[发明专利]一种DNA可逆保护和分离的方法有效

专利信息
申请号: 202010528082.2 申请日: 2020-06-11
公开(公告)号: CN111690718B 公开(公告)日: 2023-04-14
发明(设计)人: 曹博;张清华;刘莉莉;季红 申请(专利权)人: 曲阜师范大学
主分类号: C12Q1/6806 分类号: C12Q1/6806;C12Q1/6869
代理公司: 深圳泛航知识产权代理事务所(普通合伙) 44867 代理人: 邓爱军
地址: 273165 山*** 国省代码: 山东;37
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摘要:
搜索关键词: 一种 dna 可逆 保护 分离 方法
【权利要求书】:

1.一种DNA可逆保护和分离的方法,其特征在于,包括以下步骤:

(1)将DNA分子通过酶处理,获得含5’磷酸化DNA的样品;

(2)将含5’磷酸化DNA的样品解旋获得单链DNA;

(3)将单链DNA进行5’腺苷化标记,获得含5’腺苷化DNA的样品;

(4)使用腺苷化敏感的5’→3’核酸外切酶对步骤(3)获得的样品进行消化,去除未被5’腺苷化修饰的单链DNA,纯化后获得腺苷化修饰的目标DNA分子;

(5)对腺苷化修饰的目标DNA分子进行去腺苷化处理,即可获得目标DNA分子;

步骤(1)中,所述酶为能够将含有5’羟基的DNA转化为5’磷酸化DNA的酶;所述酶选自T4多聚核苷酸激酶;

步骤(3)中,所述5’腺苷化标记为通过酶修饰DNA的5’末端;所述酶选自T4 DNALigase;

步骤(4)中,所述腺苷化敏感的5’→3’核酸外切酶选自T5核酸外切酶。

2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤(1)中,所述DNA分子为双链或单链;所述DNA分子为单链时,省略步骤(2)。

3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤(2)中,所述解旋过程为热变性。

4.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤(1)(3)(5)分别还包括对反应后样品的纯化处理过程。

5.一种采用如权利要求1-4任一所述的方法检测DNA分子损伤和修饰位点的非诊断目的的方法,其特征在于,包括以下步骤:

(i)提取DNA分子、破碎、去磷酸化,获得样品;

(ii)按照上述方法获得目标DNA分子;

(iii)对目标DNA分子进行测序并分析比对,即可获得损伤或修饰位点。

6.根据权利要求5所述的方法,其特征在于,步骤(i)中,所述破碎的步骤为超声破碎。

7.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,所述破碎的大小为200-500bp。

8.根据权利要求5所述的方法,其特征在于,步骤(iii)中,所述测序选自Sanger测序或Illumina测序。

9.根据权利要求8所述的方法,其特征在于,步骤(iii)中,测序为Illumina测序时还包括以下步骤:将去目标DNA分子转化为双链DNA后,再经PCR扩增,产物用于Illumina测序。

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