[发明专利]一种基于修饰dNTP的高特异和高灵敏核酸检测方法在审
申请号: | 202011308095.5 | 申请日: | 2020-11-19 |
公开(公告)号: | CN112391450A | 公开(公告)日: | 2021-02-23 |
发明(设计)人: | 黄震;胡贝;罗光成 | 申请(专利权)人: | 四川大学;纽奥维特(成都)生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6848 | 分类号: | C12Q1/6848;C12Q1/70;C12R1/93 |
代理公司: | 北京众合诚成知识产权代理有限公司 11246 | 代理人: | 赵浩竹 |
地址: | 610065 四*** | 国省代码: | 四川;51 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 修饰 dntp 特异 灵敏 核酸 检测 方法 | ||
1.一种基于修饰dNTP的高特异和高灵敏核酸检测方法,其特征在于:包括变温策略检测法和恒温策略检测法。
2.根据权利要求1所述的一种基于修饰dNTP的高特异和高灵敏核酸检测方法,其特征在于:所述变温策略检测法包括以下步骤:
步骤一:合成并配置引物
先针对待测DNA或RNA靶分子进行引物的设计,再根据引物的设计合成出引物,将其用水溶解,配置成特定浓度使其添加到反应体系后的反应浓度为10nM-100microM;
步骤二:配置脱氧核苷三磷酸混合物
用至少一种dNTPαSe或至少一种dNTPαS,彻底或部分取代与之碱基相同的dATP、dCTP、dGTP和dTTP,并按规定浓度混合成dNTP混合物,接着根据试验需要向反应体系中加入规定量的dNTP混合物;
步骤三:配置SEA核酸检测反应体系
将PCR缓冲液、至少一个荧光染料或至少一个分子探针、至少一个DNA聚合酶、至少一个正向引物、至少一个反向引物、dNTP混合物、核酸DNA或RNA靶标分子配置成SEA-PCR反应体系,并同时设置阳性对照和阴性对照;
步骤四:反应及产物分析
先将配置好的SEA-PCR反应体系放置于PCR仪,最后进行核酸扩增结果的分析。
3.根据权利要求2所述的一种基于修饰dNTP的高特异和高灵敏核酸检测方法,其特征在于:在所述变温策略检测法的步骤二中:用dATPαSe、dCTPαSe、dGTPαSe、dTTPαSe、dUTPαSe和dATPαS、dCTPαS、dGTPαS、dTTPαS、dUTPαS其中的一种或多种,来彻底或部分取代与之碱基相同的dATP、dCTP、dGTP和dTTP,并按规定浓度混合成dNTP混合物,接着根据试验需要向反应体系中加入规定量的dNTP混合物。
4.根据权利要求1所述的一种基于修饰dNTP的高特异和高灵敏核酸检测方法,其特征在于:所述恒温策略检测法包括以下步骤:
步骤一:合成并配置引物
先针对待测DNA或RNA靶分子进行引物的设计,再根据引物的设计合成出引物,将其用水溶解,并配置成引物混合物,使其添加到反应体系后的反应浓度为0.01-100microM;
步骤二:配置脱氧核苷三磷酸混合物
用至少一种dNTPαSe或至少一种dNTPαS,彻底或部分取代与之碱基相同的dATP、dCTP、dGTP和dTTP,并按规定浓度混合成dNTP混合物,接着根据试验需要向反应体系中加入规定量的dNTP混合物;
步骤三:配置SEA-ITA恒温扩增反应体系
将扩增缓冲液、引物混合物、至少一个荧光染料或至少一个荧光探针、dNTP混合物、至少一个DNA聚合酶和核酸靶标分子配置成反应体系,并同时设置阳性对照和阴性对照;
步骤四:反应产物分析
先将配置好的反应体系放置于恒温仪中,接着在恒温环境下孵育1-600分钟,最后进行核酸扩增结果的分析。
5.根据权利要求4所述的一种基于修饰dNTP的高特异和高灵敏核酸检测方法,其特征在于:在所述恒温策略检测法中的步骤二中:用dATPαSe、dCTPαSe、dGTPαSe、dTTPαSe、dUTPαSe和dATPαS、dCTPαS、dGTPαS、dTTPαS、dUTPαS其中的一种或多种,彻底或部分取代与之碱基相同的dATP、dCTP、dGTP和dTTP,并按规定浓度混合成dNTP混合物,接着根据试验需要向反应体系中加入规定量的dNTP混合物。
6.根据权利要求2所述的一种基于修饰dNTP的高特异和高灵敏核酸检测方法,其特征在于:所述变温策略检测法,在步骤一中,通过在线软件对引物进行设计,设计的引物包括正向引物和反向引物。
7.根据权利要求2所述的一种基于修饰dNTP的高特异和高灵敏核酸检测方法,其特征在于:在所述变温策略检测法的步骤二中,所述dNTP混合物的浓度均为0.01-100mM。
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