[发明专利]核酸分子及其应用

说明书

本发明提供了一种核酸分子，所述核酸分子与SEQ ID NO:1相比，具有c.349GT突变，所述突变与地中海贫血密切相关。

技术领域

本发明涉及生物技术领域，具体地，涉及一种核酸分子及其应用，更具体地，涉及一种检测所述核酸分子的试剂在制备试剂盒中的用途，一种用于核酸分型的非诊断方法，一种基因分型方法，一种基因分型系统，一种探针，一种分离的多肽。

背景技术

地中海贫血(Thalassemia)，以下简称“地贫”，是由于珠蛋白基因发生缺陷，致使珠蛋白链合成减少或缺失，从而导致的一种遗传性溶血性疾病。地贫是世界上发病率最高的单基因隐性遗传病之一，是全球性的公共卫生问题，主要发生在中东，地中海国家，北非，印度次大陆和东南亚等地区。据估计全球约有3.5亿人携带地贫基因，每年约有30万-50万地贫儿出生。在我国，地贫人群主要分布在长江以南的广东、广西、海南、云南、贵州、四川、福建、江西、湖南等地区，其中两广、云贵以及海南是高发区。据2016年《中国地中海贫血蓝皮书》数据显示，我国南方地区地贫基因缺陷携带率为2.5％-20％，地贫基因携带者达3000万人，其中重型和中间型地贫患者约30万人。

地中海贫血以α和β地贫最为常见。其中α地贫在中国南方地区的发生率为4％-15％，在广东地区的发生率约为13％，在云南傣族地区的发生率约为12.0％，在湖南郴州发生率约为6％。到目前为止，全球已报道了300多种α地贫，大多数是由于HBA1和HBA2基因重要功能区域的缺失突变造成的，小部分为基因点突变。

因此，完善地中海贫血新基因型对于地中海贫血基因检测新技术的开发和完善至关重要。

发明内容

本申请是基于发明人对以下问题的发现和认识所作出的：

人类单基因遗传病往往与人类族群、地域等因素有关，随着“人类基因组计划”与“走出非洲”等计划的展开，对人类不同族群的迁徙、溯源与追踪的研究开始从不同的单基因遗传病作为切入点展开，而对于不同的单基因遗传病型别的扩展与发现，是上述研究的基础。

同时近年来，随着我国南方地区人群的地贫防控如火如荼的进行，发明人发现现有的地贫基因型别并不够全面，基于现有的地贫基因检测技术，很多地贫基因突变患者的型别不能准确检出甚至不能检出，从而造成地贫防控的疏漏，同时也造成地贫的基因治疗研究缺乏完善的信息支持，进而对针对地贫生物治疗新方法的研究产生误导。

本发明旨在至少在一定程度上解决相关技术中的技术问题之一。

为此，在本发明的第一方面，本发明提出了一种核酸分子。根据本发明的实施例，所述核酸分子与SEQ ID NO:1相比，具有c.349GT突变。根据本发明实施例的核酸分子，所述SEQ ID NO:1核苷酸序列与野生型HBA1基因编码区的核苷酸序列相同，所述SEQ ID NO:1核苷酸序列的第349位的碱基为鸟嘌呤，所述核酸分子的第349位的碱基为胸腺嘧啶，即所述核酸分子的第349位的碱基从鸟嘌呤突变为胸腺嘧啶。发明人发现所述突变与地中海贫血密切相关，形成了地中海贫血的新基因型。

在本发明的第二方面，本发明提出了一种检测上述核酸分子的试剂在制备试剂盒中的用途。根据本发明的实施例，所述试剂盒用于诊断地中海贫血。根据本发明实施例，所述试剂盒可以通过所述试剂判断上述核酸分子是否存在，进而判断所检测的生物样品是否属于地中海贫血新基因型。

在本发明的第三方面，本发明提出了一种用于核酸分型的非诊断方法。根据本发明的实施例，所述方法包括，获取受试者的基因组序列信息的至少一部分；将所述基因组序列信息的至少一部分与参考序列相比，以便确定所述基因组序列是否存在c.349GT突变，所述参考序列至少包括SEQ ID NO：1中第349位的位点信息。根据本发明实施例的核酸分型的非诊断方法可有效确定受试者基因组中是否含有上述位点突变，进而进行后续相关科学研究。