[发明专利]一种高通量测序污染检测用分子标签组及其应用在审

专利信息
申请号: 202010751025.0 申请日: 2020-07-30
公开(公告)号: CN111944806A 公开(公告)日: 2020-11-17
发明(设计)人: 杨敬敏;唐嘉婕;林健;朱学萍;高鹏飞 申请(专利权)人: 上海韦翰斯生物医药科技有限公司
主分类号: C12N15/11 分类号: C12N15/11;C12Q1/6869;C12Q1/6806
代理公司: 上海光华专利事务所(普通合伙) 31219 代理人: 朱凌娇;许亦琳
地址: 201318 上海市浦东*** 国省代码: 上海;31
权利要求书: 查看更多 说明书: 查看更多
摘要:
搜索关键词: 一种 通量 污染 检测 分子 标签 及其 应用
【说明书】:

发明提供一种高通量测序污染检测用分子标签组,所述分子标签组中包括若干不同的分子标签;不同的分子标签长度不同;所述分子标签为核酸片段。利用本发明所述的分子标签组进行样本检测时,在样本预处理前,将适量拷贝的分子标签混入样本中,样本类型包括但不限于血液、唾液、血浆、DNA等。混入有分子标签的样本进行核酸提取、文库构建、多重PCR、杂交捕获等环节,最终通过特异性地扩增文库中包含的分子标签,并利用片段分析仪器检测扩增产物长度分布,快速简单地判断样本是否发生混淆或交叉污染并确定污染源。

技术领域

本发明涉及生物信息学和生物技术领域,特别是涉及一种高通量测序污染检测用分子标签组及其应用。

背景技术

二代测序与一代测序、PCR等检测手段相比,检测周期相对较长,检测过程也更为复杂,一个检测周期包括样本预处理、核酸提取、文库构建、测序、数据分析等步骤。整个检测周期,从样本到数据,经历多个检测环节和多个检测人员,一旦发生了样本混淆、样本相互污染等情况,将产生错误的数据分析结果。因此,样本溯源和污染识别,是产生正确的二代测序结果的前提和保证。

二代测序中常用的样本溯源方法,是给不同样本加上不同的标签,得以在数据中识别并拆分。具体的说,二代测序在文库构建过程中,会在文库两端加上测序平台通用接头,以使得文库可以在测序平台上被测序。通用接头包含了一段用于在测序下机数据中识别区分样本的标签序列,同一次测序反应中,不同文库会加上不同的标签序列,使得数据分析人员得以在下机数据中,将不同样本文库的数据拆分开,单独进行后续分析。如果实验过程中,不同文库之间的标签序列发生了交叉污染,将导致数据拆分时,一个样本中错误地混入另一个样本的数据。如果无法识别这种交叉污染,也会得出错误的分析结果。

还有一种用于二代测序中样本溯源的方法,即选择一些SNP位点,用更简单快速的方法检测样本DNA中的这些SNP位点,与最终数据中这些SNP分型对比,以此判断样本是否属于同一来源。这种方法需要在常规的检测流程基础上增加一个额外的SNP检测,对人力物力时间成本的消耗也相应的增加。

还有一些实验室通过样本采集管多处注明、建立样本信息追踪单、设置实验评选重复以及不同处理条件下的标志物等方法来规避样本混淆,这些操作不仅复杂也不适用于临床检测。

发明内容

鉴于以上所述现有技术的缺点,本发明的目的在于提供一种高通量测序污染检测用分子标签组及其应用。

本发明第一方面提供一种高通量测序污染检测用分子标签组,所述分子标签组中包括若干不同的分子标签;不同的分子标签长度不同;所述分子标签为核酸片段。

本发明第二方面提供一种高通量测序污染的检测方法,所述方法至少包括如下步骤:在每个样本中引入选自前述的分子标签组中的一个或多个分子标签,其中,各样本引入的分子标签中,至少包括一个特有分子标签,所述特有分子标签是指与其他样本引入的分子标签均不同的分子标签。

本发明第三方面提供一种高通量测序污染的样本区分方法,所述方法至少包括如下步骤:在每个样本中引入选自前述的分子标签组中的一个或多个分子标签,其中,各样本引入的分子标签中,至少包括一个特有分子标签,所述特有分子标签是指与其他样本引入的分子标签均不同的分子标签。

本发明第三方面提供高通量测序污染检测用分子标签组,或前述的高通量测序污染的检测方法或前述高通量测序的样本区分方法在基因测序中的用途。

如上所述,本发明的一种高通量测序污染检测用分子标签组及其应用,具有以下有益效果:

下载完整专利技术内容需要扣除积分,VIP会员可以免费下载。

该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息,商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于上海韦翰斯生物医药科技有限公司,未经上海韦翰斯生物医药科技有限公司许可,擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作,请联系【客服

本文链接:http://www.vipzhuanli.com/pat/books/202010751025.0/2.html,转载请声明来源钻瓜专利网。

×

专利文献下载

说明:

1、专利原文基于中国国家知识产权局专利说明书;

2、支持发明专利 、实用新型专利、外观设计专利(升级中);

3、专利数据每周两次同步更新,支持Adobe PDF格式;

4、内容包括专利技术的结构示意图流程工艺图技术构造图

5、已全新升级为极速版,下载速度显著提升!欢迎使用!

请您登陆后,进行下载,点击【登陆】 【注册】

关于我们 寻求报道 投稿须知 广告合作 版权声明 网站地图 友情链接 企业标识 联系我们

钻瓜专利网在线咨询

周一至周五 9:00-18:00

咨询在线客服咨询在线客服
tel code back_top