[发明专利]一种糖蛋白N-糖组图谱模型的建立方法及应用在审
| 申请号: | 202010396573.6 | 申请日: | 2020-05-12 |
| 公开(公告)号: | CN111477268A | 公开(公告)日: | 2020-07-31 |
| 发明(设计)人: | 彭勇;高春芳;郝立颖;孙晓琴 | 申请(专利权)人: | 北京世纪沃德生物科技有限公司;王孜怡 |
| 主分类号: | G16B5/00 | 分类号: | G16B5/00;G16B40/00;G16B50/10 |
| 代理公司: | 北京奇眸智达知识产权代理有限公司 11861 | 代理人: | 樊进茹 |
| 地址: | 102200 北京市昌平区中关*** | 国省代码: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 糖蛋白 图谱 模型 建立 方法 应用 | ||
1.一种糖蛋白N-糖组图谱模型的建立方法,其特征在于,包括如下步骤:
(1)检测待测样品中N-糖苷键相连的糖链以获得特定糖型及丰度信息的N-糖指纹图谱;
(2)基于N-糖指纹图谱,选择Peak1、Peak2及Peak8-建立模型FIB-G=0.100×P1+0.612×P2-0.445×P8+0.015;
其中,P1是N-糖指纹图谱中Peak1的丰度,P2是N-糖指纹图谱中Peak2的丰度,P8是N-糖指纹图谱中Peak8的丰度。
2.如权利要求1所述的建立方法,其特征在于,所述步骤(1)中使用DNA测序仪进行N-糖链检测,采用GeneMapper软件分析特定糖型及其丰度信息,并通过SPSS软件对数据进行统计学分析。
3.如权利要求1所述的建立方法,其特征在于,所述待测样品为离体血清。
4.如权利要求1所述的建立方法,其特征在于,还包括释放所述待测样品中的糖链,荧光标记所述待测样品中的N-糖链,以及去除所述待测样品中的唾液酸。
5.如权利要求1所述的建立方法,其特征在于,当FIB-G大于-0.445时,则为重度肝纤维化;当FIB-G大于-0.22时,则为肝硬化;当FIB-G小于-0.22时,则为非肝硬化。
6.组合物在制备肝硬化和/或肝纤维化试剂中的应用,所述组合物包括NGA2F、NGA2FB和NA3。
7.如权利要求6所述的应用,其特征在于,所述组合物通过模型FIB-G=0.100×P1+0.612×P2-0.445×P8+0.015的计算结果来诊断肝硬化和/或肝纤维化的分期,
其中,P1是NGA2F在N-糖指纹图谱中的丰度,P2是NGA2FB在N-糖指纹图谱中的丰度,P8是NA3在N-糖指纹图谱中的丰度。
8.如权利要求6所述的应用,其特征在于,当FIB-G大于-0.445时,则为重度肝纤维化;当FIB-G大于-0.22时,则为肝硬化;当FIB-G小于-0.22时,则为非肝硬化。
9.如权利要求6所述的应用,其特征在于,所述模型判断肝纤维化时,最佳截断值(cut-off值)为-0.445。
10.一种模型在制备肝硬化和/或肝纤维化试剂中的应用,所述模型为FIB-G=0.100×P1+0.612×P2-0.445×P8+0.015,其中,P1是NGA2F在N-糖指纹图谱中的丰度,P2是NGA2FB在N-糖指纹图谱中的丰度,P8是NA3在N-糖指纹图谱中的丰度。
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