[发明专利]一种识别PAM序列为NRTH的SpCas9n变体及相应碱基编辑系统有效

专利信息
申请号: 202011474234.1 申请日: 2020-12-14
公开(公告)号: CN112538492B 公开(公告)日: 2022-10-11
发明(设计)人: 秦瑞英;李娟;许蓉芳;刘小双;单调风;武平安;魏鹏程 申请(专利权)人: 安徽省农业科学院水稻研究所
主分类号: C12N15/55 分类号: C12N15/55;C12N15/62;C12N15/82;C12N15/84;C12N15/10;A01H5/00;A01H6/46
代理公司: 北京律谱知识产权代理有限公司 11457 代理人: 黄云铎
地址: 230031 *** 国省代码: 安徽;34
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摘要:
搜索关键词: 一种 识别 pam 序列 nrth spcas9n 变体 相应 碱基 编辑 系统
【权利要求书】:

1.一种识别PAM序列为NRTH的SpCas9n变体,其特征在于,其中,N为A、T、C或G;R为A或T;H为A,T或C,所述SpCas9n变体为:序列表中SEQ ID NO:1所示序列。

2.一种水稻碱基编辑系统,其特征在于,所述水稻碱基编辑系统包括融合蛋白和转录sgRNA的DNA分子,所述融合蛋白由SpCas9n蛋白变体和腺嘌呤脱氨酶ABE组成,所述SpCas9n蛋白变体的基因序列如序列表中SEQ ID NO:1所示,腺嘌呤脱氨酶ABE基因序列如序列表中SEQ ID NO:2所示;

所述sgRNA靶向目标靶点序列;

所述目标靶点序列的PAM序列为NRTH,其中,N为A、T、C或G;R为A或T;H为A,T或C。

3.一种用于权利要求2所述的水稻碱基编辑系统的重组表达载体,其特征在于,所述重组表达载体包括表达盒一和表达盒二;所述表达盒一表达权利要求2中所述的融合蛋白;所述表达盒二表达权利要求2中所述的sgRNA。

4.一种表达盒,其特征在于,所述表达盒表达权利要求2中所述的融合蛋白。

5.一种权利要求2所述的水稻碱基编辑系统的应用,其特征在于:所述应用包括将权利要求2所述的碱基编辑系统导入目标受体内,提高水稻基因组上为NRTH的PAM序列附近的A:T 突变成G:C的定点替换效率,获得含有突变位点的转基因植物或植物部分。

6.一种权利要求3所述的重组表达载体的应用,其特征在于:所述应用包括将权利要求3所述的重组表达载体导入目标受体内,提高水稻基因组上为NRTH的PAM序列附近的A:T 突变成G:C的定点替换效率,获得含有突变位点的转基因植物或植物部分。

7.根据权利要求5所述的应用,其特征在于:所述目标受体为植物愈伤组织。

8.根据权利要求6或7所述的应用,其特征在于:导入受体的过程为经过侵染、共培养、筛选步骤来实现,进而得到编辑后的植物愈伤组织,然后利用愈伤组织分化成植株。

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