[发明专利]大肠杆菌及6种致病型基因的快速检测方法及试剂盒在审

专利信息
申请号: 202010436029.X 申请日: 2020-05-21
公开(公告)号: CN111518934A 公开(公告)日: 2020-08-11
发明(设计)人: 王保宁;索朗斯珠;贡嘎;罗润波;周永君 申请(专利权)人: 四川大学;西藏农牧学院;成都乐助生物科技有限公司
主分类号: C12Q1/689 分类号: C12Q1/689;C12Q1/6844;C12Q1/10;C12R1/19
代理公司: 成都行之专利代理事务所(普通合伙) 51220 代理人: 唐邦英
地址: 610000 四*** 国省代码: 四川;51
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摘要:
搜索关键词: 大肠杆菌 致病 基因 快速 检测 方法 试剂盒
【权利要求书】:

1.大肠杆菌及6种致病型基因的快速检测方法,其特征在于,包括以下步骤:

步骤1)、13套引物设计:分别下载GenBank中发表的大肠杆菌基因aggR、ast A、bfpB、escV、ipa H、Ita、Itb、pic、stp、sth、stx1A、stx2A和uidA,运用引物在线设计软件PrimerExplorerV4分别设计13套LAMP检测引物;

步骤2)、提取细菌的DNA模板;

步骤3)、将引物、DNA模板与检测试剂制成LAMP反应体系,利用LAMP反应体系对目标序列进行LAMP扩增,进行检测,通过颜色变化判定目标序列的类型。

2.根据权利要求1所述的大肠杆菌及6种致病型基因的快速检测方法,其特征在于,所述13套LAMP检测引物,分别为aggR、ast A、bfpB、escV、ipa H、Ita、Itb、pic、stp、sth、stx1A、stx2A和uidA特征基因检测引物,每套均包括外引物F3和B3,内引物FIP和BIP,成环引物LoopF和LoopB,其中,所述aggR的外引物F31和B31的碱基序列分别如SEQ ID No.1、SEQID No.2所示,所述aggR的内引物FIP1和BIP1的碱基序列分别如SEQ ID No.3、SEQ ID No.4所示,所述aggR的成环引物LoopF1和LoopB1的碱基序列分别如SEQ ID No.5、SEQ ID No.6所示;所述ast A的外引物F32和B32的碱基序列分别如SEQ ID No.7、SEQ ID No.8所示,所述ast A的内引物FIP2和BIP2的碱基序列分别如SEQ ID No.9、SEQ ID No.10所示,所述astA的成环引物LoopF2和LoopB2的碱基序列分别如SEQ ID No.11、SEQ ID No.12所示;所述bfpB的外引物F33和B33的碱基序列分别如SEQ ID No.13、SEQ ID No.14所示,所述bfpB的内引物FIP3和BIP3的碱基序列分别如SEQ ID No.15、SEQ ID No.16所示,所述bfpB的成环引物LoopF3和LoopB3的碱基序列分别如SEQ ID No.17、SEQ ID No.18所示;所述escV的外引物F34和B34的碱基序列分别如SEQ ID No.19、SEQ ID No.20所示,所述escV的内引物FIP4和BIP4的碱基序列分别如SEQ ID No.21、SEQ ID No.22所示,所述escV的成环引物LoopF4和LoopB4的碱基序列分别如SEQ ID No.23、SEQ ID No.24所示;所述ipa H的外引物F35和B35的碱基序列分别如SEQ ID No.25、SEQ ID No.26所示,所述ipa H的内引物FIP5和BIP5的碱基序列分别如SEQ ID No.27、SEQ ID No.28所示,所述ipa H的成环引物LoopF5和LoopB5的碱基序列分别如SEQ ID No.29、SEQ ID No.30所示;所述Ita的外引物F36和B36的碱基序列分别如SEQ ID No.31、SEQ ID No.32所示,所述Ita的内引物FIP6和BIP6的碱基序列分别如SEQ ID No.33、SEQ ID No.34所示,所述Ita的成环引物LoopF6和LoopB6的碱基序列分别如SEQ ID No.35、SEQ ID No.36所示;所述Itb的外引物F37和B37的碱基序列分别如SEQ ID No.37、SEQ ID No.38所示,所述Itb的内引物FIP7和BIP7的碱基序列分别如SEQ IDNo.39、SEQ ID No.40所示,所述Itb的成环引物LoopF7和LoopB7的碱基序列分别如SEQ IDNo.41、SEQ ID No.42所示;所述pic的外引物F38和B38的碱基序列分别如SEQ ID No.43、SEQ ID No.44所示,所述pic的内引物FIP8和BIP8的碱基序列分别如SEQ ID No.45、SEQ IDNo.46所示,所述pic的成环引物Loop8和LoopB8的碱基序列分别如SEQ ID No.47、SEQ IDNo.48所示;所述stp的外引物F39和B39的碱基序列分别如SEQ ID No.49、SEQ ID No.50所示,所述stp的内引物FIP9和BIP9的碱基序列分别如SEQ ID No.51、SEQ ID No.52所示,所述stp的成环引物LoopF9和LoopB9的碱基序列分别如SEQ ID No.53、SEQ ID No.54所示;所述sth的外引物F310和B310的碱基序列分别如SEQ ID No.55、SEQ ID No.56所示,所述sth的内引物FIP10和BIP10的碱基序列分别如SEQ ID No.57、SEQ ID No.58所示,所述sth的成环引物LoopF10和LoopB10的碱基序列分别如SEQ ID No.59、SEQ ID No.60所示;所述stx1A的外引物F311和B311的碱基序列分别如SEQ ID No.61、SEQ ID No.62所示,所述stx1A的内引物FIP11和BIP11的碱基序列分别如SEQ ID No.63、SEQ ID No.64所示,所述stx1A的成环引物LoopF11和LoopB11的碱基序列分别如SEQ ID No.65、SEQ ID No.66所示;所述stx2A的外引物F312和B312的碱基序列分别如SEQ ID No.67、SEQ ID No.68所示,所述stx2A的内引物FIP12和BIP12的碱基序列分别如SEQ ID No.69、SEQ ID No.70所示,所述stx2A的成环引物LoopF12和LoopB12的碱基序列分别如SEQ ID No.71、SEQ ID No.72所示;所述uidA的外引物F313和B313的碱基序列分别如SEQ ID No.73、SEQ ID No.74所示,所述uidA的内引物FI13和BIP13的碱基序列分别如SEQ ID No.75、SEQ ID No.76所示,所述uidA的成环引物LoopF13和LoopB13的碱基序列分别如SEQ ID No.77、SEQ ID No.78所示。

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