[发明专利]一种QPCR实时荧光数据定量分析的方法有效
| 申请号: | 202010477642.6 | 申请日: | 2020-05-29 |
| 公开(公告)号: | CN111593098B | 公开(公告)日: | 2021-09-21 |
| 发明(设计)人: | 王寄竹;石瑞 | 申请(专利权)人: | 成都瀚辰光翼科技有限责任公司;成都瀚辰光翼生物工程有限公司 |
| 主分类号: | C12Q1/686 | 分类号: | C12Q1/686 |
| 代理公司: | 北京天奇智新知识产权代理有限公司 11340 | 代理人: | 叶明博 |
| 地址: | 610000 四川省成都市高新区*** | 国省代码: | 四川;51 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 qpcr 实时 荧光 数据 定量分析 方法 | ||
1.一种QPCR实时荧光数据定量分析的方法,其特征在于,包括以下步骤:
S1、采集每个样品在PCR反应过程中多个循环的荧光数据,得到每个样品的循环数—荧光亮度值的曲线A;
S2、处理S1中的所有荧光数据,使每个样品的曲线A变得平滑得到曲线B,具体包括:
S21、确定平滑窗口,平滑窗口为3或5;
S22、第一个循环开始取滑动窗口数量的点数,使用平均值代替对应的采集值,使得每个样品的曲线A变成平滑的曲线B;
S3、获取每个样品的曲线B的基线并进行基线校准,具体包括:
S31、对每个样品的曲线B中的数据连续两点做差分,标记差分值最大的点m;
S32、从m点往前计算该点和前一的差值;
S33、若差值大于0.1则m点往前移动,直到第一个点;
S34、停止后的点为m为基线终点,标识第一个循环到第m个循环为曲线B的基线期;
S35、取第1个点到第m个点为基线数据集做线性拟合,计算出基线解析式y=ax+b
S36、曲线B上每一个点纵坐标减去对应校准后基线的纵坐标求得deltaRn。
S4、根据校准后的基线得到每个样品的Ct值。
2.根据权利要求1所述的一种QPCR实时荧光数据定量分析的方法,其特征在于,在S4中包括:
S41、取每条线校准荧光值deltaRn和对应循环数作为曲线新的坐标对,计算基线期所有点的10倍标准差作为阈值;
S42、取所有样品的阈值的最小值作为自动阈值;
S43、根据自动阈值与每个样品校准后的基线计算Ct值。
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