[发明专利]一种基于UPLC/HRMS的代谢组学相对定量分析方法有效
| 申请号: | 202010429597.7 | 申请日: | 2020-05-20 |
| 公开(公告)号: | CN111579665B | 公开(公告)日: | 2021-11-05 |
| 发明(设计)人: | 徐英;任建洪;谢桂纲;戴贞丽;顾梦南;谷从顺 | 申请(专利权)人: | 苏州帕诺米克生物医药科技有限公司 |
| 主分类号: | G01N30/02 | 分类号: | G01N30/02;G01N30/86 |
| 代理公司: | 北京林达刘知识产权代理事务所(普通合伙) 11277 | 代理人: | 刘新宇;李茂家 |
| 地址: | 215000 江苏省苏州市苏州工*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 基于 uplc hrms 代谢 相对 定量分析 方法 | ||
1.一种基于UPLC/HRMS的代谢组学相对定量分析方法,其包括下列步骤:
1)基于多种同位素内标,配制同位素内标混合溶液;
2)基于代谢组学样本,确定与之匹配的相对定量校正样本,并利用所述相对定量校正样本和步骤1)中所述同位素内标混合溶液,配制一系列浓度梯度的相对定量标准曲线校正溶液;
3)利用步骤2)中所述代谢组学样本和步骤1)中所述同位素内标混合溶液,配制代谢组学样本溶液;
4)利用UPLC/HRMS平台,采集步骤3)中所述代谢组学样本溶液和步骤2)中所述一系列浓度梯度的相对定量标准曲线校正溶液的原始质谱数据;
5)基于步骤4)中所述原始质谱数据,获得一级质谱转置数据和二级质谱转置数据,并基于所述一级质谱转置数据,获得包括多种一级变量信息的解卷积结果;
6)结合步骤5)中所述一级质谱转置数据的解卷积结果与所述二级质谱转置数据,并参比单个同位素内标的一级变量信息和二级变量信息,鉴定同位素内标,并选择用于线性拟合的最优同位素内标;
7)利用步骤2)中所述一系列浓度梯度的相对定量标准曲线校正溶液的浓度及其在步骤5)中获得的一级变量信息进行线性拟合,获得线性方程;
8)基于步骤7)中所述线性方程,得到步骤3)中所述代谢组学样本溶液的相对定量结果,并完成主成分分析和一级变量信息的差异代谢物分析;和
9)结合步骤5)中所述一级质谱转置数据的解卷积结果与所述二级质谱转置数据,完成代谢物鉴定和差异代谢物鉴定;
其中,步骤6)中所述最优同位素内标的选择步骤为:将相对定量校正样本中一级变量峰面积与同位素内标混合溶液中每种内标的一级变量峰面积进行比值,再与相对定量校正样本浓度线性拟合后获得相关系数r,选择r值最大以及相对定量校正样本中一级变量的浓度范围介于0.05P~5P的同位素内标。
2.根据权利要求1所述的代谢组学相对定量分析方法,其特征在于:
步骤1)中所述同位素内标混合溶液通过下列方法制得:先取适量的多种同位素内标,分别加入溶剂,配制成一定浓度的单一同位素内标母液,再分别取适量的各种单一同位素内标母液,混合并加入溶剂,得到同位素内标混合溶液。
3.根据权利要求1所述的代谢组学相对定量分析方法,其特征在于:
步骤2)中所述代谢组学样本为血清或血浆样本,所述相对定量校正样本为NIST血清。
4.根据权利要求1所述的代谢组学相对定量分析方法,其特征在于:
步骤2)中所述一系列浓度梯度的相对定量标准曲线校正溶液通过下列方法制得:取一系列体积的相对定量校正样本,分别加入同位素内标和蛋白沉淀试剂,混合,离心,取上清液,浓缩,向残渣中加入复溶溶剂,混合,取上清液,得到一系列浓度梯度的相对定量标准曲线校正溶液。
5.根据权利要求1所述的代谢组学相对定量分析方法,其特征在于:
步骤3)中所述代谢组学样本溶液通过下列方法制得:取代谢组学样本,分别加入同位素内标和蛋白沉淀试剂,混合,离心,取上清液,浓缩,向残渣中加入复溶溶剂,混合,取上清液,得到代谢组学样本溶液。
6.根据权利要求1所述的代谢组学相对定量分析方法,其特征在于:
步骤5)中所述一级质谱转置数据和二级质谱转置数据通过数据转置的方式获得,所述数据转置通过开源的ProteoWizard软件来完成。
7.根据权利要求1所述的代谢组学相对定量分析方法,其特征在于:
步骤5)中所述解卷积结果通过解卷积的方式获得,所述解卷积通过BioDeep代谢组学云分析平台或开源R软件来完成。
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