[发明专利]一种PS转座酶与CRISPR/dCpf1融合蛋白表达载体及其介导的定点整合方法在审
| 申请号: | 202011061777.0 | 申请日: | 2020-09-30 | 
| 公开(公告)号: | CN112159822A | 公开(公告)日: | 2021-01-01 | 
| 发明(设计)人: | 宋成义;王亚丽;高波;王宵燕;陈才;关中夏;石莎莎 | 申请(专利权)人: | 扬州大学 | 
| 主分类号: | C12N15/85 | 分类号: | C12N15/85;C12N15/90;C12N15/62;C12N15/54;C12N15/55 | 
| 代理公司: | 南京纵横知识产权代理有限公司 32224 | 代理人: | 刘妍妍 | 
| 地址: | 225009 *** | 国省代码: | 江苏;32 | 
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 ps 转座酶 crispr dcpf1 融合 蛋白 表达 载体 及其 定点 整合 方法 | ||
1.一种质粒融合转座酶载体,其特征在于,所述载体的核酸序列如SEQ ID NO:1所示。
2.一种PS转座酶与CRISPR/dCpf1融合蛋白表达载体,其特征在于,所述载体包含CAG启动子、Kozak序列、2个SV40 NLS序列、dCpf1序列、linker序列、PS转座酶序列;
所述CAG启动子的序列为SEQ ID NO:1中自5’端第5~1654位碱基;
所述Kozak序列为SEQ ID NO:1中自5’端第1773~1782位碱基;
所述2个SV40 NSL序列分别为dCpf1序列上游和下游;
所述dCpf1序列为SEQ ID NO:1中自5’端第2427~6107位碱基,其中序列为突变体,为DNA剪切活性缺失型蛋白;
所述linker序列为SEQ ID NO:1中自5’端第6135~6179位碱基;
所述PS转座酶序列为SEQ ID NO:1中自5’端第6180~7451位碱基。
3.根据权利要求2所述的PS转座酶与CRISPR/dCpf1融合蛋白表达载体,其特征在于,所述linker序列包含15个氨基酸残基。
4.根据权利要求2所述的PS转座酶与CRISPR/dCpf1融合蛋白表达载体,其特征在于,所述2个SV40 NSL序列为SEQ ID NO:1中自5’端第2400~2420位碱基、第6114~6134位碱基。
5.权利要求1所述质粒融合转座酶载体或权利要求2~8任一项所述PS转座酶与CRISPR/dCpf1融合蛋白表达载体在转座子介导定点整合中的应用。
6.一种融合转座酶介导转座子定点整合的方法,其特征在于,包括如下步骤:
设计靶向目的基因的gRNA序列;
构建cpf1 gRNA表达载体;
将带有目的基因gRNA的表达载体和权利要求1所述的质粒融合转座酶载体和转座子供体质粒共转染宿主细胞,使转座子供体序列定点转座整合到目的基因;
使用抗性筛选基因筛选得到插入报告基因的阳性单克隆细胞;
吉姆萨染色统计阳性细胞克隆数,并挑取阳性单克隆细胞,荧光定量检测目的基因的表达情况。
7.根据权利要求6所述的融合转座酶介导转座子定点整合的方法,其特征在于,设计靶向目的基因的gRNA序列所用的引物序列如下:
HPRT1-gRNA-F:GTAGATTGTCCCCTGTTGACTGGTCATTC;
HPRT1-gRNA-R:AATTGAATGACCAGTCAACAGGGGACA。
8.根据权利要求6所述的融合转座酶介导转座子定点整合的方法,其特征在于,以pSQT14载体为gRNA表达载体为框架,所述pSQT14载体含有如下序列:AATTTCTACTAAGTGTAGAT。
9.根据权利要求6所述的融合转座酶介导转座子定点整合的方法,其特征在于,所述pSQT14载体的序列如SEQ ID NO:2所示。
10.根据权利要求6所述的融合转座酶介导转座子定点整合的方法,其特征在于,所述带有目的基因gRNA的表达载体的序列如SEQ ID NO:3所示。
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