[发明专利]一种DNA可逆保护和分离的方法有效
| 申请号: | 202010528082.2 | 申请日: | 2020-06-11 |
| 公开(公告)号: | CN111690718B | 公开(公告)日: | 2023-04-14 |
| 发明(设计)人: | 曹博;张清华;刘莉莉;季红 | 申请(专利权)人: | 曲阜师范大学 |
| 主分类号: | C12Q1/6806 | 分类号: | C12Q1/6806;C12Q1/6869 |
| 代理公司: | 深圳泛航知识产权代理事务所(普通合伙) 44867 | 代理人: | 邓爱军 |
| 地址: | 273165 山*** | 国省代码: | 山东;37 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 dna 可逆 保护 分离 方法 | ||
1.一种DNA可逆保护和分离的方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)将DNA分子通过酶处理,获得含5’磷酸化DNA的样品;
(2)将含5’磷酸化DNA的样品解旋获得单链DNA;
(3)将单链DNA进行5’腺苷化标记,获得含5’腺苷化DNA的样品;
(4)使用腺苷化敏感的5’→3’核酸外切酶对步骤(3)获得的样品进行消化,去除未被5’腺苷化修饰的单链DNA,纯化后获得腺苷化修饰的目标DNA分子;
(5)对腺苷化修饰的目标DNA分子进行去腺苷化处理,即可获得目标DNA分子;
步骤(1)中,所述酶为能够将含有5’羟基的DNA转化为5’磷酸化DNA的酶;所述酶选自T4多聚核苷酸激酶;
步骤(3)中,所述5’腺苷化标记为通过酶修饰DNA的5’末端;所述酶选自T4 DNALigase;
步骤(4)中,所述腺苷化敏感的5’→3’核酸外切酶选自T5核酸外切酶。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤(1)中,所述DNA分子为双链或单链;所述DNA分子为单链时,省略步骤(2)。
3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤(2)中,所述解旋过程为热变性。
4.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤(1)(3)(5)分别还包括对反应后样品的纯化处理过程。
5.一种采用如权利要求1-4任一所述的方法检测DNA分子损伤和修饰位点的非诊断目的的方法,其特征在于,包括以下步骤:
(i)提取DNA分子、破碎、去磷酸化,获得样品;
(ii)按照上述方法获得目标DNA分子;
(iii)对目标DNA分子进行测序并分析比对,即可获得损伤或修饰位点。
6.根据权利要求5所述的方法,其特征在于,步骤(i)中,所述破碎的步骤为超声破碎。
7.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,所述破碎的大小为200-500bp。
8.根据权利要求5所述的方法,其特征在于,步骤(iii)中,所述测序选自Sanger测序或Illumina测序。
9.根据权利要求8所述的方法,其特征在于,步骤(iii)中,测序为Illumina测序时还包括以下步骤:将去目标DNA分子转化为双链DNA后,再经PCR扩增,产物用于Illumina测序。
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