[发明专利]一种胆管癌预后测定标志物、检测引物、试剂盒及应用

说明书

本发明涉及基因工程技术领域，特别是公开了一种胆管癌预后测定标志物、检测引物、试剂盒及应用，胆管癌预后测定标志物为5个lncRNA，5个lncRNA分别为HULC、AP000943.4、AC006504.8、AC090114.2、AL359715.5。构建胆管癌数据集；构建LncRNA和基因差异表达谱；LncRNA相关预后预测模型的建立；LncRNA相关预后预测模型的验证及诊断；预后LncRNA标记物独立于其他临床病理特征变量的生存预测；共表达和功能富集分析，Spearman相关系数0.50是与LncRNA相关的DPCG。

技术领域

本发明涉及基因工程技术领域，特别是一种主题名称。

背景技术

目前，肿瘤是严重威胁人类健康的一大主要元凶，对肿瘤恶性进 展的分子机制研究一直是学界关注的焦点与难点。已有研究报道，肿 瘤细胞在生长过程中具有促进增殖和侵袭转移，持续血管生成，免疫 耐受及免疫逃逸等细胞表型特征。研究表明，肿瘤细胞的生长是一个 复杂的多基因调控和多步骤、多阶段发展的过程，包括p53、p21等抑 癌基因的失活和Blc1、Myc等原癌基因的激活。迄今为止，恶性肿瘤 的发生机制仍未完全清楚，需要进一步探索。

研究显示：除这些已被广泛研究的编码基因外，长链非编码R N A(l o n gnon-codingRNAs，lncRNAs)的异常表达也参与肿瘤恶性进 展。lncRNAs是一类转录本长度超过200nt的RNA分子，有别于其他 小分子非编码RNA，其可以顺式(in cis)或反式(intrans)作用的方式调节 RNA代谢、蛋白质功能活性、组蛋白修饰及染色质重塑。

长链非编码RNA按其与mRNA之间的位置关系大致分为五种类 型：(1)正义长链非编码RNA；(2)反义长链非编码RNA；(3)双向长链 非编码RNA；(4)内含子型长链非编码RNA；(5)基因间长链非编码 RNA(即large intergenic noncoding RNA，llncRNA)。在整个基因组转录 产物中，lncRNA所占的比例远远超过mRNA的比例。越来越多的研 究显示，lncRNA在基因转录翻译、表观遗传、细胞分化等生命活动中 发挥了重要的调控作用，并且在多种肿瘤中存在异常表达，参与了肿 瘤的发生、发展、浸润和转移等过程。

越来越多的研究证实，lncRNAs不仅在维持机体的正常生理功能 及发育过程中发挥重要的调控作用，其异常表达与疾病的发生发展尤 其是肿瘤的恶性进展有着密切的联系。

胆管癌(cholangiocarcinoma，CCA)是起源于胆管上皮细胞的高度侵 袭性的恶性肿瘤，其全球发生率，尤其是在亚洲国家中呈逐年上升趋 势，5年生存率不足5％。胆管癌早期发病隐匿，常无明显的临床表 现，明确诊断时已至中晚期。尽管目前已有手术、放疗、化疗等临床 治疗手段，但是胆管癌患者的预后仍很差。已有研究表明，lncRNAs 的异常表达介导胆管癌恶性进展。上调的H19和HULC可通过ceRNA 机制促进胆管癌细胞的迁移和侵袭。lncRNA CPS1intronic transcript 1(CPS1-IT1)可促进胆管癌细胞的增殖及抑制凋亡，且影响病人的肝 功能及预后。进一步文献检索结果显示：lncRNAs可以通过发挥原癌 基因的作用，参与胆管癌细胞增殖、凋亡和侵袭转移等生物学过程， 提示更多胆管癌恶性进展相关lncRNAs的功能和机制具有进一步研究 的必要性。

通过上述分析，现有技术存在的问题及缺陷为：现有技术提供的 lncRNA基因标志物用于判断胆管癌手术后患者预后的优劣效果差；而 且现有技术lncRNA基因标志物选择相应的药物进行辅助治疗效果并不 理想，不能达到对胆管癌患者的个体化治疗效果。