[发明专利]一种高通量测序污染检测用分子标签组及其应用在审
| 申请号: | 202010751025.0 | 申请日: | 2020-07-30 |
| 公开(公告)号: | CN111944806A | 公开(公告)日: | 2020-11-17 |
| 发明(设计)人: | 杨敬敏;唐嘉婕;林健;朱学萍;高鹏飞 | 申请(专利权)人: | 上海韦翰斯生物医药科技有限公司 |
| 主分类号: | C12N15/11 | 分类号: | C12N15/11;C12Q1/6869;C12Q1/6806 |
| 代理公司: | 上海光华专利事务所(普通合伙) 31219 | 代理人: | 朱凌娇;许亦琳 |
| 地址: | 201318 上海市浦东*** | 国省代码: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 通量 污染 检测 分子 标签 及其 应用 | ||
1.一种高通量测序污染检测用分子标签组,其特征在于,
所述分子标签组中包括若干不同的分子标签;不同的分子标签长度不同;所述分子标签为核酸片段。
2.如权利要求1所述的高通量测序污染检测用分子标签组,其特征在于,还包括以下特征中的一项或多项:
1)所述分子标签的序列与样本的同源性低;优选的,同源性低于90%;
2)所述分子标签包括相同段和长度特异性段,所述相同段的长度相同,碱基排列顺序相同;
3)所述分子标签组中各分子标签均来源于同一分子标签源片段。
3.如权利要求2所述的高通量测序污染检测用分子标签组,其特征在于,还包括以下特征中的一项或多项:
1)所述分子标签组包括两个以上长度不同的分子标签;
2)所述分子标签源片段来自病毒基因组序列。
4.如权利要求3所述的高通量测序污染检测用分子标签组,其特征在于,所述分子标签源片段来源于病毒phix174的基因组序列,优选的,所述分子标签源片段的序列如SEQ IDNO:18所示。
5.如权利要求4所述的高通量测序污染检测用分子标签组,其特征在于,所述分子标签组中的分子标签序列选自SEQ ID NO:1~17中的一个或多个。
6.如权利要求1所述的高通量测序污染检测用分子标签组,其特征在于,所述分子标签长度为100bp-20kb。
7.如权利要求6所述的高通量测序污染检测用分子标签组,其特征在于,测序样本为片段化DNA时,所述分子标签为短片段分子标签,所述短片段分子标签的长度为100-300bp;测序样本为gDNA时,所述分子标签为长片段分子标签,所述长片段分子标签的长度为1kb~20kb。
8.一种高通量测序污染的检测方法,其特征在于,所述方法至少包括如下步骤:在每个样本中引入选自权利要求1-7中任一项所述的分子标签组中的一个或多个分子标签,其中,各样本引入的分子标签中,至少包括一个特有分子标签,所述特有分子标签是指与其他样本引入的分子标签均不同的分子标签。
9.如权利要求8所述的高通量测序污染的检测方法,其特征在于,所述方法至少包括如下步骤:
(1)在每个样本中引入选自权利要求1-7中任一项所述的分子标签组的分子标签;
(2)获取每个样本中的核酸片段,将核酸片段和接头进行连接,进行基因文库构建;
(3)利用分子标签的通用引物扩增步骤(2)获得的产物;
(4)分析步骤(3)获得的扩增产物的片段长度,若样本m中出现n样本的特有分子标签的长度峰,则m样本被n样本污染;若m样本中没有其他样本特有分子标签的长度峰出现,则m样本没有被污染。
10.如权利要求9所述的高通量测序污染的检测方法,其特征在于,所述方法还包括以下步骤:
(21)将步骤(2)中获得的基因文库,与杂交探针进行杂交捕获,获得捕获文库;所述杂交探针包括分子标签特异性探针和样本探针。
11.一种高通量测序的样本区分方法,所述方法至少包括如下步骤:在每个样本中引入选自权利要求1-7中任一项所述的分子标签组中的一个或多个分子标签,其中,各样本引入的分子标签中,至少包括一个特有分子标签,所述特有分子标签是指与其他样本引入的分子标签均不同的分子标签。
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