[发明专利]自噬相关基因在结直肠癌预后的试剂盒和系统中的应用在审
| 申请号： | 202010604670.X | 申请日： | 2020-06-29 |
| 公开（公告）号： | CN112037851A | 公开（公告）日： | 2020-12-04 |
| 发明（设计）人： | 邹一丰;林绪涛;高峰;吴小剑;兰平 | 申请（专利权）人： | 中山大学附属第六医院 |
| 主分类号： | G16B20/00 | 分类号： | G16B20/00;G16B30/10;G16H20/17;G16H50/20;C12Q1/6886 |
| 代理公司： | 广州三环专利商标代理有限公司 44202 | 代理人： | 颜希文 |
| 地址： | 510655 广东*** | 国省代码： | 广东;44 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 相关 基因 直肠癌 预后 试剂盒 系统 中的 应用 | ||
1.基因CD163L1、FAM13B、HDAC6、HPR、NR2C2、RAB12、SIRT2、TBC1D14、TLK2和TBC1D12的联合使用在制备用于预测结直肠癌病人预后的试剂盒中的应用。
2.检测自噬基因表达水平的试剂在制备用于预测结直肠癌病人预后的试剂盒中的用途，其特征在于，所述试剂用于检测基因CD163L1、FAM13B、HDAC6、HPR、NR2C2、RAB12、SIRT2、TBC1D14、TLK2和TBC1D12的表达水平。
3.一种用于预测结直肠癌病人预后的试剂盒，其特征在于，包括用于检测基因CD163L1、FAM13B、HDAC6、HPR、NR2C2、RAB12、SIRT2、TBC1D14、TLK2和TBC1D12的mRNA表达水平的试剂。
4.一种用于预测结直肠癌病人预后的系统，其特征在于，包括：数据输入模块，该模块用于将结直肠癌病人的自噬相关基因的mRNA表达值的结果输入模型计算模块，所述自噬相关基因包括基因CD163L1、FAM13B、HDAC6、HPR、NR2C2、RAB12、SIRT2、TBC1D14、TLK2和TBC1D12；所述mRNA表达值为通过Bioconductor的GEOquery程序包标准化处理后的mRNA表达水平数据；
模型计算模块，包括LASSOCox风险模型，所述模块用于根据获得的结直肠癌病人自噬相关基因的mRNA表达值以及LASSOCox风险模型计算病人风险分数；所述风险分数的计算公式为：risk score＝0.040346631×exp(CD163L1的mRNA表达值)+0.040346631×exp(FAM13B的mRNA表达值)+0.160103165×exp(HDAC6的mRNA表达值)+0.05063732×exp(HPR的mRNA表达值)-0.012205947×exp(NR2C2的mRNA表达值)-0.027104325×exp(RAB12的mRNA表达值)+0.055095935×exp(SIRT2的mRNA表达值)-0.084226324×exp(TBC1D14的mRNA表达值)-0.012613054×exp(TLK2的mRNA表达值)-0.001301898×exp(TBC1D12的mRNA表达值)，高风险组和低风险组的cut off值为-0.009；
结果输出模块，该模块用于根据结直肠癌病人风险分数来预测结直肠癌病人治疗后的预后风险；当结直肠癌病人风险分数≥-0.009时，结直肠癌病人为高风险；当结直肠癌病人风险分数＜-0.009时，结直肠癌病人为低风险。
5.如权利要求4所述的预后的系统，其特征在于，用于预测全阶段结直肠癌病人的预后。
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