[发明专利]一种用于检测嗜水气单胞菌的RPA引物组、探针和试剂盒及其应用在审

专利信息
申请号: 202010548159.2 申请日: 2020-06-16
公开(公告)号: CN111793702A 公开(公告)日: 2020-10-20
发明(设计)人: 尹纪元;渠洋;王庆;李莹莹;王英英;任燕;石存斌 申请(专利权)人: 中国水产科学研究院珠江水产研究所
主分类号: C12Q1/689 分类号: C12Q1/689;C12Q1/04;C12Q1/6844;C12N15/11;C12R1/01
代理公司: 广州嘉权专利商标事务所有限公司 44205 代理人: 胡辉
地址: 510380 广*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 一种 用于 检测 水气 单胞菌 rpa 引物 探针 试剂盒 及其 应用
【权利要求书】:

1.一种用于检测嗜水气单胞菌的RPA引物组,其特征在于,所述RPA引物组的序列包括上游引物F和下游引物R;

所述上游引物F选自:

1F:5’-ATCAATCCTGTTACCGGAGAAATACCAA-3’;

2F:5’-GAAATACCAACCTTGTCAGCTCTGGATA-3’;

4F:5’-CAATCACAGCCAATATGTCGGTGAAGAC-3’;

5F:5’-CTACAAGGCTGACATCTCCTATCCCTATGA-3’;

6F:5’-AATACCTGGTGTTACCCGATCAATCCTGTT-3’;

7F:5’-CAAACATGGTGATGTGACCCAGTCTGAT-3’;

8F:5’-CTGTTACCGGAGAAATACCAACCTTGTC-3’;

9F:5’-CAAACATGGTGATGTGACCCAGTCTGAT-3’中的至少一个;

所述下游引物R选自:

1R:5’-AGATAGCTGGTTGGCTTGATAAAATTCG-3’;

2R:5’-GTCACGTCCATGTCTTCACCGACATATTG-3’;

3R:5’-GTCACGTCCATGTCTTCACCGACATATT-3’;

4R:5’-GTTGTACGCAAAATTGCTGACCTTGATG-3’;

5R:5’-TATAGCGCTTGTCCCACTGGTAACGAAT-3’;

6R:5’-TTGATAAAATTCGCGCTGTCGTGTACCAGT-3’;

7R:5’-CTTGAACTTGTTCTTGGTGGTCACCTTCTC-3’;

8R:5’-AGGCATAACCGAGATAATGCGCCAGATAG-3’;

9R:5’-CTTGAACTTGTTCTTGGTGGTCACCTTCTC-3’中的至少一个。

2.根据权利要求1所述的RPA引物组,其特征在于,所述RPA引物组的序列为:

上游引物1F:5’-ATCAATCCTGTTACCGGAGAAATACCAA-3’;

下游引物2R:5’-GTCACGTCCATGTCTTCACCGACATATTG-3’。

3.一种用于检测嗜水气单胞菌的RPA探针,其特征在于,所述RPA探针序列为:5'-CAGTGGCGACTGGTACACGACAGCGCGAAT(荧光基团)T(THF)A(猝灭基团)CAAGCCAACCAGCTATC(修饰基团)-3'。

4.根据权利要求3所述的RPA探针,其特征在于,所述荧光基团包括FAM;所述猝灭基团包括BHQ;所述THF代表四氢呋喃分子;所述修饰基团包括C3-sapcer。

5.一种用于检测嗜水气单胞菌的RPA检测试剂盒,其特征在于,所述RPA检测试剂盒包括权利要求1-2任一所述的引物组、权利要求3-4任一所述的探针、再水化缓冲液、醋酸镁溶液、重组酶。

6.根据权利要求5所述的RPA检测试剂盒,其特征在于,所述RPA检测试剂盒还包括嗜水气单胞菌阳性对照。

7.权利要求5-6任一所述的RPA检测试剂盒在嗜水气单胞菌检测中的应用。

8.根据权利要求8所述的应用,其特征在于,所述嗜水气单胞菌的检测步骤包括:

采集样品,提取核苷酸;

将提取的核苷酸与权利要求1-2任一所述的引物组、再水化缓冲液、重组酶混合;

加入醋酸镁溶液,进行RPA扩增;

对RPA扩增产物进行荧光检测;

若检测到荧光,则样品中含有嗜水气单胞菌,若未检测到荧光,则不含有嗜水气单胞菌。

9.根据权利要求8所述的应用,其特征在于,所述RPA扩增体系为:

10.根据权利要求8所述的应用,其特征在于,所述RPA扩增条件为:37-39℃扩增18-22分钟。

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