[发明专利]一种简单高效马铃薯多R基因聚合辅助育种方法在审
申请号: | 202010442969.X | 申请日: | 2020-05-22 |
公开(公告)号: | CN111778345A | 公开(公告)日: | 2020-10-16 |
发明(设计)人: | 刘勋;刘程;王世尧;史伟玲;蒋锐;赵勇;唐道彬;张凯;吕典秋;王季春 | 申请(专利权)人: | 西南大学 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/686;C12N15/11 |
代理公司: | 厦门原创专利事务所(普通合伙) 35101 | 代理人: | 梁英 |
地址: | 400715*** | 国省代码: | 重庆;50 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 简单 高效 马铃薯 基因 聚合 辅助 育种 方法 | ||
1.马铃薯晚疫病抗性以及PVX和PVY病毒病抗性筛选引物序列组,其特征在于,所述引物序列组包括:(1)RB标记引物如序列表SEQ ID NO:3和SEQ ID NO:4所示;(2)R8标记引物如序列表SEQ ID NO:5和SEQ ID NO:6所示;(3)Rx1标记引物如序列表SEQ ID NO:7和SEQID NO:8所示。;(4)Ryadg标记引物如序列表SEQ ID NO:9和SEQ ID NO:10所示;(5)GBSS标记引物如序列表SEQ ID NO:11和SEQ ID NO:12所示。
2.如权利要求1所述的引物序列组在多重PCR体系多基因聚合育种辅助选择中的应用。
3.马铃薯多R基因聚合辅助育种方法,其特征在于,采用R8、RB、Rx1和Ryadg的多重PCR检测予以实现,具体如下:(1)材料选择与DNA提取;(2)马铃薯资源材料Rx1和Ryadg标记检测;(3)引物设计及单R基因PCR检测;(4)PCR产物的克隆与序列分析;(5)多重PCR反应体系的建立与优化。
4.根据权利要求3所述的马铃薯多R基因聚合辅助育种方法,其特征在于,步骤(1)材料选择与DNA提取,具体为:采集218份马铃薯资源材料DNA用于Rx1和Ryadg单标记检测,出苗4周后取1-2片幼嫩叶片用于DNA的提取。
5.根据权利要求3所述的马铃薯多R基因聚合辅助育种方法,其特征在于,步骤(2)马铃薯资源材料Rx1和Ryadg标记检测,具体为:在218份马铃薯资源中检测晚疫病小种特异的R1、R2 family和R3a/b以及持久抗性基因RB和R8标记的组成。
6.根据权利要求3所述的马铃薯多R基因聚合辅助育种方法,其特征在于,步骤(3)引物设计及单R基因PCR检测,具体为:通过查询GenBank中马铃薯晚疫病持久抗性基因R8和RB基因序列,设计其特异引物,同时设计了马铃薯GBSS基因特异引物,以此监控PCR体系成功扩增。
7.根据权利要求3所述的马铃薯多R基因聚合辅助育种方法,其特征在于,步骤(4)PCR产物的克隆与序列分析,具体为:将RB和R8的PCR产物进行回收,克隆并测序,进一步验证扩增产物与对应的参考序列是否具有一致性,确定所用引物对的特异性,并对所产生的结果进行数据分析,验证扩增产物与对应的参考序列的一致性。
8.根据权利要求3所述的马铃薯多R基因聚合辅助育种方法,其特征在于,步骤(5)多重PCR反应体系的建立与优化,具体为:将分别含有Rx1和RB以及Ryadg和R8基因的两个马铃薯基因型等量DNA混合,作为多重PCR反应的模板,建立多重PCR反应体系,之后改变PCR体系中的延伸温度及相应R8引物浓度条件因素进行多重PCR反应体系的优化。
9.马铃薯晚疫病抗性以及PVX和PVY病毒病抗性检测多重PCR反应体系,其特征在于,包括:(1)最佳引物浓度:GBSS、Rx、Ryadg和RB标记引物浓度0.5μmolL-1,R8引物浓度1.00μmolL-1;(2)最佳延伸温度:64℃;(3)最佳退火温度:55℃。
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