[发明专利]一种多碱基基因测序中信号归一化的方法在审

专利信息
申请号: 202010986791.5 申请日: 2020-09-18
公开(公告)号: CN114196744A 公开(公告)日: 2022-03-18
发明(设计)人: 周文雄;乔朔;陈子天;段海峰 申请(专利权)人: 赛纳生物科技(北京)有限公司
主分类号: C12Q1/6869 分类号: C12Q1/6869;G16B30/00
代理公司: 北京嘉途睿知识产权代理事务所(普通合伙) 11793 代理人: 彭成
地址: 100176 北京市大兴*** 国省代码: 北京;11
权利要求书: 查看更多 说明书: 查看更多
摘要:
搜索关键词: 一种 碱基 基因 测序中 信号 归一化 方法
【权利要求书】:

1.一种多碱基基因测序中信号归一化的方法,其特征在于包括,

(1)在待测基因序列的端部接入标准序列;

(2)通入测序反应液,对待测序列测序,获得对应于标准序列以及待测基因序列的信号,每次通入测序反应液获得一个测序信号,记为f,多次测序的信号分别记为fnm,其中n为测序反应的轮数,其中m为该轮测序中,通入重复反应液的次数;

(3)利用理想信号hnm,其中n同为测序反应的轮数;以及背景信号U,通过公式hnmX+U=fnm获得测序的背景信号、单位信号X;

其中,所述标准序列是已知的;所述理想信号指的是理论上测序延伸的碱基数;

其中,所述方法满足下面两个条件中的至少一种:

条件一:即n大于等于2;并且,多个理想信号hnm中,至少有一个理想信号等于0;

条件二:n大于等于3,标准序列的奇数轮的理想信号和/或偶数轮的理想信号不完全相同;所述的标准序列的理想信号中,奇数轮的理想信号和/或偶数次的理想信号不完全相等。

2.一种多碱基基因测序中获得背景信号的方法,其特征在于包括,

(1)在待测基因序列的端部接入标准序列;

(2)通入测序反应液,测序,获得对应于标准序列以及待测基因序列的信号,每次通入测序反应液获得一个测序信号;

(3)通过下面两种方法中的至少一种,获得背景信号:

方法一:第一次通入反应液的理想信号为0;

方法二:连续通入两次相同的反应液,以第二次的信号作为背景信号;

其中,所述标准序列的基因序列是已知的。

3.一种多碱基基因测序中获得单位信号的方法,其特征在于包括,

(1)在待测基因序列的端部接入标准序列;

(2)通入测序反应液,测序,获得对应于标准序列以及待测基因序列的信号,每次通入测序反应液获得一个测序信号;

(3)通过下面两种方法中的至少一种,获得单位信号:

方法一:第一次通入反应液的理想信号为0;

方法二:连续通入两次相同的反应液,以第二次的信号作为背景信号;

其中,所述标准序列的基因序列是已知的;所述测序反应液至少包括两种包含有不同碱基测序底物分子的反应液。

4.根据权利要求1-3任一项所述的方法,其特征在于,

所述基因测序指的是,MK,RY,WS测序中的一种或多种。

5.根据权利要求1-3任一项所述的方法,其特征在于,

所述的测序指的是利用荧光切换的底物分子进行测序的方法。

6.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,

所述的背景信号不为零。

7.根据前面任一项权利要求所述的方法,其特征在于,所述MK,RY,WS测序指的是多碱基测序;MK测序指的是,包含两个反应液,第一个反应液中包含A和C,第二个反应液中包含G和T,两个反应液循环加入进行测序;RY测序指的是,包含两个反应液,第一个反应液中包含A和G,第二个反应液中包含C和T,两个反应液循环加入进行测序;WS测序指的是,包含两个反应液,第一个反应液中包含A和T,第二个反应液中包含G和C,两个反应液循环加入进行测序。

8.根据权利要求7所述的方法,其特征在于,两个反应液循环加入,包括同一个反应液加入多于一次,重复测序的方法。

下载完整专利技术内容需要扣除积分,VIP会员可以免费下载。

该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息,商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于赛纳生物科技(北京)有限公司,未经赛纳生物科技(北京)有限公司许可,擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作,请联系【客服

本文链接:http://www.vipzhuanli.com/pat/books/202010986791.5/1.html,转载请声明来源钻瓜专利网。

×

专利文献下载

说明:

1、专利原文基于中国国家知识产权局专利说明书;

2、支持发明专利 、实用新型专利、外观设计专利(升级中);

3、专利数据每周两次同步更新,支持Adobe PDF格式;

4、内容包括专利技术的结构示意图流程工艺图技术构造图

5、已全新升级为极速版,下载速度显著提升!欢迎使用!

请您登陆后,进行下载,点击【登陆】 【注册】

关于我们 寻求报道 投稿须知 广告合作 版权声明 网站地图 友情链接 企业标识 联系我们

钻瓜专利网在线咨询

周一至周五 9:00-18:00

咨询在线客服咨询在线客服
tel code back_top