脱氧3’-二膦酸核苷上水解下来,形成3’-羟基结构。
T4PNK应用广泛,如寡核苷酸、DNA或RNA的5’末端标记,用作Sourthern、Northern、EMSA等的探针,凝胶电泳的marker,DNA测序引物,PCR引物等;使寡核苷酸、DNA或RNA的5’端磷酸化,确保后续连接反应顺利进行;催化3’磷酸化的单核苷酸的5’磷酸化,使该单核苷酸可以和DNA或RNA的3’末端连接;去除3’端磷酸基团。
T4PNK生产过程中,通常需要对T4PNK的活性进行评价判断,包括5’端磷酸化活性和3’端去磷酸化活性。目前存在一些方法对T4PNK的5’端磷酸化活性进行分析检测,比如利用放射性同位素的[γ-33P]ATP掺入法;专利CN104293929A公开了一种能够与ATP发生氧化反应生产氧合荧光素,产生化学发光的荧光素酶报告基团系统的方式检测T4PNK的5’磷酸化活性;专利CN108823280A公开了基于银纳米簇荧光探针(通过使用无标记的、“turn-off”型荧光探针)的T4多聚核苷酸激酶活性检测方法。
上述T4PNK酶活检测方法均是针对T4PNK的5’端磷酸化的活性进行检测,缺乏简单高效准确检测T4PNK3’端去磷酸化活性的分析方法。
发明内容
本发明的目的之一是提供一种检测T4多聚核苷酸激酶去磷酸化活性的方法,通过设计5’和3’端均带有磷酸基团的引物探针为底物,加入待测T4多聚核苷酸激酶反应,获得5’为磷酸基团、3’端为羟基的核酸链产物,通过测定底物和产物的含量关系,进而推导出T4多聚核苷酸激酶的去磷酸化活性,操作简便,易于控制。
同时,本发明的目的还在于提供一种检测T4多聚核苷酸激酶去磷酸化活性的试剂盒。
为了实现上述目的,本发明采用的技术方案如下:
一种检测T4多聚核苷酸激酶去磷酸化活性的方法,包括在反应缓冲液中依次加入反应底物和待测T4多聚核苷酸激酶,检测反应完成后的反应混合液中反应底物和反应产物的含量关系,推导出T4多聚核苷酸激酶的去磷酸化活性;
其中反应底物为5’端和3’端均为磷酸修饰的核酸链;反应产物为5’端磷酸修饰、3’端为羟基的核酸链。
进一步的,上述检测反应混合液中反应底物和反应产物的含量关系的方法为:采用HPLC检测,反应底物和反应产物保留时间不同,根据反应底物和反应产物对应的峰面积的比例,推导出T4多聚核苷酸激酶的去磷酸化活性。
为了进一步提高检测结果的准确性,反应底物序列中核苷酸A和核苷酸T的总含量为70%,核苷酸A和核苷酸T的含量比例为1:1;更进一步的,反应底物序列中不含有核苷酸G。
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