[发明专利]一种用于评估猪背膘厚的SNP标记及其检测方法

权利要求书

1.一种与猪背膘厚相关的SNP标记，其特征在于，所述SNP标记位于ENSSSCG00000004081基因上，

其对应于国际猪参考基因组10.2版本参考序列1号染色体第139,495,55处的TC突变。

2.根据权利要求1所述的SNP标记，其特征在于，所述SNP标记位于核苷酸片段一的第151个核苷酸处，该处的碱基类型的差异导致猪背膘厚度不同，所述核苷酸片段一的序列如SEQ ID NO：1所示。

3.根据权利要求1所述的SNP标记，其特征在于，所述与猪背膘厚相关的SNP标记位点的等位基因为T和C，包括CC和TC两种基因型；

优选地，SNP位点的基因型为CC的猪背膘厚低于SNP位点基因型为TC的猪背膘厚。

4.一种基于权利要求1至3之一所述SNP标记开发分子标记的方法，其特征在于，以含有所述SNP标记的核苷酸序列为基础序列，设计引物对，以猪基因组DNA为模板进行PCR扩增，使所述的SNP标记转化为分子标记。

5.一种用于检测权利要求1至3之一所述SNP标记的引物对，其特征在于，所述引物对的上游引物为P6，其包括如SEQ ID NO：7所示的核苷酸序列；所述引物对的下游引物为P7，其包括如SEQ ID NO：8所示的核苷酸序列。

6.一种权利要求1至3之一所述SNP标记的检测方法，其特征在于，所述方法包括以下步骤：

步骤1，根据SNP标记的核苷酸序列设计引物；

步骤2，以被检测猪的基因组DNA作为模板进行扩增；

步骤3，判断扩增产物中是否存在该SNP标记。

7.一种权利要求1至3之一所述SNP标记在预测猪背膘厚中的应用，其特征在于，所述应用包括检测待测猪的国际猪参考基因组10.2版本参考序列1号染色体第139,495,55处SNP标记的基因型的步骤。

8.根据权利要求7所述的应用，其特征在于，所述应用包括以下步骤：

步骤I，提取待测猪的基因组DNA；

步骤II，以基因组DNA为模板，进行PCR扩增；

步骤III，确定待测猪所述SNP标记的基因型；

步骤IV，根据基因型确定待测猪的背膘厚度。

9.一种低背膘厚种猪选育系统，其特征在于，所述系统包括：

候选猪获取设备，用于提供多头候选猪；

性状预测设备，其与候选猪获取设备相连，用于预测猪背膘厚；

培育设备，其与性状预测设备相连，用于基于性状预测设备的预测结果，选择并培育具有低背膘厚的候选猪。

10.权利要求1至3之一所述的SNP标记、权利要求5所述的引物对、权利要求9所述的低背膘厚种猪选育系统在猪育种中的应用，所述猪育种为分子标记辅助育种。