[发明专利]一种寡核苷酸引物、试剂盒及应用在审

专利信息
申请号: 202010472839.0 申请日: 2020-05-29
公开(公告)号: CN111534569A 公开(公告)日: 2020-08-14
发明(设计)人: 刘文干;蒋艳鑫;韦玉军 申请(专利权)人: 安徽安龙基因科技有限公司
主分类号: C12Q1/6806 分类号: C12Q1/6806;C12N15/11
代理公司: 安徽知问律师事务所 34134 代理人: 代群群
地址: 243000 安徽省合肥市庐阳*** 国省代码: 安徽;34
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摘要:
搜索关键词: 一种 寡核苷酸 引物 试剂盒 应用
【权利要求书】:

1.一种寡核苷酸引物,包括具有3’端和5’端的3p臂、发夹环以及具有3’端和5’端的5p臂,其特征在于:所述5p臂不与DNA模板结合,所述3p臂与DNA模板杂交,同时提供聚合酶延伸的序列特异性;所述发夹环位于5p臂和3p臂之间,所述发夹环包括与DNA模板杂交的单链环与双链茎,所述寡核苷酸引物与DNA模板结合时,所述单链环与DNA模板之间的结合能大于双链茎之间的结合能。

2.根据权利要求1所述的一种寡核苷酸引物,其特征在于:所述3p臂是从5到15个核苷酸长度;所述5p臂包括UMI序列和通用锚定序列,所述UMI序列是5~10个随机核苷酸N,所述N是A、T、C或G中的任一个。

3.根据权利要求2所述的一种寡核苷酸引物,其特征在于:所述3p臂是从10到15个核苷酸长度;所述UMI序列是7~8个随机核苷酸N,所述N是A、T、C或G中的任一个。

4.一种试剂盒,其特征在于:包括权利要求1~3任一项所述的一种寡核苷酸引物。

5.根据权利要求4所述的一种试剂盒,其特征在于:所述试剂盒还包括利用所述寡核苷酸引物进行多重PCR反应的试剂。

6.根据权利要求5所述的一种试剂盒,其特征在于:所述试剂包括缓冲液、DNA聚合酶和dNTP的混合物。

7.一种利用权利要求4-6任一项所述的试剂盒扩增两个或更多不同靶核酸的方法,其特征在于:包括以下步骤:

提供至少一组特异性引物对,所述特异性引物对包括第一特异性引物和第二特异性引物,且专为特定靶核酸设计;提供至少一组通用引物,所述通用引物包括第一通用引物和第二通用引物;提供一组靶核酸;所述第一特异性引物和第二特异性引物为所述寡核苷酸引物;

进行2~5轮第一热循环过程,该过程包括变性步骤、退火步骤和延伸步骤;

进行10~30轮第二热循环过程,该过程包括变性步骤、退火步骤和延伸步骤。

8.根据权利要求7所述的扩增两个或更多不同的靶核酸的方法,其特征在于:所述第一特异性引物和第二特异性引物终浓度为2nM~100nM;所述第一通用引物和第二通用引物终浓度为400nM~1μM。

9.根据权利要求7所述的扩增两个或更多不同的靶核酸的方法,其特征在于:所述第一特异性引物和第二特异性引物终浓度为5nM~50nM;所述第一通用引物和第二通用引物终浓度为500nM~800nM。

10.根据权利要求7所述的扩增两个或更多不同的靶核酸的方法,其特征在于:第一热循环的变性步骤温度为95℃,时间为15s,退火步骤温度为54℃,时间为30s~5min,延伸步骤温度为72℃,时间为30s;第二热循环的变性步骤温度为95℃,时间为15s,退火步骤温度为60℃,时间为30s,延伸步骤温度为72℃,时间为30s。

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