[发明专利]一种新型CRISPR核酸检测方法及应用在审

专利信息
申请号: 202011097291.2 申请日: 2020-10-14
公开(公告)号: CN112176035A 公开(公告)日: 2021-01-05
发明(设计)人: 尤其敏;周艳琼;林元奎;林艺志;帅金晓;贾晓娟 申请(专利权)人: 杭州优思达生物技术有限公司
主分类号: C12Q1/6844 分类号: C12Q1/6844
代理公司: 杭州裕阳联合专利代理有限公司 33289 代理人: 金方玮
地址: 310051 浙江省杭州市*** 国省代码: 浙江;33
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摘要:
搜索关键词: 一种 新型 crispr 核酸 检测 方法 应用
【权利要求书】:

1.一种新型CRISPR核酸检测方法,其特征在于,包括:

与待检测靶标序列互补的crRNA,tracrRNA,Cas14酶,酶缓冲液;或与待检测靶标序列互补的crRNA和tracrRNA连接而成的sgRNA,Cas14酶,酶缓冲液组成的反应体系,在加入待检测核酸后,通过酶切反应,产生可检测的信号变化。

2.一种新型CRISPR核酸检测方法,其特征在于,包括如下步骤:

步骤一,制备反应体系;

反应体系包括:与待检测靶标序列互补的crRNA,tracrRNA,Cas14酶,探针,酶缓冲液;或反应体系包括:由crRNA和tracrRNA连接而成的sgRNA,Cas14酶,探针,酶缓冲液;

步骤二,将待检测核酸加入核糖蛋白复合体溶液中;

步骤三,酶切反应,信号的检测和结果的判读。

3.根据权利要求1或2所述的一种新型CRISPR核酸检测方法,其特征在于,所述Cas14酶包括:Cas14a,Cas14b,Cas14c,或者于Cas14旁路切割活性类似的Cas蛋白。

4.根据权利要求1或2所述的一种新型CRISPR核酸检测方法,其特征在于,所述待检测核酸为直接检测样本中的核酸或者检测经扩增后的核酸。

5.根据权利要求1或2所述的一种新型CRISPR核酸检测方法,其特征在于,所述待检测核酸包括:RNA、单链DNA或者双链DNA。

6.一种新型CRISPR核酸检测方法的应用,其特征在于,应用于直接检测核酸的步骤包括:

配制反应体系,所述反应体系包括:tracrRNA,crRNA,Cas14酶,探针,酶缓冲液;所述crRNA与待检测靶标序列互补;

将待测核酸加入反应体系,

将反应体系置于25-95℃,5-200min。

读取信号。

7.一种新型CRISPR核酸检测方法的应用,其特征在于,应用于与恒温扩增结合的一步法核酸检测的步骤包括:

配制反应体系,该体系包括恒温扩增反应体系、Cas14酶、探针、tracrRNA和crRNA;将待测核酸加入反应体系中,并于25-95℃进行扩增及酶切5-200min;所述crRNA与待检测靶标序列互补;

读取信号。

8.一种新型CRISPR核酸检测方法的应用,其特征在于,应用于与扩增技术结合的两步法核酸检测的步骤包括:

配制恒温扩增反应体系或者PCR反应体系;将待测核酸加入扩增反应体系中,并于25-99℃进行扩增5-240min;

配置Cas14a酶切反应体系,将配制的酶切反应体系至于25-95℃温浴1-60min;所述Cas14a酶切反应体系包括:Cas14酶、探针、tracrRNA和crRNA,酶缓冲液;

将扩增产物加入酶切反应体系中,扩增产物和酶切反应体系的体积比为0.0001/1-5/1;

将反应体系置于25-95℃温浴1-60min;

读取信号。

9.一种新型CRISPR核酸检测方法的应用,其特征在于,应用于检测单链DNA的步骤包括:

配制反应体系,所述反应体系包括:tracrRNA,crRNA,Cas14酶,探针,酶缓冲液;所述crRNA与待检测靶标序列互补;

将待测核酸加入反应体系;

将反应体系置于25-95℃,5-200min;

读取信号。

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