[发明专利]一种与奶牛热应激相关的circRNA标志物及其应用

说明书

本发明公开一种与奶牛热应激相关的circRNA标志物及其应用，属于家畜分子标记制备技术领域。所述的circRNA标志物为circSCD，其序列如SEQ ID NO：1所示。所述circSCD在适温组奶牛乳腺组织中极显著高表达，其能通过吸附bta‑miR‑183影响奶牛泌乳，应用于热应激条件下改善奶牛泌乳过程。本发明公开的circSCD可以作为与奶牛热应激相关的分子标记，在遗传辅助改善奶牛品种(系)中具有重要的实际应用价值。

技术领域

本发明属于家畜分子标记制备技术领域，具体涉及一种与奶牛热应激相关的circRNA标志物及其应用。

背景技术

随着温室效应的产生，全球气候变暖，热应激已成为奶牛生产养殖过程中最重要的问题之一。目前我国的奶牛主要是来自荷兰的荷斯坦奶牛，其属于典型的耐寒怕热动物。不发达的汗腺，较差的散热能力，再加上泌乳时产生大量的代谢热，导致奶牛对高温天气的不耐受，极易在夏季，尤其是在我国南部地区产生热应激。据研究发现，热应激条件下，奶牛的泌乳量下降达20％～45％，这给我国的奶牛业造成了巨大的经济损失。

牛奶作为人类最好的食物之一，具有极高的营养价值,，其不仅包含了大多数营养素，还是人体内许多必须氨基酸的良好来源。但是随着奶牛热应激的产生，乳品质(乳蛋白，乳脂。乳糖)均显著下降。随着消费者对乳品质要求的日益提高，亟需改善热应激对牛奶的影响。因此，在奶牛乳腺组织水平上，分析热应激与泌乳相关性状之间的关系，发现优良性状相关基因控制泌乳的机理，对补充和完善当今奶牛泌乳的理论和生产实践十分必要和重要。

随着“基因组时代”的到来，在基因水平上对性状相关基因的表达情况进行解析，是目前奶牛泌乳工作的重要研究方向之一。环状RNA(circRNA)是非编码RNA中一种，作为继微小RNA(miRNA)和长链非编码RNA(lncRNA)后的RNA家族的又一研究热点，在生命体的生长和发展过程中发挥着重要作用。CircRNA可以作为miRNA的海绵进而接触其对靶基因的抑制作用。近年来，越来越多的证据表明，circRNA在细胞分化与凋亡、生长发育等多个生理和病理过程中均扮演着关键的角色，其中已发现热应激会影响circRNA的生物合成。

发明内容

为了克服现有技术的缺点与不足，本发明的首要目的在于提供一种与奶牛热应激相关的circRNA标志物。

本发明的另一目的在于提供上述circRNA标志物的应用。

本发明通过对冬季适温和夏季热应激奶牛乳腺组织进行高通量circRNA测序，筛选与奶牛热应激相关的分子标记，经过生物信息学差异表达分析circSCD在适温组奶牛乳腺组织中极显著高表达，其能通过吸附bta-miR-183调控发挥功能。本发明还公布了用于检测所述分子标记的检测方法，具有重要的实际应用价值。

本发明的目的通过下述技术方案实现：

本发明提供一种与奶牛热应激相关的circRNA标志物，该circRNA标志物为circSCD，其序列如SEQ ID NO：1所示。所述circSCD通过吸附bta-miR-183影响奶牛泌乳，应用于热应激条件下改善奶牛泌乳过程。

本发明还提供了一种circSCD的靶标miRNA，所述靶标为bta-miR-183：5′-UAUGGCACUGGUAGAAUUCACUG-3′，如SEQ ID NO：2所示。

本发明还提供一种circRNA标志物的引物，该引物为：

CircSCD的上游引物序列为：5′-CCTGGCTGGTGAATAGTGCT-3′，SEQ ID NO：3；

CircSCD的下游引物序列为：5′-ACCAGGTTTGTAGTACCCGC-3′，SEQ ID NO：4；

本发明还提供一种circSCD的靶标miRNA的检测引物，该引物为：