[发明专利]一种寡核苷酸引物、试剂盒及应用在审
申请号: | 202010472839.0 | 申请日: | 2020-05-29 |
公开(公告)号: | CN111534569A | 公开(公告)日: | 2020-08-14 |
发明(设计)人: | 刘文干;蒋艳鑫;韦玉军 | 申请(专利权)人: | 安徽安龙基因科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6806 | 分类号: | C12Q1/6806;C12N15/11 |
代理公司: | 安徽知问律师事务所 34134 | 代理人: | 代群群 |
地址: | 243000 安徽省合肥市庐阳*** | 国省代码: | 安徽;34 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 寡核苷酸 引物 试剂盒 应用 | ||
1.一种寡核苷酸引物,包括具有3’端和5’端的3p臂、发夹环以及具有3’端和5’端的5p臂,其特征在于:所述5p臂不与DNA模板结合,所述3p臂与DNA模板杂交,同时提供聚合酶延伸的序列特异性;所述发夹环位于5p臂和3p臂之间,所述发夹环包括与DNA模板杂交的单链环与双链茎,所述寡核苷酸引物与DNA模板结合时,所述单链环与DNA模板之间的结合能大于双链茎之间的结合能。
2.根据权利要求1所述的一种寡核苷酸引物,其特征在于:所述3p臂是从5到15个核苷酸长度;所述5p臂包括UMI序列和通用锚定序列,所述UMI序列是5~10个随机核苷酸N,所述N是A、T、C或G中的任一个。
3.根据权利要求2所述的一种寡核苷酸引物,其特征在于:所述3p臂是从10到15个核苷酸长度;所述UMI序列是7~8个随机核苷酸N,所述N是A、T、C或G中的任一个。
4.一种试剂盒,其特征在于:包括权利要求1~3任一项所述的一种寡核苷酸引物。
5.根据权利要求4所述的一种试剂盒,其特征在于:所述试剂盒还包括利用所述寡核苷酸引物进行多重PCR反应的试剂。
6.根据权利要求5所述的一种试剂盒,其特征在于:所述试剂包括缓冲液、DNA聚合酶和dNTP的混合物。
7.一种利用权利要求4-6任一项所述的试剂盒扩增两个或更多不同靶核酸的方法,其特征在于:包括以下步骤:
提供至少一组特异性引物对,所述特异性引物对包括第一特异性引物和第二特异性引物,且专为特定靶核酸设计;提供至少一组通用引物,所述通用引物包括第一通用引物和第二通用引物;提供一组靶核酸;所述第一特异性引物和第二特异性引物为所述寡核苷酸引物;
进行2~5轮第一热循环过程,该过程包括变性步骤、退火步骤和延伸步骤;
进行10~30轮第二热循环过程,该过程包括变性步骤、退火步骤和延伸步骤。
8.根据权利要求7所述的扩增两个或更多不同的靶核酸的方法,其特征在于:所述第一特异性引物和第二特异性引物终浓度为2nM~100nM;所述第一通用引物和第二通用引物终浓度为400nM~1μM。
9.根据权利要求7所述的扩增两个或更多不同的靶核酸的方法,其特征在于:所述第一特异性引物和第二特异性引物终浓度为5nM~50nM;所述第一通用引物和第二通用引物终浓度为500nM~800nM。
10.根据权利要求7所述的扩增两个或更多不同的靶核酸的方法,其特征在于:第一热循环的变性步骤温度为95℃,时间为15s,退火步骤温度为54℃,时间为30s~5min,延伸步骤温度为72℃,时间为30s;第二热循环的变性步骤温度为95℃,时间为15s,退火步骤温度为60℃,时间为30s,延伸步骤温度为72℃,时间为30s。
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