[发明专利]一种PS转座酶与CRISPR/dCpf1融合蛋白表达载体及其介导的定点整合方法在审

专利信息
申请号: 202011061777.0 申请日: 2020-09-30
公开(公告)号: CN112159822A 公开(公告)日: 2021-01-01
发明(设计)人: 宋成义;王亚丽;高波;王宵燕;陈才;关中夏;石莎莎 申请(专利权)人: 扬州大学
主分类号: C12N15/85 分类号: C12N15/85;C12N15/90;C12N15/62;C12N15/54;C12N15/55
代理公司: 南京纵横知识产权代理有限公司 32224 代理人: 刘妍妍
地址: 225009 *** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: 一种 ps 转座酶 crispr dcpf1 融合 蛋白 表达 载体 及其 定点 整合 方法
【权利要求书】:

1.一种质粒融合转座酶载体,其特征在于,所述载体的核酸序列如SEQ ID NO:1所示。

2.一种PS转座酶与CRISPR/dCpf1融合蛋白表达载体,其特征在于,所述载体包含CAG启动子、Kozak序列、2个SV40 NLS序列、dCpf1序列、linker序列、PS转座酶序列;

所述CAG启动子的序列为SEQ ID NO:1中自5’端第5~1654位碱基;

所述Kozak序列为SEQ ID NO:1中自5’端第1773~1782位碱基;

所述2个SV40 NSL序列分别为dCpf1序列上游和下游;

所述dCpf1序列为SEQ ID NO:1中自5’端第2427~6107位碱基,其中序列为突变体,为DNA剪切活性缺失型蛋白;

所述linker序列为SEQ ID NO:1中自5’端第6135~6179位碱基;

所述PS转座酶序列为SEQ ID NO:1中自5’端第6180~7451位碱基。

3.根据权利要求2所述的PS转座酶与CRISPR/dCpf1融合蛋白表达载体,其特征在于,所述linker序列包含15个氨基酸残基。

4.根据权利要求2所述的PS转座酶与CRISPR/dCpf1融合蛋白表达载体,其特征在于,所述2个SV40 NSL序列为SEQ ID NO:1中自5’端第2400~2420位碱基、第6114~6134位碱基。

5.权利要求1所述质粒融合转座酶载体或权利要求2~8任一项所述PS转座酶与CRISPR/dCpf1融合蛋白表达载体在转座子介导定点整合中的应用。

6.一种融合转座酶介导转座子定点整合的方法,其特征在于,包括如下步骤:

设计靶向目的基因的gRNA序列;

构建cpf1 gRNA表达载体;

将带有目的基因gRNA的表达载体和权利要求1所述的质粒融合转座酶载体和转座子供体质粒共转染宿主细胞,使转座子供体序列定点转座整合到目的基因;

使用抗性筛选基因筛选得到插入报告基因的阳性单克隆细胞;

吉姆萨染色统计阳性细胞克隆数,并挑取阳性单克隆细胞,荧光定量检测目的基因的表达情况。

7.根据权利要求6所述的融合转座酶介导转座子定点整合的方法,其特征在于,设计靶向目的基因的gRNA序列所用的引物序列如下:

HPRT1-gRNA-F:GTAGATTGTCCCCTGTTGACTGGTCATTC;

HPRT1-gRNA-R:AATTGAATGACCAGTCAACAGGGGACA。

8.根据权利要求6所述的融合转座酶介导转座子定点整合的方法,其特征在于,以pSQT14载体为gRNA表达载体为框架,所述pSQT14载体含有如下序列:AATTTCTACTAAGTGTAGAT。

9.根据权利要求6所述的融合转座酶介导转座子定点整合的方法,其特征在于,所述pSQT14载体的序列如SEQ ID NO:2所示。

10.根据权利要求6所述的融合转座酶介导转座子定点整合的方法,其特征在于,所述带有目的基因gRNA的表达载体的序列如SEQ ID NO:3所示。

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