[发明专利]一种基于DNA互锁结构的DNA分子检测方法有效

专利信息
申请号: 202010850525.X 申请日: 2020-08-21
公开(公告)号: CN111926062B 公开(公告)日: 2021-03-23
发明(设计)人: 阳莎;陈鸣;唱凯;詹新宇;肖瑶;汤晓琦;赵爽 申请(专利权)人: 中国人民解放军陆军军医大学第一附属医院
主分类号: C12Q1/682 分类号: C12Q1/682;C12Q1/683
代理公司: 北京同恒源知识产权代理有限公司 11275 代理人: 赵荣之
地址: 400038 重*** 国省代码: 重庆;50
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摘要:
搜索关键词: 一种 基于 dna 互锁 结构 分子 检测 方法
【权利要求书】:

1.一种基于DNA互锁结构的非诊断性DNA分子检测方法,其特征在于,所述检测方法步骤如下:

(1)根据待测DNA序列设计DNA单链环C1和DNA单链L2,DNA单链L2两端序列与DNA单链环C1的一段序列全部杂交,DNA连接酶连接DNA单链L2两端序列缺口,形成DNA单链双环C1C2;所述DNA单链L2的中间序列上具有与所述待测DNA互补的序列;

(2)待测DNA与DNA单链双环C1C2上的待测DNA互补序列杂交,形成部分双链DNA,所述部分双链DNA上具有限制性内切酶酶切位点;

(3)加入限制性内切酶切割步骤(2)中的限制性内切酶酶切位点,以DNA单链环C1为模板,进行RCA反应,得到RCA反应产物;

(4)在RCA反应产物基础上进行支链RCA反应,得到支链RCA反应产物,最后检测支链RCA反应产物中双链DNA含量。

2.如权利要求1所述的DNA分子检测方法,其特征在于,步骤(1)中,所述DNA连接酶为T4连接酶。

3.如权利要求1所述的DNA分子检测方法,其特征在于,步骤(4)中,所述检测为:用双链DNA荧光染料对所述支链RCA反应产物染色,荧光检测所述支链RCA反应产物双链DNA含量。

4.如权利要求1-3任一所述的DNA分子检测方法,其特征在于,步骤(1)中,所述待测DNA的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。

5.如权利要求4所述的DNA分子检测方法,其特征在于,步骤(1)中,所述DNA单链L2的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示。

6.如权利要求5所述的DNA分子检测方法,其特征在于,步骤(1)中,所述DNA单链环C1的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示。

7.如权利要求4所述的DNA分子检测方法,其特征在于,步骤(3)中,所述限制性内切酶为HpyCH4IV。

8.如权利要求6所述的DNA分子检测方法,其特征在于,步骤(4)中,所述RCA反应中所用引物的核苷酸序列为SEQ ID NO.4。

9.如权利要求6所述的DNA分子检测方法,其特征在于,步骤(4)中,所述支链RCA反应中所用正向和反向引物的核苷酸序列为SEQ ID NO.5、SEQ ID NO.6。

10.如权利要求9所述的DNA分子检测方法,其特征在于,所述检测方法的待测DNA最低检测限值为 0.2%。

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