[发明专利]一种与细毛羊羊毛性状相关的SNP标记及其检测引物组、试剂盒、检测方法和应用有效
| 申请号: | 202011000826.X | 申请日: | 2020-09-22 |
| 公开(公告)号: | CN112029872B | 公开(公告)日: | 2021-04-20 |
| 发明(设计)人: | 马月辉;蒋琳;梁奔梦;浦亚斌 | 申请(专利权)人: | 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所 |
| 主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12N15/11 |
| 代理公司: | 北京方圆嘉禾知识产权代理有限公司 11385 | 代理人: | 任霜 |
| 地址: | 100193 *** | 国省代码: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 细毛羊 羊毛 性状 相关 snp 标记 及其 检测 引物 试剂盒 方法 应用 | ||
1.一种用于检测细毛羊羊毛性状相关的SNP标记的方法,包括以下步骤:
1)提取待测绵羊的基因组DNA;
2)以待测绵羊的基因组DNA为模板,利用检测所述SNP标记的引物组进行PCR扩增反应,获得PCR扩增产物;
3)检测所述PCR扩增产物的第274bp处的基因型,得到所述SNP位点的基因型;
所述SNP分子标记位于绵羊第3号染色体第133486008bp位点;所述位点上存在A/C碱基突变,与细毛羊羊毛性状具有显著的相关性;所述SNP分子标记基于绵羊基因组序列信息版本号Oar_v4.0,2015年11月;
检测所述SNP标记的引物组包括正向引物和反向引物;所述正向引物的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示;所述反向引物的核苷酸序列如SEQ ID No.2所示。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤2)中所述PCR扩增反应的体系以25μl计包括以下组分:待测绵羊的基因组DNA 1μl,正向引物和反向引物各1μl,dNTP mix 0.5μl,PhantaMax Super-Fidelity DNA聚合酶0.5μl,2×PCR反应缓冲液12.5μl和余量的双蒸水;
所述待测绵羊的基因组DNA的浓度为50~100ng/μl;所述正向引物和反向引物的浓度分别为10pmol/μl;所述dNTPmix的浓度为10mmol/L。
3.根据权利要求1或2所述的方法,其特征在于,步骤2)中所述PCR扩增反应的程序为:95℃预变性5min;95℃变性30s,60℃退火30s,72℃延伸2min,共35个循环;72℃保温2min。
4.权利要求1~3任意一项所述方法在筛选细毛羊羊毛性状的绵羊中的应用。
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