[发明专利]便秘致病菌及其用途

权利要求书

1.一种肠杆菌科细菌，其特征在于，

(1)细菌的基因组在选自以下的一个或多个位置具有相应核苷酸：PIB2013.g.331A、PIB2324.g.562G、PIB2324.g.601A、PIB2629.g.1126T、PIB3156.g.2396T，

(2)细菌的基因组具有选自以下的一个或多个特征：

由SEQ ID NO:9和10作为引物的基因组扩增片段的第21个核苷酸为A，

由SEQ ID NO:11和12作为引物的基因组扩增片段的第21个核苷酸为G，

由SEQ ID NO:13和14作为引物的基因组扩增片段的第21个核苷酸为A，

由SEQ ID NO:15和16作为引物的基因组扩增片段的第20个核苷酸为T，

由SEQ ID NO:17和18作为引物的基因组扩增片段的第21个核苷酸为T，

(3)细菌的基因组具有选自SEQ ID NO:2-6的任意一个或多个序列或其具有(2)中所述核苷酸的片段或与它们具有至少98％序列相同性的变体，或

(4)细菌的16S rDNA具有SEQ ID NO:1所示序列或与其具有至少98％序列相同性的序列，

优选地，所述细菌是志贺氏菌属细菌(Shigella sp.)，

优选地，所述细菌抑制肠道蠕动。

2.如权利要求1所述的细菌，其特征在于，

所述细菌使动物肠道蠕动幅度降低至少30％，

所述细菌使动物肠道蠕动张力降低至少30％，

所述细菌使动物肠道蠕动频率降低至少30％，

所述细菌降低肠传输速度至少10％，和/或

所述细菌降低动物粪便中的水含量至少20％。

3.一种组合物，包含本文权利要求1或2所述的细菌或其提取物、过滤物、上清液或裂解液，

优选地，所述组合物是药物组合物，所述组合物还包含药学上可接受的辅料，

优选地，所述组合物是细菌培养物，所述组合物还包含培养基。

4.寡核苷酸引物或探针，其特征在于，

所述寡核苷酸引物扩增细菌基因组的产物包含：

(1)所述细菌的基因组中位于与登记号为CGMCC 20603的细菌菌株的基因组的选自以下的一个或多个位置对应的位置的核苷酸：PIB2013.g.331、PIB2324.g.562、PIB2324.g.601、PIB2629.g.1126、PIB3156.g.2396，

(2)选自以下的一个或多个位置的核苷酸：

由SEQ ID NO:9和10作为引物的基因组扩增片段的第21个核苷酸，

由SEQ ID NO:11和12作为引物的基因组扩增片段的第21个核苷酸，

由SEQ ID NO:13和14作为引物的基因组扩增片段的第21个核苷酸，

由SEQ ID NO:15和16作为引物的基因组扩增片段的第20个核苷酸，

由SEQ ID NO:17和18作为引物的基因组扩增片段的第21个核苷酸，

(3)选自SEQ ID NO:2-6的任意一个或多个序列或其具有(2)中所述核苷酸的片段或与它们具有至少98％序列相同性的变体，或

(4)SEQ ID NO:1所示16S rDNA序列或与其具有至少98％序列相同性的序列；或者

所述探针识别的细菌基因组的片段包含：

(1)所述细菌的基因组中位于与登记号为CGMCC 20603的细菌菌株的基因组的选自以下的一个或多个位置对应的位置的核苷酸：PIB2013.g.331、PIB2324.g.562、PIB2324.g.601、PIB2629.g.1126、PIB3156.g.2396，

(2)所述细菌的选自以下的一个或多个位置的核苷酸：

由SEQ ID NO:9和10作为引物的基因组扩增片段的第21个核苷酸，

由SEQ ID NO:11和12作为引物的基因组扩增片段的第21个核苷酸，

由SEQ ID NO:13和14作为引物的基因组扩增片段的第21个核苷酸，

由SEQ ID NO:15和16作为引物的基因组扩增片段的第20个核苷酸，

由SEQ ID NO:17和18作为引物的基因组扩增片段的第21个核苷酸，或

(3)选自SEQ ID NO:2-6的任意一个或多个序列或其具有(2)中所述核苷酸的片段或与它们具有至少98％序列相同性的变体，或

所述探针识别SEQ ID NO:1所示16S rDNA序列或与其具有至少98％序列相同性的序列，

优选地，所述细菌是志贺氏菌属细菌。