[发明专利]一种基于DNA互锁结构的DNA分子检测方法有效
| 申请号: | 202010850525.X | 申请日: | 2020-08-21 |
| 公开(公告)号: | CN111926062B | 公开(公告)日: | 2021-03-23 |
| 发明(设计)人: | 阳莎;陈鸣;唱凯;詹新宇;肖瑶;汤晓琦;赵爽 | 申请(专利权)人: | 中国人民解放军陆军军医大学第一附属医院 |
| 主分类号: | C12Q1/682 | 分类号: | C12Q1/682;C12Q1/683 |
| 代理公司: | 北京同恒源知识产权代理有限公司 11275 | 代理人: | 赵荣之 |
| 地址: | 400038 重*** | 国省代码: | 重庆;50 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 基于 dna 互锁 结构 分子 检测 方法 | ||
1.一种基于DNA互锁结构的非诊断性DNA分子检测方法,其特征在于,所述检测方法步骤如下:
(1)根据待测DNA序列设计DNA单链环C1和DNA单链L2,DNA单链L2两端序列与DNA单链环C1的一段序列全部杂交,DNA连接酶连接DNA单链L2两端序列缺口,形成DNA单链双环C1C2;所述DNA单链L2的中间序列上具有与所述待测DNA互补的序列;
(2)待测DNA与DNA单链双环C1C2上的待测DNA互补序列杂交,形成部分双链DNA,所述部分双链DNA上具有限制性内切酶酶切位点;
(3)加入限制性内切酶切割步骤(2)中的限制性内切酶酶切位点,以DNA单链环C1为模板,进行RCA反应,得到RCA反应产物;
(4)在RCA反应产物基础上进行支链RCA反应,得到支链RCA反应产物,最后检测支链RCA反应产物中双链DNA含量。
2.如权利要求1所述的DNA分子检测方法,其特征在于,步骤(1)中,所述DNA连接酶为T4连接酶。
3.如权利要求1所述的DNA分子检测方法,其特征在于,步骤(4)中,所述检测为:用双链DNA荧光染料对所述支链RCA反应产物染色,荧光检测所述支链RCA反应产物双链DNA含量。
4.如权利要求1-3任一所述的DNA分子检测方法,其特征在于,步骤(1)中,所述待测DNA的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。
5.如权利要求4所述的DNA分子检测方法,其特征在于,步骤(1)中,所述DNA单链L2的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示。
6.如权利要求5所述的DNA分子检测方法,其特征在于,步骤(1)中,所述DNA单链环C1的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示。
7.如权利要求4所述的DNA分子检测方法,其特征在于,步骤(3)中,所述限制性内切酶为HpyCH4IV。
8.如权利要求6所述的DNA分子检测方法,其特征在于,步骤(4)中,所述RCA反应中所用引物的核苷酸序列为SEQ ID NO.4。
9.如权利要求6所述的DNA分子检测方法,其特征在于,步骤(4)中,所述支链RCA反应中所用正向和反向引物的核苷酸序列为SEQ ID NO.5、SEQ ID NO.6。
10.如权利要求9所述的DNA分子检测方法,其特征在于,所述检测方法的待测DNA最低检测限值为 0.2%。
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