[发明专利]雄激素受体剪接变异体-7核酸定量检测方法、内标及试剂盒在审
| 申请号: | 202010779376.2 | 申请日: | 2020-08-05 |
| 公开(公告)号: | CN112029855A | 公开(公告)日: | 2020-12-04 |
| 发明(设计)人: | 王晓楠;乔春晓;张亚楠 | 申请(专利权)人: | 上海思路迪医学检验所有限公司 |
| 主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12Q1/6851;C12N15/11 |
| 代理公司: | 北京市兰台律师事务所 11354 | 代理人: | 张峰 |
| 地址: | 200120 上海市浦*** | 国省代码: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 激素 受体 剪接 异体 核酸 定量 检测 方法 试剂盒 | ||
1.一种荧光PCR定量检测AR-V7的方法,其特征在于,包括:
S1、提供一包括AR-V7和已知浓度或模板量的AR-V7 QS内标的荧光PCR反应体系;
所述荧光PCR反应体系还包括用于检测AR-V7的上、下游引物及探针,以及用于检测AR-V7 QS的上、下游引物及探针,其中用于检测AR-V7的上、下游引物序列分别与用于检测AR-V7 QS的上、下游引物序列相同;
所述AR-V7 QS包括与所述AR-V7相同的上、下游引物识别序列,以及位于上、下游引物识别序列之间的探针识别序列Ⅰ;所述AR-V7包括位于上、下游引物识别序列之间的探针识别序列Ⅱ;
所述探针识别序列Ⅰ与所述探针识别序列Ⅱ的碱基组成相同而碱基排列顺序不同;
S2、进行扩增反应,并检测AR-V7和AR-V7 QS二者的Ct值,则所述样本中AR-V7的浓度或模板量采用如下的公式计算,
AR-V7浓度=(2^ΔCт)×AR-V7 QS浓度,
AR-V7模板量=(2^ΔCт)×AR-V7 QS模板量,
其中ΔCт为AR-V7 QS的Ct值与AR-V7的Ct值的差值。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述用于检测AR-V7 QS的探针序列与所述探针识别序列Ⅰ相同或互补,所述用于检测AR-V7的探针序列与所述探针识别序列Ⅱ相同或互补。
3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述用于检测AR-V7 QS的上、下游引物序列分别与AR-V7 QS的上、下游引物识别序列相同或互补,所述用于检测AR-V7的上、下游引物序列分别与AR-V7的上、下游引物识别序列相同或互补。
4.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述探针识别序列Ⅰ与所述探针识别序列Ⅱ中至少4个碱基的排列顺序不同。
5.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,所述AR-V7 QS在除所述探针识别序列Ⅰ之外的区域与所述AR-V7在除所述探针识别序列Ⅱ之外的区域序列相同。
6.根据权利要求5所述的方法,其特征在于,
所述AR-V7 QS的序列为:
TTGTCCATCTTGTCGTCTTCGGAAATGT
CTCTGGGAGAAAAATTCCGGGTTGGCAATTG,其中下划线部分为所述探针识别序列Ⅰ。
7.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,所述用于检测AR-V7 QS的上、下游引物及探针分别为:
AR-V7 QS上游引物:TTGTCCATCTTGTCGTCTTCG
AR-V7 QS下游引物:CAATTGCCAACCCGGAATTT
AR-V7 QS探针:TGATAGCAAGAGGGTA。
8.根据权利要求7所述的方法,其特征在于,所述用于检测AR-V7的上、下游引物及探针分别为:
AR-V7上游引物:TTGTCCATCTTGTCGTCTTCG
AR-V7下游引物:CAATTGCCAACCCGGAATTT
AR-V7探针:TATGAAGCAGGGATGA。
9.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,在50uL的扩增反应体系中所述AR-V7 QS的模板量为50copies。
10.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述AR-V7的浓度或模板量的范围是:在AR-V7 QS存在的情况下,所述AR-V7的浓度或模板量分别与AR-V7的Ct值线性相关的范围。
11.根据权利要求10所述的方法,其特征在于,在50uL的扩增反应体系中,所述AR-V7的模板量在5copies到50000copies之间。
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