[发明专利]一种新型CRISPR核酸检测方法及应用在审
申请号: | 202011097291.2 | 申请日: | 2020-10-14 |
公开(公告)号: | CN112176035A | 公开(公告)日: | 2021-01-05 |
发明(设计)人: | 尤其敏;周艳琼;林元奎;林艺志;帅金晓;贾晓娟 | 申请(专利权)人: | 杭州优思达生物技术有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6844 | 分类号: | C12Q1/6844 |
代理公司: | 杭州裕阳联合专利代理有限公司 33289 | 代理人: | 金方玮 |
地址: | 310051 浙江省杭州市*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 新型 crispr 核酸 检测 方法 应用 | ||
1.一种新型CRISPR核酸检测方法,其特征在于,包括:
与待检测靶标序列互补的crRNA,tracrRNA,Cas14酶,酶缓冲液;或与待检测靶标序列互补的crRNA和tracrRNA连接而成的sgRNA,Cas14酶,酶缓冲液组成的反应体系,在加入待检测核酸后,通过酶切反应,产生可检测的信号变化。
2.一种新型CRISPR核酸检测方法,其特征在于,包括如下步骤:
步骤一,制备反应体系;
反应体系包括:与待检测靶标序列互补的crRNA,tracrRNA,Cas14酶,探针,酶缓冲液;或反应体系包括:由crRNA和tracrRNA连接而成的sgRNA,Cas14酶,探针,酶缓冲液;
步骤二,将待检测核酸加入核糖蛋白复合体溶液中;
步骤三,酶切反应,信号的检测和结果的判读。
3.根据权利要求1或2所述的一种新型CRISPR核酸检测方法,其特征在于,所述Cas14酶包括:Cas14a,Cas14b,Cas14c,或者于Cas14旁路切割活性类似的Cas蛋白。
4.根据权利要求1或2所述的一种新型CRISPR核酸检测方法,其特征在于,所述待检测核酸为直接检测样本中的核酸或者检测经扩增后的核酸。
5.根据权利要求1或2所述的一种新型CRISPR核酸检测方法,其特征在于,所述待检测核酸包括:RNA、单链DNA或者双链DNA。
6.一种新型CRISPR核酸检测方法的应用,其特征在于,应用于直接检测核酸的步骤包括:
配制反应体系,所述反应体系包括:tracrRNA,crRNA,Cas14酶,探针,酶缓冲液;所述crRNA与待检测靶标序列互补;
将待测核酸加入反应体系,
将反应体系置于25-95℃,5-200min。
读取信号。
7.一种新型CRISPR核酸检测方法的应用,其特征在于,应用于与恒温扩增结合的一步法核酸检测的步骤包括:
配制反应体系,该体系包括恒温扩增反应体系、Cas14酶、探针、tracrRNA和crRNA;将待测核酸加入反应体系中,并于25-95℃进行扩增及酶切5-200min;所述crRNA与待检测靶标序列互补;
读取信号。
8.一种新型CRISPR核酸检测方法的应用,其特征在于,应用于与扩增技术结合的两步法核酸检测的步骤包括:
配制恒温扩增反应体系或者PCR反应体系;将待测核酸加入扩增反应体系中,并于25-99℃进行扩增5-240min;
配置Cas14a酶切反应体系,将配制的酶切反应体系至于25-95℃温浴1-60min;所述Cas14a酶切反应体系包括:Cas14酶、探针、tracrRNA和crRNA,酶缓冲液;
将扩增产物加入酶切反应体系中,扩增产物和酶切反应体系的体积比为0.0001/1-5/1;
将反应体系置于25-95℃温浴1-60min;
读取信号。
9.一种新型CRISPR核酸检测方法的应用,其特征在于,应用于检测单链DNA的步骤包括:
配制反应体系,所述反应体系包括:tracrRNA,crRNA,Cas14酶,探针,酶缓冲液;所述crRNA与待检测靶标序列互补;
将待测核酸加入反应体系;
将反应体系置于25-95℃,5-200min;
读取信号。
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