[发明专利]一种检测SARS-COV-2的双链引物探针、试剂盒及多重PCR方法有效

专利信息
申请号: 202010721476.X 申请日: 2020-07-24
公开(公告)号: CN111733293B 公开(公告)日: 2023-10-20
发明(设计)人: 姚娟;张章 申请(专利权)人: 西南医科大学附属中医医院
主分类号: C12Q1/70 分类号: C12Q1/70;C12Q1/6851;C12N15/11
代理公司: 上海光华专利事务所(普通合伙) 31219 代理人: 代玲
地址: 646000 四川*** 国省代码: 四川;51
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摘要:
搜索关键词: 一种 检测 sars cov 引物 探针 试剂盒 多重 pcr 方法
【权利要求书】:

1.一种检测SARS-COV-2的多重荧光定量PCR双链引物探针,其特征在于,所述双链引物探针包括用于检测SARS-COV-2病毒的ORF1ab、N和E基因序列的特异性引物探针,其中,针对ORF1ab基因序列的特异性引物探针序列如下:

上游双链引物探针的序列如SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示,

下游引物的序列如SEQ ID NO.3所示;

针对N基因序列的特异性引物探针序列如下:

上游双链引物探针的序列如SEQ ID NO.4和SEQ ID NO.5所示,

下游引物的序列如SEQ ID NO.6所示;

针对E基因序列的特异性引物探针序列如下:

上游双链引物探针的序列如SEQ ID NO.7和SEQ ID NO.8所示,

下游引物的序列如SEQ ID NO.9所示。

2.根据权利要求1所述的双链引物探针,其特征在于:所述荧光探针的5’端均连接有荧光基团,所述荧光探针的3’端均连接有淬灭基团。

3.根据权利要求2所述的双链引物探针,其特征在于:所述荧光基团选自FAM、HEX、ROX中的任意一种,所述淬灭基团选自BHQ1、Dabcyl中的任意一种。

4.一种检测SARS-COV-2的多重荧光定量PCR试剂盒,其特征在于:所述试剂盒含有如权利要求1-3任一项所述的双链引物探针。

5.根据权利要求4所述的试剂盒,其特征在于:所述上游双链引物探针和下游引物的浓度均为10μM。

6.根据权利要求4所述的试剂盒,其特征在于:所述试剂盒还包括PCR反应缓冲液、阳性对照品、阴性对照品。

7.根据权利要求6所述的试剂盒,其特征在于:所述阳性对照品为包含SARS-COV-2病毒ORF、E和N基因的质粒,阴性对照品为去离子水。

8.根据权利要求7所述的试剂盒,其特征在于:所述试剂盒进行荧光定量PCR的反应体系为:去离子水5.5μL,PCR反应缓冲液12.5μL,DNA模板5μL,上游双链引物探针10uM、1μL,下游引物10μM、1μL;

和/或,所述试剂盒进行荧光定量PCR的扩增程序为:

逆转录,55℃,持续时间10min;

预变性,95℃,持续时间3min;

变性,95℃,持续时间15s,循环数50个;

退火,57℃,持续时间15s,循环数50个;

延伸,72℃,持续时间15s,循环数50个;

荧光收集,45℃,持续时间5s,循环数50个。

9.一种检测SARS-COV-2的双链引物探针多重荧光定量PCR方法,其特征在于:从样本中提取SARS-COV-2病毒,采用如权利要求4-8任一项所述的试剂盒,同时扩增SARS-COV-2病毒的ORF1ab、N和E基因,然后对扩增产物进行多重荧光定量PCR检测。

10.根据权利要求9所述的多重荧光定量PCR方法,其特征在于,包括如下步骤:

(1)将如第二方面所述的试剂盒中的试剂混匀后瞬时离心,得到PCR反应液,将PCR反应液分装至PCR反应管中;

(2)将DNA模板加入PCR反应管中,将PCR反应液与DNA模板振荡混匀后瞬时离心,并记录DNA模板加样顺序;

(3)同时扩增SARS-COV-2病毒的ORF1ab、N和E基因,然后对扩增产物进行多重荧光定量PCR检测,收集荧光信号。

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