[发明专利]一种用于乙肝病毒基因检测的捕获探针组在审
申请号: | 202011115542.5 | 申请日: | 2020-10-19 |
公开(公告)号: | CN112322783A | 公开(公告)日: | 2021-02-05 |
发明(设计)人: | 史健翔;张建营;王晓;王鹏;叶华;汤文学;郭建成;冯帅升;李记天;代丽萍;崔驰 | 申请(专利权)人: | 郑州大学 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/6869;C12N15/11 |
代理公司: | 北京盛凡智荣知识产权代理有限公司 11616 | 代理人: | 李青 |
地址: | 450000 河南省郑*** | 国省代码: | 河南;41 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 用于 乙肝病毒 基因 检测 捕获 探针 | ||
1.一种用于乙肝病毒基因检测的捕获探针组,其特征在于,所述探针组包含能特异性捕获A、B、C、D四种基因型的乙肝病毒基因的探针,所述探针为根据A、B、C、D四种基因型的乙肝病毒的全基因组序列设计的DNA序列,所述探针的具体序列选自于序列表中的SEQ IDNO.1-245。
2.根据权利要求1所述的一种用于乙肝病毒基因检测的捕获探针组,其特征在于,所述探针组包括245条各不相同的根据A、B、C、D四种基因型的乙肝病毒的全基因组序列设计的DNA序列的探针。
3.根据权利要求1所述的一种用于乙肝病毒基因检测的捕获探针组,其特征在于,每条所述探针的长度约为90bp的寡核苷酸。
4.一种检测乙肝病毒基因的捕获测序方法,其特征在于,所述方法为利用权利要求1至权利要求3任一项所述的探针组对乙肝病毒基因进行杂交捕获和测序分析。
5.根据权利要求4所述的一种检测乙肝病毒基因的捕获测序方法,其特征在于,所述方法包括如下步骤:
1)制备DNA全基因组文库:将从待测样品和对照正常样品中分别提取DNA,然后将提取的DNA打断,即可建立含乙肝病毒相关目标基因区的全基因组文库;
2)杂交捕获目标基因区域;
3)基因测序:利用测序仪对步骤2)捕获的目标基因进行高通量测序;
4)对步骤3)测序结果进行生物信息分析。
6.根据权利要求5所述的一种检测乙肝病毒基因的捕获测序方法,其特征在于,其步骤2)的所述杂交捕获目标基因区域的具体步骤包括①捕获探针的设计与制备;②目标基因的杂交捕获并富集。
7.根据权利要求5所述的一种检测乙肝病毒基因的捕获测序方法,其特征在于,其步骤3)中采用第二代测序技术来获得样本中的核酸分子的核苷酸序列。
8.根据权利要求5所述的一种检测乙肝病毒基因的捕获测序方法,其特征在于,其步骤4)中的生物信息分析包括对DNA突变、缺失及HBV插入位点等信息的分析。
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