[发明专利]用于筛查鼻咽癌的方法及应用

说明书

本发明公开用于筛查鼻咽癌的方法及应用。本发明的方法包括：测量来源于EBV阳性鼻咽癌细胞系中SYK基因两端或其内部的EBV相关超级增强子的信号强度得到测量值的步骤；将所述测量值与对照值比较的步骤；当测量值高于对照值时，将受试者评估为患鼻咽癌的风险高，当测量值低于或等于对照值时，将受试者评估为患鼻咽癌的风险低。本发明通过探索超级增强子在EBV阳性鼻咽癌细胞系中的特征，揭示了一种EBV在鼻咽癌细胞中产生新的超级增强子，引起促癌基因SYK的表达上调，并进一步调控鼻咽癌细胞发生发展的新机制以及与鼻咽癌治疗相关的新策略，其调控机制进一步在细胞水平和空间结构进行了验证。

技术领域

本发明属于生物医学领域，具体涉及用于筛查鼻咽癌的方法及应用。

背景技术

鼻咽癌(nasopharyngeal carcinomas，NPC)是原发于鼻咽部上皮的恶性肿瘤，在我国南方和东南亚地区高发，具有明显的地域性。世界卫生组织将鼻咽癌分为三种类型：鳞状细胞癌(WHO 1型)、非角化性癌(WHO 2型)和未分化癌(WHO 3型)。目前认为鼻咽癌的发生主要与EB病毒(Epstein-Barr virus，EBV)感染、遗传易感性、饮食与环境等因素相关，几乎98％的鼻咽癌与EBV感染相关。

EBV(又称为人类疱疹病毒4,human herpes virus type 4,HHV4)，由双链DNA包裹的环状核心蛋白、核衣壳、被膜、包膜构成，是第一个发现的与人类肿瘤相关的病毒。EBV主要经唾液传播，感染世界上大约95％的人口，是最常见，持续性的病毒感染。EBV可感染B淋巴细胞和上皮细胞。在急性感染期，EBV最初感染口咽部的复层鳞状上皮，随后复制并感染口咽部的B淋巴细胞，并能长期潜伏于循环记忆B淋巴细胞中。通常首次感染EBV后，无明显症状，EBV进入B淋巴细胞，通过病毒膜表面糖蛋白与细胞表面受体CD21或人类白细胞抗原II类分子(HLA-II)结合而感染B淋巴细胞，但并不复制，存储于记忆B淋巴细胞，建立潜伏感染模式。一旦这种平衡被打破，EBV感染则会引起B细胞相关肿瘤(Burkitt淋巴瘤、霍奇金淋巴瘤、非霍奇金淋巴瘤)，或者上皮细胞肿瘤(鼻咽癌等)。

EBV感染在鼻咽癌中的病理作用仍不完全清楚。研究发现鼻咽癌中体细胞突变的频率较低。鼻咽癌中表观遗传的改变，尤其是DNA的甲基化，与鼻咽癌的发生发展密切相关。抑癌基因RASSF1和CDKN2A启动子区域高甲基化，被认为是鼻咽癌发生的重要早期事件。一些重要的关键区域3p21.3、9p21、6p21.3等的甲基化改变，也在鼻咽癌的发生中发挥重要作用。全基因组甲基化研究提示，鼻咽癌的异常甲基化会抑制Wnt信号通路，具体表现为Wnt信号通路抑制剂DKK1、WIF1、SFRP1、SFRP2、SFRP4和SFRP5的启动子甲基化后表达下调，引起Wnt信号通路的功能异常，导致下游靶基因的转录异常。

基因的转录通常受启动子和增强子的调控。启动子区高水平的组蛋白修饰H3K4me3(trimethylation ofhistone H3 at lysine 4，组蛋白H3第4位赖氨酸三甲基化)、H3K9ac(histone H3 lysine 9acetylation，组蛋白H3第9位赖氨酸单乙酰化)、H3K14ac(histone H3 lysine 14acetylation，组蛋白H3第14位赖氨酸单乙酰化)，常常提示转录活跃。增强子是指一段具有增强特定基因表达的DNA作用元件。增强子周边通常含有H3K4me1(monomethylation of histone H3 at lysine 4,组蛋白H3第4位赖氨酸单甲基化)，H3K27ac(histone H3 lysine 27acetylation，组蛋白H3第27位赖氨酸的乙酰化)等组蛋白修饰。增强子有休眠和激活两种状态，激活的增强子可以增强靶基因的转录，休眠增强子指那些现在尚未被激活，但在细胞分化或者外界刺激的作用下，具有被激活能力的增强子。