[发明专利]一种多碱基基因测序中信号归一化的方法

说明书

本发明公开了一种多碱基基因测序中信号归一化的方法，利用标准序列的已知信号，可以获得测序的背景信号，从而将信号归一化。更准确的说，本发明公开了一种多碱基测序的过程中，信号校正的方法，利用一段已知信息的校准序列，结合其测序所获得的测序信号，通过计算测序的背景信号与单位信号，从而信号归一化的方法。本发明所公开的方式适用于多碱基测序。

技术领域

本发明涉及一种多碱基基因测序中信号归一化的方法；属于基因测序领域。

背景技术

基因测序在近年越来越受到关注，并且逐步走向成熟。随着研究的不断深入，技术的不断成熟，基因测序的成本也越来越低。基因测序越来越广泛的应用于各个方面。特别的，医疗领域的应用是十分显著的。基因测序技术中，一代基因测序技术由于其成本高、测序速度慢等原因，已经基本上被淘汰。三代或者四代基因测序技术，由于其准确率低，并且通量低，也没有得到广泛的应用。目前，主流的基因测序技术还是二代测序技术，也就是高通量测序技术。二代测序技术主要是利用双链合成中的化学反应，例如化学发光等，检测信号从而得到基因测序的结果。高通量基因测序的过程中，由于其通量十分高，因此一般的每个数据点的大小都很小，在几百纳米到几个微米的级别。这种量级下，准确测量每个点的精确信号是比较复杂的，因此，经常需要根据基因测序技术的不同，对于基因测序的信号区别性的处理。本发明公开一种基因测序中信号归一化的方法，特别适用于多碱基的测序过程，利用标准序列或者参考序列，得到区域性的背景信号和单位信号的数值，从而将基因测序的信号归一化。

发明内容

为了解决所述的多碱基基因测序中信号处理的问题，本发明提出如下技术方案：

本发明公开一种多碱基基因测序中信号归一化的方法，其特征在于包括，

(1)在待测基因序列的端部接入标准序列；

(2)通入测序反应液，对待测序列测序，获得对应于标准序列以及待测基因序列的信号，每次通入测序反应液获得一个测序信号，记为f，多次测序的信号分别记为fnm，其中n为测序反应的轮数,其中m为该轮测序中，通入重复反应液的次数；

(3)利用理想信号hnm，其中n同为测序反应的轮数；以及背景信号U，通过公式hnX+U＝fn获得测序的背景信号、单位信号X；

其中，所述标准序列是已知的；所述理想信号指的是理论上测序延伸的碱基数；

其中，所述方法满足下面两个条件中的至少一种：

条件一：即n大于等于2；并且，多个理想信号hnm中，至少有一个理想信号等于0；

条件二：n大于等于3，标准序列的奇数轮的理想信号和/或偶数轮的理想信号不完全相同；所述的标准序列的理想信号中，奇数轮的理想信号和/或偶数次的理想信号不完全相等。

同时本发明公开一种多碱基基因测序中获得背景信号的方法，其特征在于包括，

(1)在待测基因序列的端部接入标准序列；

(2)通入测序反应液，测序，获得对应于标准序列以及待测基因序列的信号，每次通入测序反应液获得一个测序信号；

(3)通过下面两种方法中的至少一种，获得背景信号：

方法一：第一次通入反应液的理想信号为0；

方法二：连续通入两次相同的反应液，以第二次的信号作为背景信号；

其中，所述标准序列的基因序列是已知的。

本发明同时提供一种多碱基基因测序中获得单位信号的方法，其特征在于包括，

(1)在待测基因序列的端部接入标准序列；